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gcgcAGCCAGTTGTACCGTTGGGTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCAAGGCTGGTGTGTGTCGGGCGACTGTGCGAAc < 3:306881/149‑1 (MQ=255) ccAGTTGTACCGTTGGGTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCAAGGCTGGTGTGTGTCGGGCGACTGTGCGAACAGAAgg > 5:163630/1‑149 (MQ=255) ccAGTTGTACCGTTGGGTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCAAGGCTGGTGTGTGTCGGGCGACTGTGCGAACAGAAgg < 6:226052/149‑1 (MQ=255) ttGTACCGTTGGGTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCAAGGCTGGTGTGTGTCGGGCGACTGTGCGAACAGAAGGGc > 7:27942/1‑147 (MQ=255) gTACCGTTGGGTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCAAGGCTGGTGTGTGTCGGGCGACTGTGCGAACAGAAGGGCCAg < 4:264276/148‑1 (MQ=255) gTACCGTTGGGTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCAAGGCTGGTGTGTGTCGGGCGACTGTGCGAACAGAAGGGCCAg < 4:269283/148‑1 (MQ=255) tACCGTTGGGTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCAAGGCTGGTGTGTGTCGGGCGACTGTGCGAACAGAAGGGCCAgct < 3:188896/149‑1 (MQ=255) gTTGGGTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCaa < 1:369820/102‑1 (MQ=255) gTTGGGTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCaa > 2:369820/1‑102 (MQ=255) gggTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCAAGGCTGGTGTGTGTCGGGCGACTGTGCGAACAGAAGGGCCAGCTGCTGTTg > 8:71581/1‑149 (MQ=255) gggggcgcccgtacgagctcaccgccgcgacaaaggcggcgcgccgtactttctcacccaagtgcaggaactgtggtttgtcgaattcttcagggccgtgcacggtaaagctgtatgccggcccgcccagggcgttggccagcatgac > 7:339937‑M2/1‑4 (MQ=255) gTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCAAGGCTGGTGTGTGTCGGGCGACTGTGCGAACAGAAGGGCCAGCTGCTGTTGCt < 7:319015/149‑1 (MQ=255) gTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGGGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCAAGGCTGGTGTGTGTCGGGCGACTGTGCGAACAGAAGGGCCAGCTGCTGTTGCt < 4:344107/149‑1 (MQ=255) | GGGCGGGCCGGCATACAGCTTTACCGTGCACGGCCCTGAAGAATTCGACAAACCACAGTTCCTGCACTTGGGTGAGAAAGTACGGCGCGCCGCCTTTGTCGCGGCGGTGAGCTCGTACGGGCGCAGCCAGTTGTACCGTTGGGTGGCGCCCGAGCAGTGGGGC‑AAGGTGAAGGTGGTGCATTGCGGCCTGGAGCGTGGGTTTCATGAGGTGGCGCCGGTCAATGTGCCGCCGGCACCAAGGCTGGTGTGTGTCGGGCGACTGTGCGAACAGAAGGGCCAGCTGCTGTTGCT > NC_002947/3554813‑3555103 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |