New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2092875 = | 37 (0.610) | 6 (0.100) | 5/256 | NT | 11.9% | coding (365/795 nt) | ygiD | 4,5‑DOPA‑dioxygenase |
? | NC_002947 | 2092987 = | 53 (0.910) | coding (253/795 nt) | ygiD | 4,5‑DOPA‑dioxygenase |
GCTGCCCGAACCTATTAGCAGTACATCCTCGGCACGCAACCCCGCCAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAGGGCTGGTGGGAAGCCGTAG > NC_002947/2092727‑2093021 | gggttggccaacgcgctgccccggccgaaagcgatcgtggtggtgtcggcacactgggaaagccgcgagctgctggtcaccggcagcgcacagcccgaaacctggcatgacttctacggcttcccaccagccctgtatgcggtgcagta > 1:184451‑M1/149‑149 (MQ=255) ctgcCCGAACCTATTAGCAGTACATCCTCGGCACGCAACCCCGCCAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCAC‑GGAATGCGCGCATCCGGGGACATCAGCGACAGCCGcccc > 6:207015/1‑149 (MQ=255) gCAGTACATCCTCGGCACGCAACCCCGCCAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTc > 5:152856/1‑148 (MQ=255) gTACATCCTCGGCACGCAACCCCGCCAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAAt < 6:152856/149‑1 (MQ=255) gCACGCAACCCCGCCAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCAt < 7:229352/149‑1 (MQ=255) aaCCCCGCCAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAg > 4:47595/1‑149 (MQ=255) ccGCCAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAAt < 5:265154/128‑1 (MQ=255) ccGCCAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAAt > 6:265154/1‑128 (MQ=255) ccGCCAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCcgc > 5:17539/1‑149 (MQ=255) gCCAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCcgcgc < 8:58793/149‑1 (MQ=255) cAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCgg < 1:40868/149‑1 (MQ=255) aGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCggg < 3:47595/149‑1 (MQ=255) gTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGt < 3:121767/149‑1 (MQ=255) tGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGCGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCCTTGCCTGACCAGCCGCGCGCGTAAccc > 2:99578/1‑149 (MQ=255) gCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCg > 1:216165/1‑149 (MQ=255) cTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGc > 7:167153/1‑118 (MQ=255) cTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGc < 8:167153/118‑1 (MQ=255) ttCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCtt > 6:248523/1‑149 (MQ=255) cAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCtt < 2:216165/147‑1 (MQ=255) aGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAAACTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCCACAGCGGCACCCAGGAGCCAAGGTCGAATGGGCGTTGCATGACCAGCCTCTCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAAACGCt > 2:342441/1‑148 (MQ=255) tcaccggcagcgcacagcccgaaacctggcatgacttctacggcttcccaccagccctgtatgcggtgcagtACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGAc < 5:240378‑M1/77‑1 (MQ=255) gACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGGGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCTCCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTGCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGGTGACTGACCTGGCCA‑‑Gc > 5:312937/1‑148 (MQ=255) gACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑Gc > 5:307822/1‑148 (MQ=255) gACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑Gc > 5:312936/1‑148 (MQ=255) ggAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACACAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGACCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCt > 7:198564/1‑149 (MQ=255) cTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCg > 6:366510/1‑149 (MQ=255) tGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAAcc < 6:242002/112‑1 (MQ=255) tGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAAcc > 5:242002/1‑112 (MQ=255) tGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCgg > 6:30800/1‑149 (MQ=255) atgacttctacggcttcccaccagccctgtatgcggtgcagtACCC‑GGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGcc > 2:22409‑M1/43‑149 (MQ=255) tgacttctacggcttcccaccagccctgtatgcggtgcagtACCC‑GGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCg > 5:151847‑M1/42‑149 (MQ=255) cggcttcccaccagccctgtatgcggtgcagtACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGCCCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGc > 5:54465‑M1/33‑149 (MQ=255) cggcttcccaccagccctgtatgcggtgcagtACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTg > 6:240378‑M1/33‑148 (MQ=255) cggcttcccaccagccctgtatgcggtgcagtACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGc > 5:49123‑M1/33‑149 (MQ=255) cgcgcATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCa < 5:366510/148‑1 (MQ=255) gTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAggg < 6:312936/149‑1 (MQ=255) gTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAggg < 6:307822/149‑1 (MQ=255) gTACATCAGCGACACCGGCACCCAGGCGCCATGCTCGAATGCGCGTTGCATGTCCACCCGCGCGGGTAACCCCCCAGCCTTCAACCCCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCCCCCGGCGCCGGGTACAGCACCGCATACAggg < 6:312937/149‑1 (MQ=255) tACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAGGGc > 7:1343/1‑149 (MQ=255) tCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCTACCGCGCCCTGACCTGAAAAAGGCAAGCCCCGGCACGCCCGGCCCCGGGTACTGCACCCCATACAGCGCtg > 1:123031/1‑149 (MQ=255) tCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAGGGCtggt > 7:69503/1‑149 (MQ=255) tCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAGGGCtggt < 4:134808/149‑1 (MQ=255) cAGCGACAGAGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAGGGCtggtg > 7:66559/1‑149 (MQ=255) aGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAGGGCtggtg < 8:66559/148‑1 (MQ=255) aGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAGGGCTGGTGGGAAGcc > 8:18684/1‑149 (MQ=255) gCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAGGGCTGGTGGGAAGCCg > 7:6650/1‑146 (MQ=255) ACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAGGGCTGGTGGGAAGCCGTAg < 4:45577‑M1/147‑1 (MQ=255) | GCTGCCCGAACCTATTAGCAGTACATCCTCGGCACGCAACCCCGCCAGTGCCTGGCCCACCTTCAGCTGCAGCGCCGGCCCCATGTGACTGGGCAGGGAAACCTGCACCACGGGAATGCGCGCATCCGGGTACATCAGCGACAGCGGCACCCAGGCGCCATGGTCGAATGGGCGTTGCATGTCCAGCCGCGCGGGTAACCCCGCAGCCTTCAACCGCTCACTGACCTGGCCA‑‑GCAAGCCCGGGCTCGCCCGGCGCCGGGTACTGCACCGCATACAGGGCTGGTGGGAAGCCGTAG > NC_002947/2092727‑2093021 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |