Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,265,951 | C→G | 5.6% | D170H (GAC→CAC) | PP_3738 ← | transcriptional regulator VanR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,265,951 | 0 | C | G | 5.6% | 226.3 / 3.8 | 71 | D170H (GAC→CAC) | PP_3738 | transcriptional regulator VanR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/33); new base G (2/2); total (36/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.50e-01 |
TCGGCATAGCGCAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAGTCGTCTTCGCTC > NC_002947/4265803‑4266096 | tCGGCATAGCGCAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGACAGATCATGGCGGTc > 8:93208/1‑149 (MQ=255) gCATAGCGCAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCAc > 3:295170/1‑149 (MQ=255) aTAGCGCAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCg > 7:183690/1‑149 (MQ=255) cgcAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAg > 6:316172/1‑149 (MQ=255) gcAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCAGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGt > 5:329648/1‑149 (MQ=255) gcAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTGCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCCGGGCGTCGAACACGGCGGGGGGCTGCATATGGGCGCAGTTGACGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCCCCGCCAGt > 5:329653/1‑149 (MQ=255) cAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCTGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTg < 4:156869/149‑1 (MQ=255) aaGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTGGACCGCCatgat < 8:174152/149‑5 (MQ=255) gTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGt > 4:348919/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGAcc > 6:150350/1‑148 (MQ=255) ggCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAg < 5:274545/148‑1 (MQ=255) gCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAgg < 6:216885/148‑1 (MQ=255) gCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGc < 5:131160/149‑1 (MQ=255) gCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGc < 5:316172/149‑1 (MQ=255) cGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGc > 3:368028/1‑148 (MQ=255) gTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑Ga < 4:295170/149‑1 (MQ=255) gCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAAt < 4:25482/149‑1 (MQ=255) cgcgCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGGGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGc < 5:374562/149‑1 (MQ=255) gcgcATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATgg > 2:221801/1‑147 (MQ=255) cgcATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAg < 2:295902/149‑1 (MQ=255) tGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTGGACCGCCa > 8:131214/1‑120 (MQ=255) tGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTGGACCGCCa < 7:131214/120‑1 (MQ=255) gATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGAt > 2:172589/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGtt < 7:93208/149‑1 (MQ=255) gCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGt < 3:185850/148‑1 (MQ=255) cTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTg < 1:172589/149‑1 (MQ=255) ttCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTgc > 4:357730/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTgc > 6:2140/1‑149 (MQ=255) ggCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTgcgc < 6:299826/148‑1 (MQ=255) cACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCATGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGc > 7:55902/1‑148 (MQ=255) cccTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAAc > 3:41837/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCaatg > 7:267092/1‑147 (MQ=255) ccTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACg > 2:83468/1‑149 (MQ=255) cTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACgg < 1:221801/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACgg > 5:230381/1‑148 (MQ=255) ggCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGc > 3:176873/1‑148 (MQ=255) cGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAAt < 4:176873/149‑1 (MQ=255) ttGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGc < 5:150350/149‑1 (MQ=255) aCCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATCCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCgg < 5:272508/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCggg < 3:357730/149‑1 (MQ=255) gCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTtgtg > 3:300119/1‑149 (MQ=255) ggCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCga < 4:368028/149‑1 (MQ=255) gtgCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCa > 2:311181/1‑149 (MQ=255) ctgcATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAAt < 2:366589/117‑1 (MQ=255) gcATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCGCCCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCtg < 1:83468/149‑1 (MQ=255) gcATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGCTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCAGCtga > 5:201818/1‑149 (MQ=255) cATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGcc < 6:281370/118‑1 (MQ=255) cATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGcc > 5:281370/1‑118 (MQ=255) cATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCtgat > 4:103717/1‑149 (MQ=255) cATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCtga < 8:183690/148‑1 (MQ=255) cATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCAAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCtgat > 5:345125/1‑149 (MQ=255) atGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCgg < 4:306750/62‑1 (MQ=255) atGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCgg > 3:306750/1‑62 (MQ=255) gCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAgcg < 3:103717/149‑1 (MQ=255) cGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAgcgc < 3:348919/149‑1 (MQ=255) aaGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCAt > 8:151653/1‑149 (MQ=255) gTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCg > 5:125682/1‑121 (MQ=255) tGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCATTGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGtt > 3:67624/1‑148 (MQ=255) tGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCATTGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGtt > 3:72598/1‑148 (MQ=255) gAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTc < 7:151653/148‑1 (MQ=255) aaGCGCCGGTTTTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGGGATCGTGGCGCG‑CCAGGGCAACGGAAATGGCCGGGTTGGGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAg < 6:329653/149‑1 (MQ=255) aaGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCGAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCATGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAg < 6:329648/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGt > 6:188036/1‑149 (MQ=255) ccGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGt > 8:329546/1‑149 (MQ=255) ccGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGt < 6:230381/149‑1 (MQ=255) gcgAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAATGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCt < 8:267092/149‑1 (MQ=255) gcgAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCt > 1:333540/1‑149 (MQ=255) gcgAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGAGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCACGTCGAGATAGACCt > 4:178396/1‑149 (MQ=255) gATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGCAGAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAgtc > 1:67555/1‑149 (MQ=255) actGGCGGTGGACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGAGGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAGTCGTCt > 3:19530/3‑149 (MQ=255) tGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAGTCGTCTTc < 2:333540/149‑1 (MQ=255) ggTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAGTCGTCTTCGCTc < 5:2140/149‑1 (MQ=255) | TCGGCATAGCGCAAGGTGGCATTGGCGTGCTCGCGCATGATCGCTTCGGCGCGGGCACCCTGGCGGTTGACCAGGGCGTCGAACACGGCGTGGTGCTGCATATGGGCGAAGTTGAAGCGCCGGTATTCGCGAGCCAGATCATGGCGGTCCACCGCCAGTGCGGTGACCGAGGC‑GAATGGCAGGTGATCGTTGCGCG‑CCAGGGCAACGGCAATGGCCGGGTTGTGGCTGGCGTCGATGATCACCTGATGAAAGCGCATGTTCAGGTCGTGATAGACCTGCAAGTCGTCTTCGCTC > NC_002947/4265803‑4266096 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |