| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2912027 | 50 (0.830) | 3 (0.050) | 3/256 | NT | 5.1% | coding (1047/10827 nt) | PP_2561 | hemolysin‑type calcium‑binding bacteriocin |
| ? | NC_002947 | = 2912060 | 63 (1.080) | coding (1080/10827 nt) | PP_2561 | hemolysin‑type calcium‑binding bacteriocin | |||||
GCCGACGTGCATAGCGTGCCGCTGCTGGCCACCGATGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTGCAGGCGGACGCCGACACCCTGGTGGGTAACG > NC_002947/2911887‑2912175 | gCCGACGTGCATAGCGTGCCGCTGCTGGCCACCGATGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTc > 2:167978/1‑147 (MQ=255) cGTGCCGCTGCTGGCCACCGATGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATg < 8:116649/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGCTGGCCACCGATGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCAc > 5:175609/1‑149 (MQ=255) gCCGCTGCTGGCCACCGATGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCAc < 1:167978/149‑1 (MQ=255) cGCTGCTGGCCACCGATGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCg < 3:106509/149‑1 (MQ=255) tgGCCACCGATGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTCGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGc > 3:304563/1‑149 (MQ=255) ggCCACCGATGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCCCCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCc < 6:126584‑M2/149‑2 (MQ=255) aCCGATGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGc > 7:271578/1‑149 (MQ=255) aTGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGgctgatcggtgcattgcggtcgccctcgaccagctgggtgac < 7:74933‑M1/149‑43 (MQ=255) aTGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAAt < 5:305914/149‑1 (MQ=255) ccTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGcc > 1:25443/1‑149 (MQ=255) ccTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGGCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGcc < 6:207984/149‑1 (MQ=255) cTACGGCAACATCCTGCGCCGACCCAAAGGCATTGCGCAGGTGGTAATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTTCTGGCACCGCCGATGACCTCCCCCAGCAGGACGAGGGCCACCGCAATGAACCGATCAGCCTGGCCAATGCCg > 6:53066/1‑149 (MQ=255) cGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGgctgatcggtgcattgcggtcgccctcgaccagct < 4:84446‑M1/135‑36 (MQ=255) cGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGgctgatcggtgcattgcggtcgccctcgaccagct > 3:84446‑M1/1‑100 (MQ=255) gttCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCTTTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCg < 7:36541/148‑1 (MQ=255) ccTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCgg < 6:175609/147‑1 (MQ=255) gcgcGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATg > 3:221495/1‑149 (MQ=255) aCCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTcc < 3:357819/149‑1 (MQ=255) cAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTg < 1:58438/149‑1 (MQ=255) aaCGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCtt > 2:12102/1‑147 (MQ=255) aCGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGAc < 7:262471/149‑1 (MQ=255) tcATGCCGCAGGTGGTCAGGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAAAGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGat < 1:303118/148‑1 (MQ=255) cATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGata < 1:27917/149‑1 (MQ=255) gCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCg > 1:215598/1‑149 (MQ=255) cGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGcc > 2:39098/1‑149 (MQ=255) gtggtCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACaa > 6:285788/1‑149 (MQ=255) gtCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGTTCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGc > 6:166159/1‑149 (MQ=255) tCATGCGCGTGAACAACGGCGCCAATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGcc > 6:368179/1‑149 (MQ=255) aTGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCg > 8:98851/1‑148 (MQ=255) tGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCa > 1:205908/1‑149 (MQ=255) gcgTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCAAGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCg > 3:267168/1‑149 (MQ=255) taaccaacGGTCCCGTTGTCTTGGCTGGCACCGCCTATTACGTCACCCAGCTGGTGGAGGGCGCCCGCAATGCACCGATCCGCGTGGCCAATCCCGTGAGCACCGGGAATGGCGTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCgggg < 4:267168/145‑3 (MQ=255) caacGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCggtggtgg > 2:268278/1‑149 (MQ=255) cGGCGCCGATGGCATTGCTGTCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCg < 5:94961/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCgg > 1:133710/1‑149 (MQ=255) cgcCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCgggg < 2:25443/149‑1 (MQ=255) aTGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGgcg < 8:271578/149‑1 (MQ=255) tGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGgcgc < 5:53066/149‑1 (MQ=255) gCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTg < 4:304563/149‑1 (MQ=255) gCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTg < 2:252629/149‑1 (MQ=255) gCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTg > 4:343682/1‑149 (MQ=255) aTTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCAcc < 1:76910/125‑1 (MQ=255) aTTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCAcc > 2:76910/1‑125 (MQ=255) aTTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTg > 4:8950/1‑147 (MQ=255) ttGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGACGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTGCAg > 4:190252/1‑149 (MQ=255) cTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTGCAGGCg > 5:30570/1‑149 (MQ=255) cTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTGCAGGCg < 2:205908/149‑1 (MQ=255) gCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTGCAGGCGGAc > 7:152626/1‑149 (MQ=255) aCCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCTGGGGGGCGCTGCAGGCGTACGc > 2:352884/1‑149 (MQ=255) cgccgATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTGCAGGCGGACGcc > 5:126910/1‑148 (MQ=255) tGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCGGCACCGGTGGTGGTCGGGTGGGCGCTGCAGGCGGACGCCGACAccc < 1:12102/149‑1 (MQ=255) aCGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTGCAGGCGGACGCCGACACCCtg < 3:343682/149‑1 (MQ=255) gTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCctgggtgacgtcatcggcggtgccagcaatgccatcggcgccgttgttcacgcgcatgaccacctgcggcatgccgttgggtccgcgcaggaagttgccgtaggcat < 7:74933‑M2/149‑108 (MQ=255) aCCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTGCAGGCGGACGCCGACACCCtggtgg < 4:221495/148‑1 (MQ=255) cAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCt > 2:179334/1‑119 (MQ=255) cAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCt < 1:179334/119‑1 (MQ=255) aGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCctgggtgacgtcatcggcggtgccagcaatgccatcggcgccgttgttcacgcgcatgaccacctgcggcatgccgttgggtccgcgcaggaagttgccg > 3:84446‑M2/1‑35 (MQ=255) aGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCctgggtgacgtcatcggcggtgccagcaatgccatcggcgccgttgttcacgcgcatgaccacctgcggcatgccgttgggtccgcgcaggaagttgccg < 4:84446‑M2/135‑101 (MQ=255) aGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTGCAGGCGGACGCCGACACCCTGGTGGGTAAc < 7:354167/149‑1 (MQ=255) ggctgatcggtgcattgcggtcgccctcgaccagctgggggacgtcatcggcggtgccagcaatgccatcggcgccgttgttcacgcgcatgaccacctgcggcatgccgttgggtccgcgcaggaagttgccgtaggcatcggtggcc < 6:126584‑M1/149‑149 (MQ=255) gCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCCCCGGGGGTGGTCGGGGGGGCGCTGCAGGCGGACGCCGACACCCTGGTGGGTAAcg < 5:126584/149‑1 (MQ=255) | GCCGACGTGCATAGCGTGCCGCTGCTGGCCACCGATGCCTACGGCAACTTCCTGCGCGGACCCAACGGCATGCCGCAGGTGGTCATGCGCGTGAACAACGGCGCCGATGGCATTGCTGGCACCGCCGATGACGTCACCCAGCTGGTCGAGGGCGACCGCAATGCACCGATCAGCCTGGCCAATGCCGTGAGCACCGGGCATGGCTTCCTTGACGATATCGCCCACAATGCCGCACCGGTGGTGGTCGGGGGGGCGCTGCAGGCGGACGCCGACACCCTGGTGGGTAACG > NC_002947/2911887‑2912175 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |