| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6125719 = | 55 (0.910) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.1% | coding (514/1704 nt) | PP_5374 | choline/carnitine/betaine transporter family protein |
| ? | NC_002947 | 6125757 = | 61 (1.080) | coding (552/1704 nt) | PP_5374 | choline/carnitine/betaine transporter family protein | |||||
CCCGTTCGCCACCGGCCTCACCGACGAAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGC > NC_002947/6125571‑6125865 | cccGTTCGCCACCGGCCTCACCGACGAAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCa > 4:288532/1‑149 (MQ=255) ccGTTCGCCACCGGCCTCACCGACGAAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTAATTTGACTATCGCAAGGGCTTGCAGCTGTGCAt > 6:96563/1‑149 (MQ=255) tctgcacccccaggattaagggcaggtcaaactccttgctcagcccggtgttcatttgcaccacgcccaggcccagcgactgggatacaccgaacgcggtaatctccacggcaaggatgtccaccacatgtccgatgggcccatagAt > 7:162522‑M1/147‑148 (MQ=255) cggtCGCCACCGGCCTCACCGTCGCAGCCGCCTCCACAGCTATGCGAACTAGCCTATTCCACTGGGGCCTGGATCGCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATg < 2:94845/146‑1 (MQ=255) tgcacccccaggctgatgggcaggtcaaacacctggctcagcccggtgttcatttgcaccacgcccaggcccagcgactgggatacaccgaacgcggtaatcaccacggcaaggatgtccaccacatgtccgatgggcccatagATgcg < 3:225941‑M1/5‑1 (MQ=255) cacccccaggctgatgggcaggtcaaacacctggctcagcccggtgttcatttgcaccacgcccaggcccagcgactgggatacaccgaacgcggtaatcaccacggcaaggatgtccaccacatgtccgatgggcccatagATg > 6:151842‑M1/143‑145 (MQ=255) ccACCGGCCTCACCGACGAAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTc > 1:330448/1‑148 (MQ=255) ccGGCCTCACCGACGAAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATc > 7:230152/1‑149 (MQ=255) cGGCCTCACCGACGAAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATcc < 3:288532/149‑1 (MQ=255) ggCCTCACCTACGAAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCt < 3:351818/149‑1 (MQ=255) ggCCTCACCGACGAAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCt < 1:377982/149‑1 (MQ=255) gCCTCACCGACGAAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCtt > 5:206764/1‑149 (MQ=255) aCCGACGAAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTAc < 6:6647/147‑1 (MQ=255) gaAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGAt < 8:230152/149‑1 (MQ=255) aaGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGAtt < 2:330448/149‑1 (MQ=255) aGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTg < 6:206764/149‑1 (MQ=255) ctcagcccggtgttcatttgcaccacgcccaggcccagcgactgggatacaccgaacgcggtaatcaccacggcaaggatgtccaccacatgtccgatgggcccatagATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTa > 4:225941‑M1/109‑149 (MQ=255) aTGCGAATTACCCTATTCCACTGCGGCCTGCATCCCTGGGCTATTATTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTCTCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATgg < 4:105588/149‑1 (MQ=255) cccggtgttcatttgcaccacgcccaggcccagcgactgggatacaccgaacgcggtaatcaccacggcaaggatgtccaccacatgtccgatgggcccatagATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATgg > 5:214050‑M1/104‑147 (MQ=255) cccggtgttcatttgcaccacgcccaggcccagcgactgggatacaccgaacgcggtaatcaccacggcaaggatgtccaccacatgtccgatgggcccatagATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATgg < 6:214050‑M1/44‑1 (MQ=255) ttACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATc < 2:315982/149‑1 (MQ=255) cccTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGa > 3:312511/1‑149 (MQ=255) tcTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGa > 8:342742/2‑148 (MQ=255) ccTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATggg < 2:294255/139‑1 (MQ=255) ccTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATggg > 1:294255/1‑139 (MQ=255) cACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATgtggt > 5:143657/1‑149 (MQ=255) cacgcccaggcccagcgactgggatacaccgaacgcggtaatcaccacggcaaggatgtccaccacatgtccgatgggcccatagATGCGCt > 8:343522‑M1/86‑92 (MQ=255) gCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATc < 4:312511/149‑1 (MQ=255) cATCCCTGGGCTATTTTTACGATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTTCTTTGCGTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCTTGCGCGGGCTGCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCAGCTATGGGCCCGTCGGACATGGGGTGGACCTGCTTGc > 2:308545/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCgtg < 8:141052/149‑1 (MQ=255) cTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGc < 1:68081/116‑1 (MQ=255) cTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGc > 2:68081/1‑116 (MQ=255) tATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGAtt > 2:74744/1‑148 (MQ=255) ttACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACcgc < 4:160315/148‑1 (MQ=255) ccATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTc < 1:11351/149‑1 (MQ=255) cATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCg > 5:336704/1‑149 (MQ=255) cATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCg > 4:185108/1‑149 (MQ=255) cATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCg < 2:334701/149‑1 (MQ=255) tCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGTCGTGGTGATTACCGCGTTCGgt < 7:56024/149‑1 (MQ=255) tCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGgt < 2:48427/149‑1 (MQ=255) tCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGgt > 7:257800/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATcc > 2:296245/1‑149 (MQ=255) gCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATc < 3:17179/148‑1 (MQ=255) cTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATcc > 7:339811/1‑147 (MQ=255) ggCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGt < 1:321275/148‑1 (MQ=255) ccTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGc > 1:110078/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGc > 3:47010/1‑149 (MQ=255) ttGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTAGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTCATTGGTGAGCGCAACTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGctg > 1:210075/1‑149 (MQ=255) gCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGctgg < 8:339811/148‑1 (MQ=255) cTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGctgg > 1:144544/1‑146 (MQ=255) cTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGctgg < 2:144544/146‑1 (MQ=255) aCTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGctgggcctg > 8:7229/1‑149 (MQ=255) cTTTGCCTATCTCAAGGGCTTGACGCTGATCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTTGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTTGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGctgggcctgg < 6:336704/149‑1 (MQ=255) cTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGctgggcctg < 1:74744/148‑1 (MQ=255) cTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACAGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGctgggcctgg > 8:347093/1‑149 (MQ=255) gCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCgt > 5:169685/1‑149 (MQ=255) ccTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCgtg < 7:347093/149‑1 (MQ=255) tCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCGGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGc < 5:324221/149‑1 (MQ=255) tCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCgtggtg < 8:257800/148‑1 (MQ=255) ggCTTGCCGGTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGGGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGaa < 4:290892/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGaa > 6:188932/1‑148 (MQ=255) gCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGaa > 8:169680/1‑148 (MQ=255) cGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCggg < 1:334094/149‑1 (MQ=255) cTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATgtggtg < 1:46542/69‑1 (MQ=255) cTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATgtggtg > 2:46542/1‑69 (MQ=255) gCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGGGc < 6:143657/149‑1 (MQ=255) cATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGc > 1:374654/1‑148 (MQ=255) cATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGc > 3:311574/1‑148 (MQ=255) | CCCGTTCGCCACCGGCCTCACCGACGAAGCCGCCACCACAGCTATGCGAATTACCCTATTCCACTGGGGCCTGCATCCCTGGGCTATTTTTACCATCGTTGGCCTGGGCCTTGCCTACTTTGCCTATCGCAAGGGCTTGCCGCTGAGCATGCGCTCGATCCTTTACCCGCTGATTGGTGAGCGCATCTATGGGCCCATCGGACATGTGGTGGACATCCTTGCCGTGGTGATTACCGCGTTCGGTGTATCCCAGTCGCTGGGCCTGGGCGTGGTGCAAATGAACACCGGGCTGAGC > NC_002947/6125571‑6125865 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |