New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4515693 = | 77 (1.280) | 4 (0.070) | 3/256 | NT | 5.4% | coding (295/681 nt) | aat | leucyl/phenylalanyl‑tRNA‑‑protein transferase |
? | NC_002947 | 4515729 = | 66 (1.130) | coding (331/681 nt) | aat | leucyl/phenylalanyl‑tRNA‑‑protein transferase |
CAGGACGGCCAACCGATCCTGTGGTGGTCACCCGACCCGCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATGCGCAACGCCTACTGCGAACTGCACCGCCGTGGCATCGCCCATTCGGTCGAAGTTCGCCAGGACGGCGAACTGGTCGGGGGCCTGTACGGT > NC_002947/4515546‑4515839 | acatcgattcgccaaagaacagctggcccatggccagaccgtacaggcccccgaccagttcgccgtcctggcgaacttcgaccgaatgggcgatgccacggcggtgcagttcgcagtaggcgttgcgcatggtgtcggtgatccaggtg < 5:160455‑M1/1‑1 (MQ=255) ggACGGCCAACCGATCCTGTGGTGGTCACCCGACCCGCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATcgccg > 2:231240/1‑149 (MQ=255) atcgattcgccaaagaacagctggcccatggccagaccgtacaggcccccgaccagttcgccgtcctggcgaacttcgaccgaatgggcgatgccacggcggtgcagttcgcagtaggcgttgcgcatggtgtcggtgatccaggtgcc < 6:382424‑M1/3‑1 (MQ=255) cAACCGATCCTGTGGTGGTCACCCGACCCGCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTgcgc > 4:3628/1‑149 (MQ=255) gccaaagaacagctggcccatggccagaccgtacaggcccccgaccagttcgccgtcctggcgaacttcgaccgaatgggcgatgccacggcggtgcagttcgcagtaggcgttgcgcatggtgtcggtgatccaggtgcc > 2:88998‑M1/139‑141 (MQ=255) gccaaagaacagctggcccatggccagaccgtacaggcccccgaccagttcgccgtcctggcgaacttcgaccgaatgggcgatgccacggcggtgcagttcgcagtaggcgttgcgcatggtgtcggtgatccaggtgcc < 1:88998‑M1/3‑1 (MQ=255) aaCCGATCCTGTGGTGGTCACCCGACCCGCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTgcgcc > 7:107053/1‑149 (MQ=255) cGATCCTGTGGTGGTCACCCGACCCGCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTgcgccgcg > 2:33552/1‑149 (MQ=255) cTGTGGTGGTCACCCGACCCGCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTcg > 2:318231/1‑149 (MQ=255) tggtggTCACCCGACCCGCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGa < 6:208039/149‑1 (MQ=255) gtggtCACCCGACCCGCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGAc > 4:38829/1‑148 (MQ=255) tggtCACCCTACCCGCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCAGGTGTCACTCTGGCTGGCCAAGCTGATTCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTa < 8:73400/149‑1 (MQ=255) tggtCACCCGACCCGCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATCTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTa > 3:321597/1‑149 (MQ=255) gtCACCCGACCCGCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTAc < 5:118772/148‑1 (MQ=255) acccgacccgCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCt > 5:50007/1‑148 (MQ=255) cccgacccgCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTgcgc > 4:58357/1‑128 (MQ=255) cccgacccgCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTgcgc < 3:58357/128‑1 (MQ=255) ccgacccgCGCACCGTGTTGTTGCCTGGACCAGTTGCATGTGTCAGGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGa > 1:196807/1‑149 (MQ=255) cgacccgCGCACGGTGTTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCCCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACg < 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ccgtacaggcccccgaccagttcgccgtcctggcgaacttcgaccgaatgggcgatgccacggcggtgcagttcgcagtaggcgttgcgcatggtgtcggtgatccaggtGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCAcc > 6:380599‑M1/111‑149 (MQ=255) gtgtTGTTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCAc < 6:359125/149‑1 (MQ=255) tgttgtTGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCAcc < 3:37977/149‑1 (MQ=255) cgttgttGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCTGCGCCTCGCGACTACGCTGAc < 7:25151/133‑1 (MQ=255) cgttcttGCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCTGCGCCTCGCGACTACGCTGAc > 8:25151/2‑134 (MQ=255) ccccgaccagttcgccgtcctggcgaacttcgaccgaatgggcgatgccacggcggtgcagttcgcagtaggcgttgcgcatggtgtcggtgatccaggtGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCAcc < 5:155976‑M1/39‑1 (MQ=255) ccccgaccagttcgccgtcctggcgaacttcgaccgaatgggcgatgccacggcggtgcagttcgcagtaggcgttgcgcatggtgtcggtgatccaggtGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCAcc > 6:155976‑M1/101‑139 (MQ=255) ttgCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGacac > 2:205640/1‑149 (MQ=255) gCCT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCa > 6:42553/1‑149 (MQ=255) cT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGa < 1:199904/115‑1 (MQ=255) cT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGa > 2:199904/1‑115 (MQ=255) cT‑GACCAGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATg > 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aGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATGCGCAAc < 6:50007/149‑1 (MQ=255) aGTTGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGACGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATGCGCAAc < 4:243448/149‑1 (MQ=255) ttGCATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGCCTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATGCGCAACGc > 7:326326/1‑149 (MQ=255) cATGTGTCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATGCGCAACGCCTa > 6:160455/1‑149 (MQ=255) gtgtCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATcgcc > 2:323946/1‑81 (MQ=255) gtgtCACGCTCGCTGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATcgcc < 1:323946/81‑1 (MQ=255) 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ctGGCCAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATGCGCAACGCCTACTGCGAACTGCAccg > 3:41506/1‑149 (MQ=255) ccAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATGCGCAACGCCTACTGCGAACTGCACCGCCGt < 1:205640/149‑1 (MQ=255) cAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATGCGCAACGCCTACTGc > 1:356553/1‑133 (MQ=255) cAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATGCGCAACGCCTACTGc < 2:356553/133‑1 (MQ=255) cAAGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATGCGCAACGCCTACTGCGAACTGCACCGCCGTg < 1:176437/149‑1 (MQ=255) aaGCTGATGCGCCAAGGCCGCTACCAGGTCAGCTTCGACACCGACTTCCCGGCCGTGATCGCCGCCTGCGCCGCGCCTCGCGACTACGCTGACGGCACCTGGATCACCGACACCATGCGCAACGCGTACTGCGAACTGCACCGCCGTgg > 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |