New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4339694 = | 55 (0.910) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 5.5% | coding (801/1122 nt) | ribAB‑II | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
? | NC_002947 | 4339728 = | 51 (0.880) | coding (835/1122 nt) | ribAB‑II | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
GGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCCTTGCTTGAGCGTGTGCCACAACTGACCCACC > NC_002947/4339548‑4339827 | ggCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGc > 3:286592/1‑149 (MQ=255) aCCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCgg > 8:245820/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCg > 2:213526/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGTCACCTATGAAGACCACATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGCTCCCGGGCGACCCCCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGcccc < 1:312655/148‑1 (MQ=255) tCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCaa > 4:23158/1‑145 (MQ=255) tCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCaa < 3:23158/145‑1 (MQ=255) aCCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGAc > 1:258320/1‑149 (MQ=255) cTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGCCATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGc > 6:309813/1‑149 (MQ=255) cGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGggcggc > 1:3447/1‑149 (MQ=255) gCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACTTTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGgcggcg < 5:323040/149‑1 (MQ=255) aTCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGAACCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCt > 7:140184/1‑149 (MQ=255) gcacagggtgggtcagttgtggcacacgctcaagcaaggcctgggaggattcgtggttggccaggatcaccaccacgccagtaccttcctcagccaccttctgcagCGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAg > 2:350751‑M1/107‑149 (MQ=255) gCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTg > 1:163377/1‑149 (MQ=255) tGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCtgt > 5:20651/1‑126 (MQ=255) tGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCtgt < 6:20651/126‑1 (MQ=255) gCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCGGAAGGTGGCTGAGGAAg < 4:286096/148‑1 (MQ=255) gCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAg < 5:31321/148‑1 (MQ=255) agttgtggcacacgctcaagcaaggcctgggaggattcgtggttggccaggatcaccaccacgccagtaccttcctcagccaccttctgcagCGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTg < 8:225634‑M1/37‑1 (MQ=255) agttgtggcacacgctcaagcaaggcctgggaggattcgtggttggccaggatcaccaccacgccagtaccttcctcagccaccttctgcagCGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTg > 7:225634‑M1/93‑129 (MQ=255) aTGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTAc < 2:258320/149‑1 (MQ=255) tGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACt > 7:168836/1‑149 (MQ=255) tCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑c < 4:286592/149‑1 (MQ=255) tCATCGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCACGCCAACTCGACGCTGTGGGCGCCCCTGCAGAAGGTCGCTGACGAACGTACTGG‑c > 3:217409/1‑149 (MQ=255) tGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑Cgtg > 5:284320/1‑149 (MQ=255) ggCGACATTCGGCGCGAACAGCCGACCCTTGTGCGGGTGCATGTGTTTGACCGGCTGCGCGACCTGTTGGGGGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCATCTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑Cgtgg < 4:87973/148‑1 (MQ=255) ggCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGaa < 6:283845/135‑1 (MQ=255) aTTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGCCCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTCG‑CGTGGTGGTGAt > 5:361571/1‑149 (MQ=255) cgccgcGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATcc < 6:284320/148‑1 (MQ=255) gccgcGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTg < 8:140184/149‑1 (MQ=255) cgAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCAGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGcc > 2:254700/1‑148 (MQ=255) aaCAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAAc < 2:163377/149‑1 (MQ=255) aGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCAc < 5:39299/149‑1 (MQ=255) cgtcccTGGTGCGGGTGGATGTGATTGTCCCGCTGCGCGTCCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGTGGAAGGTACTGGCCGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGa < 1:208830/146‑1 (MQ=255) tGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCAGGAAtcc‑tcc > 3:138144/1‑149 (MQ=255) tGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAAtcc‑tcc > 5:357998/1‑149 (MQ=255) ggTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAAtcc‑tcc > 2:338364/1‑148 (MQ=255) gTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAAtcc‑tcc > 2:45260/1‑147 (MQ=255) gTGCGGGTGCATGTCATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGGGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTTGCCAACCACGAAtcc‑tcc < 8:265444/147‑1 (MQ=255) cGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGc < 8:83929/149‑1 (MQ=255) gttGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCATGCct < 7:245820/147‑1 (MQ=255) cATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCcttgc < 5:309813/148‑1 (MQ=255) cATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTCGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCcttgc < 1:213526/148‑1 (MQ=255) aTGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAAtcc‑tcc < 1:15487/137‑1 (MQ=255) aTGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAAtcc‑tcc > 2:15487/1‑137 (MQ=255) aTGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCcttgctt < 4:74902/149‑1 (MQ=255) aTGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCcttgctt < 1:254700/149‑1 (MQ=255) tgtgATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATc < 4:122551/115‑1 (MQ=255) tgtgATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATc > 3:122551/1‑115 (MQ=255) aCCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCCTTGCTTGAGCgtgt < 6:357998/148‑1 (MQ=255) cccGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCCTTGCTTGAGCGTGTGc > 5:279338/1‑149 (MQ=255) gCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCCTTGCTTGAGCGTGTGCca > 7:88806/1‑148 (MQ=255) tGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑Cgtg < 5:197040/92‑1 (MQ=255) tGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑Cgtg > 6:197040/1‑92 (MQ=255) aCCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCCTTCCCAGGCCTTGCTTGAGCGTGTGCCACAACTGac < 1:242465/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGc > 3:341997/1‑121 (MQ=255) ggtggGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCCTTGCTTGAGCGTGTGcc < 7:145195/135‑1 (MQ=255) ggtggGCGCCGAGTACGCAGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCCTTGCTTGAGCGTGTGcc > 8:145195/1‑135 (MQ=255) gtggGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCCTTGCTTGAGCGTGTGCCACAACTGacccacc < 2:3447/148‑1 (MQ=255) gtggGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCCTTGCTTGAGCGTGTGCCACAACTGacccacc < 1:45260/148‑1 (MQ=255) | GGCACCTTCCGCCTGGTCACCTATGAAGACCGCATCGAAGGTGGCGTGCACATGGCCATGGTCATGGGCGACATTCGCCGCGAACAGCCGACCCTGGTGCGGGTGCATGTGATTGACCCGCTGCGCGACCTGGTGGGCGCCGAGTACGCCGGCCCCGCCAACTGGACGCTGTGGGCGGCGCTGCAGAAGGTGGCTGAGGAAGGTACTGG‑CGTGGTGGTGATCCTGGCCAACCACGAATCC‑TCCCAGGCCTTGCTTGAGCGTGTGCCACAACTGACCCACC > NC_002947/4339548‑4339827 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |