New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4583494 | 33 (0.550) | 5 (0.100) | 5/224 | NT | 17.2% | intergenic (‑67/+104) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
? | NC_002947 | = 4583555 | 20 (0.390) | intergenic (‑128/+43) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
AACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑GGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATC > NC_002947/4583415‑4583700 | aaCGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTAGCGGAtaaacccg < 7:4987‑M2/149‑9 (MQ=255) gCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctc < 7:142811‑M2/149‑12 (MQ=255) gCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGAtaaacacgctc < 3:125384‑M2/149‑12 (MQ=255) ggCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctac < 5:237728‑M2/149‑16 (MQ=255) gCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacg < 2:361664‑M2/149‑17 (MQ=255) gCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑gggggggg > 2:314565/1‑149 (MQ=255) tCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑ggggggggggggg > 7:286329/1‑147 (MQ=255) tCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGAAAAACCCGCGCCTAC‑GGGGGGGGGGGcc > 6:62898/1‑148 (MQ=255) atgcaCAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAAccat > 7:85236/1‑147 (MQ=255) tCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCCCC‑GTGTGAACCTTGTTTACGGGCTTTTTGGATgcg > 5:122749/1‑149 (MQ=38) tCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTAGATggg > 2:114947/1‑147 (MQ=255) ccGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCCCA‑GTCTGAACCTTGTTAAAGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGc > 6:103323/1‑149 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGGTTTTTCGATGCGCCAGATGcgg > 6:352773/1‑146 (MQ=255) ttcgCGGGTAAACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGGACC‑GGAGGAACCTTGTTAACGGGCGTTTTAGATGCGCCAGATGCCCAAc > 3:115469/4‑149 (MQ=37) gAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagc < 5:260480‑M2/149‑78 (MQ=255) aGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GGCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACgg > 3:107541/1‑149 (MQ=255) gCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatcgccaagcgt < 2:256442‑M2/149‑80 (MQ=255) cGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgtt < 2:111722‑M2/149‑81 (MQ=255) cGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑g > 2:15312/1‑149 (MQ=255) ggTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑g > 3:273479/1‑149 (MQ=255) ccGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGAATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTGGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑GGTGCAAgg > 5:329315/1‑149 (MQ=255) gcgAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTGCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑GGTGCCAGGGc > 1:72924/1‑149 (MQ=255) gcgAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAAAGGGGTTTTTCAATTCGCAAGATGCCCAACGCCA‑GGTGCCAGGGc > 6:121676/1‑149 (MQ=38) aTGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑GGTGCCAGGGGTGTATg > 7:36602/1‑149 (MQ=255) gAGGTTCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGAGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccggcagcctacatcgacgacccgctgt > 6:260480‑M2/1‑36 (MQ=255) aGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑GGTGCCAGGGGGCTATGCGCATCCATTGGGGCtt > 6:82822/1‑149 (MQ=255) cATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGGCCAGGTGGAAACGTTGTTAACGGGGTTTTTCGAGGCCCCTAAGCCCGAA‑GGCAGGGGGCCAGGGGTGAATGGGCAGCCATgggggttgggg > 2:100735/1‑141 (MQ=12) tGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccggcagccttcatcgacgacccgctgtggtacaag > 1:111722‑M2/1‑28 (MQ=255) gCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GGATGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑GGGGACAGGGATAAATGCCAAACCATGGGGTATTCCCGTACCCCAACCa > 8:166902/1‑149 (MQ=255) cGCCGGTGTGCGCGGTTAAACCCGGGCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑GGTGCCAGGGCCCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCgg < 5:121676/149‑1 (MQ=255) cgcgGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑GGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTtca < 1:15312/148‑1 (MQ=255) gcgGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑GGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGTGCTTCCCGTACAACGACCAGCGGTGGCCGTtcatc > 8:191807/1‑149 (MQ=255) | AACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTT‑CGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACA‑GTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCA‑GGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATC > NC_002947/4583415‑4583700 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |