New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 254201 = | 58 (0.960) | 3 (0.050) | 3/248 | NT | 5.7% | coding (916/1731 nt) | PP_0203 | dipeptidase |
? | NC_002947 | 254273 = | 44 (0.780) | coding (844/1731 nt) | PP_0203 | dipeptidase |
GCTGCAGGTGCTTGACCAGCTGTGCCGGGTTGTCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTG > NC_002947/254126‑254420 | gctgcAGGTGCTTGACCAGCTGTGCCGGGTTGTCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCAt < 5:295589/148‑1 (MQ=255) ttGACCAGCTGTGCCGGGTTGTCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGcc < 5:101515/146‑1 (MQ=255) ttGACCAGCTGTGCCGGGTTGTCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGcc > 6:101515/1‑146 (MQ=255) ttGACCAGCTGTGCCGGGTTGTCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCg > 4:79521/1‑147 (MQ=255) cAGCTGTGCCGGGTTGTCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGc < 3:67186/146‑1 (MQ=255) cAGCTGTGCCGGGTTGTCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGc > 4:67186/1‑146 (MQ=255) tgCCGGGTTGTCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTtctc < 1:120175/147‑1 (MQ=255) tgCCGGGTTGTCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCg < 2:46803/148‑1 (MQ=255) ccGGGTTGTCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGc > 2:281352/1‑148 (MQ=255) tCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATcaccac > 6:334975/1‑149 (MQ=255) cAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTtct > 3:115822/1‑135 (MQ=255) cAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTtct < 4:115822/135‑1 (MQ=255) aGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCg > 6:327136/1‑136 (MQ=255) aGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCg < 5:327136/136‑1 (MQ=255) aGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCg > 6:352506/1‑149 (MQ=255) aTCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTtct < 7:136087/130‑1 (MQ=255) aTCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTtct > 8:136087/1‑130 (MQ=255) aTCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCggg > 1:280018/1‑147 (MQ=255) aTCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTa < 1:49491/149‑1 (MQ=255) aTCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTa < 5:352506/149‑1 (MQ=255) aTCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTa < 5:334975/149‑1 (MQ=255) aaCCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTc > 4:318912/1‑147 (MQ=255) aCCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAg < 7:193718/149‑1 (MQ=255) gttgttGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAg < 3:318912/149‑1 (MQ=255) ttgGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGtt < 5:192151/148‑1 (MQ=255) ttgGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTg < 1:281352/149‑1 (MQ=255) tgGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTg > 6:182038/1‑148 (MQ=255) ggATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTGTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTaa > 8:18371/1‑149 (MQ=255) ggTTAGTGGCCAGCCCACCGGTTAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAgccgcc < 6:281852/124‑1 (MQ=255) ggTTAGTGGCCAGCCCACCGGTGAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAgccgcc > 5:281852/1‑124 (MQ=255) gTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCgg < 2:280018/146‑1 (MQ=255) gTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAg < 2:298251/148‑1 (MQ=255) TGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAggg < 5:375491‑M1/149‑1 (MQ=255) ggccagcttcaccaagcgcccggccagcggcaagggtgccgagatcgtcaacctgaccggtgggctggccaTGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGtt > 7:329245‑M2/72‑132 (MQ=255) ggccagcttcaccaagcgcccggccagcggcaagggtgccgagatcgtcaacctgaccggtgggctggccaTGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGtt < 8:329245‑M2/61‑1 (MQ=255) gccagcttcaccaagcgcccggccagcggcaagggtgccgagatcgtcaacctgaccggtgggctggccaTGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGtt > 5:301437‑M2/71‑149 (MQ=255) GCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGtt > 2:362207‑M1/1‑149 (MQ=255) CCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTg < 3:151843‑M1/149‑1 (MQ=255) AGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTgcg < 1:119766‑M1/149‑1 (MQ=255) CCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCt > 4:151843‑M1/1‑149 (MQ=255) gTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAagta < 3:99525/149‑1 (MQ=255) cAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAagtagt < 3:79521/149‑1 (MQ=255) aCGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTGTCGGAAATCACCACCGGGTAGCAGCCGTCTAGGGCCAGGTAGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTATGGAAt > 3:50720/1‑149 (MQ=255) aCGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGAGTAt > 1:60531/1‑149 (MQ=255) cccTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAAGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCt < 6:58310/149‑1 (MQ=255) cGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGAAGCCTTTCACGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTttct > 8:220832/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTttctt > 4:343995/1‑149 (MQ=255) gCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCg < 3:281131/147‑1 (MQ=255) gCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTGGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCggt > 1:145326/1‑149 (MQ=255) ggggcTTGGTGAAGCTGGGCATGACGGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGgtggtg < 2:145326/146‑1 (MQ=255) gcTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCg < 5:182038/149‑1 (MQ=255) cTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTg < 2:355573/79‑1 (MQ=255) cTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTg > 1:355573/1‑79 (MQ=255) gTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGAGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATca < 2:60531/148‑1 (MQ=255) aaGCTGGCCATGACCGGGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACGGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATcagca < 7:18371/148‑1 (MQ=255) tggccaTGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCtt > 4:166348‑M2/7‑148 (MQ=255) aTGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTg > 4:206213‑M2/2‑149 (MQ=255) | GCTGCAGGTGCTTGACCAGCTGTGCCGGGTTGTCAGAAATCAGGGTCGCAACCGACGTTGTTGGGATCTGGTTAGTGGCCAGCCCACCGGTCAGGTTGACGATCTCGGCACCCTTGCCGCTGGCCGGGCGCTTGGTGAAGCTGGCCATGACCGTGCCGTAGCCTTTCTCGGCAATCACCACCGGGTAGCCGCCGTCGAGGGCCAGGTTGTAATCGGGCGTAGGGTTGCGCTCAAAGTAGTAGGGTATGGCATCACCGCTGGTTTCTTCGGTGGTGTCGATCAGCAGCTTGAACTG > NC_002947/254126‑254420 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |