Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,980,282 | C→G | 8.4% | D117H (GAC→CAC) | cobN ← | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,980,282 | 0 | C | G | 8.4% | 198.2 / 5.1 | 65 | D117H (GAC→CAC) | cobN | aerobic cobaltochelatase subunit CobN |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/30); new base G (2/3); total (31/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
ATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATACAGGTC > NC_002947/3980136‑3980426 | aTAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCAt < 5:21269/149‑1 (MQ=255) tAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCATAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGGGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATc < 7:240663/149‑1 (MQ=255) tAGTCGCGGCCCAGCCAATGGCTGGCCAGGCACTTGAACAGGTTGATTGAGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATACCAAAGCCGCTAGGCCATCACACCCCGGACCTTGCCCAGGCTGCTCAGATCCGAGTCCGGGCGGTCATc > 8:240663/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCCCAGCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGATCAGCTCCGGGTCCGGGCGATGACCGcc < 2:182183/149‑1 (MQ=255) gcgGCCCAGCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGccc < 5:75677/148‑1 (MQ=255) ccAGCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCAcc < 3:30209/149‑1 (MQ=255) cAGCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCAc > 6:193018/1‑147 (MQ=255) cAGCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCAc > 6:110024/1‑147 (MQ=255) cAGCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGGCCGGGCGATGACCGCCCggacccg < 7:82870/149‑6 (MQ=255) cAGCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTGGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCa < 3:235640/149‑1 (MQ=255) gCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAg > 1:161415/1‑148 (MQ=255) ccATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGaa > 4:367589/1‑149 (MQ=255) cATNTGCTGGCCANGCAGTTGTANAGGTTGATGGCGGTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAAt < 6:26328/149‑1 (MQ=255) gcCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCAc > 6:162955/1‑149 (MQ=255) gcCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCAc < 8:264087/149‑1 (MQ=255) aGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGcc < 4:205689/149‑1 (MQ=255) gCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAGAGCCGCTACGCCTTCTAAACGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTAAGCTACGGGTACCGGCGGTGATAGCCCGGCAACAGAATAAGCTTCACGCCaa > 1:98809/1‑148 (MQ=255) aGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACgg < 3:367589/149‑1 (MQ=255) aGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACgg < 5:110024/149‑1 (MQ=255) ttGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCAGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGggc < 8:39100/149‑1 (MQ=255) gAACCGGTATATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGggcg < 1:319480/148‑1 (MQ=255) gAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTTATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGggcg < 7:310378/148‑1 (MQ=255) gAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGggcg < 2:161415/148‑1 (MQ=255) ggTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGc < 5:193018/149‑1 (MQ=255) gATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGa > 3:246796/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCAc > 8:37186/1‑123 (MQ=255) gTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCAc < 7:37186/123‑1 (MQ=255) gTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAgtt < 6:355394/149‑1 (MQ=255) gTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAgtt > 7:49516/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAgtt < 4:307325/149‑1 (MQ=255) gccCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGATGACCGCCCg < 4:79625/92‑1 (MQ=255) aGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGCCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAg > 7:3890/1‑147 (MQ=255) gTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGc > 7:197723/1‑149 (MQ=255) tAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGcc < 4:246796/149‑1 (MQ=255) aaTGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTG‑CCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCaa > 7:30674/1‑149 (MQ=255) aaaGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCa > 4:138813/1‑149 (MQ=255) gCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCaa > 4:338584/1‑138 (MQ=255) gCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCaa < 3:338584/138‑1 (MQ=255) gCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTg > 7:293678/1‑148 (MQ=255) cTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCa > 2:333689/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGac < 2:98809/149‑1 (MQ=255) cTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACAcc < 8:197723/148‑1 (MQ=255) tCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAg > 8:75874/1‑149 (MQ=255) cACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAg > 2:371893/1‑148 (MQ=255) cACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAg > 1:18992/1‑148 (MQ=255) cccGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGGTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGa > 2:61260/2‑149 (MQ=255) aCCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCCTCGACCGGCACAAGCATCAGCTGCACGCCAAGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGAGACACCAGGa > 4:119671/1‑149 (MQ=255) aCCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCTCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGa < 1:106184/149‑1 (MQ=255) cgcgGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGAt > 4:43455/1‑148 (MQ=255) ttGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggc < 4:61507/149‑1 (MQ=255) cccAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggcgtg < 8:49516/149‑1 (MQ=255) cccAGGCTGGTCAACTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggcgtg > 7:165704/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggcgtgg > 6:197923/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggcgtgg < 8:30674/149‑1 (MQ=255) aGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTtggcgtggcg > 5:32894/1‑149 (MQ=255) gCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCgca < 5:371083/149‑1 (MQ=255) tCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCAcc > 7:305127/1‑149 (MQ=255) aGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTg < 8:3890/149‑1 (MQ=255) acTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTgg < 8:165704/148‑1 (MQ=255) cTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGt > 3:123439/1‑149 (MQ=255) ccgggtccgggCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTc > 5:55322/1‑148 (MQ=255) cgggtccgggCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCg < 1:333689/148‑1 (MQ=255) gggtccgggCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGa > 2:278075/1‑148 (MQ=255) gccgggCGATGACCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATa > 8:82372/2‑149 (MQ=255) cGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATACAGGTc < 7:75874/149‑1 (MQ=255) | ATAGTCGCGGCCCAGCCATTGGCTGGCCAGGCAGTTGAACAGGTTGATGGCGTTGGCCTTGCCGCCCTGGCGCAGGTAATGCCAAAGCCGCTCGGCCTGCTCACCGCGGACGTTGCCCAGGCTGGTCAGCTCCGGGTCCGGGCGGTCATCGCCCGGCACCAGAATCAGCTGCACGCCACGGGCGGCCAGCTCGACCAGTTGTTCGACGCCGTAGCGCCAGTAGCCAACGCCACCGTGCAGCGACACCAGGATGACCTTGGCGTGGCGCAGCACCTGGTCGACATACAGGTC > NC_002947/3980136‑3980426 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |