| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,196,293 | G→C | 7.8% | intergenic (+135/+234) | PP_5618 → / ← PP_5619 | Cro/CI family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,196,293 | 0 | G | C | 7.8% | 187.5 / 4.1 | 61 | intergenic (+135/+234) | PP_5618/PP_5619 | Cro/CI family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/23); new base C (3/2); total (36/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
CCAGGGCCTGGTGACGGTAAGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTATGACTCAGAACGAGACAGCGAAGAAGC > NC_002947/4196145‑4196436 | ccAGGGCCTGGTGACGGTAAGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACgg > 3:236610/1‑149 (MQ=255) cAGGGCCTGGTGACGGTAAGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGgt < 6:69971/149‑1 (MQ=255) gggCCTGGTGACGGTAAGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGCCAAGCTAGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGgtgt > 6:202297/1‑149 (MQ=255) gggCCTGGTGACGGTAAGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGgtgt < 2:53238/149‑1 (MQ=255) cTGGTGACGGTAAGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGAc < 2:71264/149‑1 (MQ=255) cTGGTGACGGTAAGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGAc > 1:71264/1‑149 (MQ=255) tGACGGTAAGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGtct < 5:41179/149‑1 (MQ=255) ggTAAGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGc > 4:372457/1‑149 (MQ=255) ggTAAGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGc < 4:236610/149‑1 (MQ=255) aGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGACGT‑CGACACCGTCGACGGCTCggttcac < 1:41489/149‑6 (MQ=255) aCTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCggg > 4:154175/1‑149 (MQ=255) cTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAg < 5:247483/148‑1 (MQ=255) cTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGc > 2:266611/1‑149 (MQ=255) gCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCAt > 3:129713/1‑149 (MQ=255) cTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCTTGCCCTATGCGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGTACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCa < 7:320532/147‑1 (MQ=255) cTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGt > 6:129631/1‑149 (MQ=255) cTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGt > 3:262544/1‑149 (MQ=255) ctctACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCAc > 5:262411/1‑149 (MQ=255) ctctACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGCCAc < 8:253890/149‑1 (MQ=255) tctACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCa > 8:2576/1‑143 (MQ=255) tctACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCa < 7:2576/143‑1 (MQ=255) ctACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGc > 2:264232/1‑149 (MQ=255) tACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGGCCTCAGGCACGCt > 6:31062/1‑149 (MQ=255) aggGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGccc < 6:311865/149‑1 (MQ=255) aTGGCCCGACAAGCTCGCATTAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTg < 6:262411/149‑1 (MQ=255) aTGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACtt < 5:129631/148‑1 (MQ=255) tGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGc < 4:262544/149‑1 (MQ=255) gCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCt > 1:65729/1‑149 (MQ=255) gCCCGAAAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCATGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGCTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATAAGACACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCt > 6:286751/1‑149 (MQ=39) ccGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTgc < 4:129713/149‑1 (MQ=255) gCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGa > 3:43473/1‑148 (MQ=255) gCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGTGGCGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAAt > 1:293535/1‑149 (MQ=255) gCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTc > 5:102362/1‑149 (MQ=255) cATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCt > 3:78457/1‑149 (MQ=255) gaTCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACa > 4:88388/1‑149 (MQ=255) tCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATg < 1:264232/149‑1 (MQ=255) cTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGctct > 7:293560/1‑149 (MQ=255) tCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGGTCTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGcc > 1:237653/1‑116 (MQ=255) tCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGcc < 2:237653/115‑1 (MQ=255) cTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCa > 4:84477/1‑149 (MQ=255) tAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCAt > 7:191943/1‑149 (MQ=255) aaGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCTGCAGAACTTCTGCACATGCTCGGGTCGAGCGCGCagg > 3:276899/1‑147 (MQ=37) aaGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATg > 3:89174/1‑149 (MQ=255) aGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATg < 4:89174/148‑1 (MQ=255) gACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCCCTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGGGGGGCCGCGCATgggt > 8:312396/1‑147 (MQ=38) tGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATtgc > 3:351685/1‑149 (MQ=255) ccTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGttt > 6:6966/1‑149 (MQ=255) tATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGGAGCAGCAATTCTGACCATGCTCTGTGGGCCCGGTCCTGGATTGCTGCggtggg > 8:322139/1‑144 (MQ=37) aTGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTggg > 7:23498/1‑149 (MQ=255) tGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCGATCAGTCACGCTTGCGCGCCCGACTTGCCTGCTGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTgg < 5:286751/147‑1 (MQ=255) tGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTggg < 3:154175/148‑1 (MQ=255) tGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTgg < 5:140382/147‑1 (MQ=255) ggCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTa < 3:372457/148‑1 (MQ=255) cccGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGTGCGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTAt > 7:51775/1‑148 (MQ=255) cccGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTATGa < 3:88388/149‑1 (MQ=255) g‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTATGACTCa < 8:51775/149‑1 (MQ=255) tGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGGTGCGTTTGGGTATGACTCAg > 6:219525/1‑148 (MQ=255) tGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTATGACTCAg > 5:67733/1‑148 (MQ=255) gTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTATGACTCatgccta > 5:5064/1‑143 (MQ=255) gTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTATGACTCAGAACga < 4:147041/149‑1 (MQ=255) gTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTATGACTCAGAACga < 5:202297/149‑1 (MQ=255) cGAGACGT‑CGACACCGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTATGACTCAGAACGAGACAGc > 5:195818/1‑149 (MQ=255) gagaCGT‑CGACACCGTCGACGGCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGt < 6:259171/128‑1 (MQ=255) gagaCGT‑CGACACCGTCGACGGCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTAGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGt > 5:259171/1‑128 (MQ=255) gACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTATGACTCAGAACGAGACAGCGAAGAAGc > 4:105127/1‑148 (MQ=255) | CCAGGGCCTGGTGACGGTAAGCCACTGCTCGCTTCTGCTCTACGCGAGGAGGGTAATGGCCCGACAAGCTCGCATGAGATCGCCTAGCAGATCTTGCTAAGGACTGCGTGCCCTATGGGCCCGG‑CTGT‑‑CGTGAACCGAGCCGT‑CGACGGTGTCGACGTCTCGGCCCTCCGGGCAGCCATCAGTCACGCTTGCGCGCCCCACTTGCCTGCAGCAGAAATTCTGAACATGCTCTGTTCGACCGCTCATGGATTGCTGCGTTTGGGTATGACTCAGAACGAGACAGCGAAGAAGC > NC_002947/4196145‑4196436 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |