| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 62692 | 61 (1.010) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 5.7% | coding (937/1269 nt) | PP_0053 | sulfide:quinone oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | = 62746 | 74 (1.310) | coding (991/1269 nt) | PP_0053 | sulfide:quinone oxidoreductase | |||||
CTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGTCCTGGCCGAGTTCACCTATGGCGGCAAGCTGGCCCCGAGCTTCCCCAACTGGTTACTGG > NC_002947/62604‑62893 | cTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGtgctgg < 4:47069‑M2/149‑7 (MQ=255)cTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGtgctgg < 2:198564‑M2/149‑7 (MQ=255) tCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGtgctggt < 6:114671‑M2/149‑8 (MQ=255) cGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGtgctgg > 5:298631‑M2/1‑140 (MQ=255) gcagggTTGACGGCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATCCACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGgcg < 7:98506/146‑1 (MQ=255) tCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTg < 6:97601/149‑1 (MQ=255) gATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGc > 8:23491/1‑149 (MQ=255) gATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGc < 3:60296/149‑1 (MQ=255) aTCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCg < 1:371202/149‑1 (MQ=255) tCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACCCCAGCAATGCCACGACA‑GCAGCTGCGGCGCGCAAGCAGCCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCgc > 7:114504/1‑148 (MQ=255) gCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCt > 2:141972/1‑149 (MQ=255) tACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTgg < 1:271931/149‑1 (MQ=255) aCCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTg < 2:66324/147‑1 (MQ=255) aCCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTg > 1:66324/1‑147 (MQ=255) aCCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGc > 8:158784/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGccc < 8:295577/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGcc > 5:185344/1‑148 (MQ=255) cTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCa < 5:114671/149‑1 (MQ=255) cATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTacga > 1:74850/1‑149 (MQ=255) tCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAg < 1:374781/123‑1 (MQ=255) tCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAg > 2:374781/1‑123 (MQ=255) tCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTacgacg > 5:379665/1‑149 (MQ=255) gCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGc > 6:293971/1‑149 (MQ=255) aaaTACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGGGCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGc > 1:109070/1‑148 (MQ=255) aaaTACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTa < 2:201472/149‑1 (MQ=255) aaTACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTAt < 5:2894/149‑1 (MQ=255) aaTACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTAt > 1:27549/1‑149 (MQ=255) tACTCCAACGTTCATGCCCTAGGTTACCTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCTGTTGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATgg < 7:180064/149‑1 (MQ=255) acCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTc > 7:106117/1‑149 (MQ=255) cAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGt > 5:107728/1‑149 (MQ=255) cAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGt > 2:230578/1‑149 (MQ=255) aaCGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTg < 6:185344/149‑1 (MQ=255) aCGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGc < 3:32422/149‑1 (MQ=255) aCGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGc > 3:129185/1‑149 (MQ=255) cATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCt > 4:97491/1‑149 (MQ=255) tGCCCTAGGGGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTa < 6:131389/149‑1 (MQ=255) cccTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTAcc > 4:74521/1‑149 (MQ=255) cccTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTAcc > 4:89443/1‑149 (MQ=255) cTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGt > 3:229706/1‑149 (MQ=255) ggTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGTCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTc > 2:137468/1‑147 (MQ=255) ggTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGa < 8:290071/149‑1 (MQ=255) cGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑TCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGcgcg < 2:74850/149‑1 (MQ=255) cGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGcgcg < 1:198564/149‑1 (MQ=255) gTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCgg > 4:236996/1‑149 (MQ=255) 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acacCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATc < 2:351450/149‑1 (MQ=255) acacCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATc < 1:141972/149‑1 (MQ=255) acacCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATc < 6:379665/149‑1 (MQ=255) acCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGt > 3:66185/1‑149 (MQ=255) acCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGt > 3:337655/1‑149 (MQ=255) 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ccAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGTCCTGGCCGAGTTCACCTATGGCGGCAAGCTGGCCCCGAGCTTCCCCAACTgg < 3:249255/149‑1 (MQ=255) ccAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGTCCTGGCCGAGTTCACCTATGGCGGCAAGCTGGCCCCGAGCTTCCCCAACTgg > 6:201909/1‑149 (MQ=255) acaaTGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGTCCTGGCCGAGTTCACCTATGGCGGCAAGCTGGCCCCGAGCTTCCCCAACTGGTTa > 3:50532/1‑149 (MQ=255) caaTGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGTCCTGGCCGAGTTCACCTATGGCGGCAAGCTGGCCCCGAGCTTCCCCAACTGGTTAc > 1:49461/1‑149 (MQ=255) tgtgCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGTCCTGGCCGAGTTCACCTATGGCGGCAAGCTGGCCCCGAGCTTCCCCAACTGGTTACTgg < 2:109070/149‑1 (MQ=255) | CTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACC‑GCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGTCCTGGCCGAGTTCACCTATGGCGGCAAGCTGGCCCCGAGCTTCCCCAACTGGTTACTGG > NC_002947/62604‑62893 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |