| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,398,901 | C→G | 6.6% | intergenic (‑45/+17) | PP_3877 ← / ← PP_3878 | hypothetical protein/minor capsid protein C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,398,901 | 0 | C | G | 6.6% | 233.5 / 4.1 | 73 | intergenic (‑45/+17) | PP_3877/PP_3878 | hypothetical protein/minor capsid protein C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/33); new base G (3/2); total (38/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGTCCACCGCAAGTTGCGG > NC_002947/4398758‑4399043 | cgcgCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTGACTGc > 8:177646/1‑149 (MQ=255) tGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCagcg > 8:166338/1‑148 (MQ=255) aGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGt < 7:166338/149‑1 (MQ=255) aGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGt > 7:39988/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGCGAAATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGt > 1:113470/1‑147 (MQ=255) aGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGt < 7:352505/149‑1 (MQ=255) cGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTg < 5:193293/149‑1 (MQ=255) ggCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTga < 7:122839/149‑1 (MQ=255) ggCATCCAGCTGTTCCAGGGACTGGATCTGAACATTGATTGTGGCGCGTTCGTTAGGC‑‑AATTTTGTTACGAGGTACATGCTGCCTCCTTTGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCTGTTGTGGTCTCTTCCGCGAACGCGGTCAGAGTTga < 2:278203/149‑1 (MQ=255) cAGCTGGGCCATGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCTCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACTAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCag < 3:305433/137‑1 (MQ=255) cAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCag > 4:305433/1‑137 (MQ=255) agatGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGaa < 4:176944/146‑1 (MQ=255) gCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAAt < 3:83765/149‑1 (MQ=255) ccAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCg > 4:254957/1‑147 (MQ=255) cAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAg < 2:220011/149‑1 (MQ=255) gACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCg < 8:324629/149‑1 (MQ=255) cTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAg < 8:181589/149‑1 (MQ=255) tGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAgg > 6:166190/1‑149 (MQ=255) tGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAgg > 5:256467/1‑149 (MQ=255) ggATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGc < 3:39545/149‑1 (MQ=255) gATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAgg < 3:254957/147‑1 (MQ=255) tGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCa > 3:267887/1‑149 (MQ=255) ggccATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGCGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTGACTGCCGCGCACGCGGTCAGAGTTGAGACTGCATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCAc > 5:19852/3‑149 (MQ=255) gACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTGACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCAc > 5:19853/1‑149 (MQ=255) gACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCAc > 8:316633/1‑149 (MQ=255) gACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCAc > 3:153384/1‑149 (MQ=255) ccttGCTAGTGGCGCGGTCGCCACGC‑‑AATTGCCTTACGTCGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCt < 6:361744/147‑1 (MQ=255) cATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCt > 3:302751/1‑149 (MQ=255) ttGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGa > 3:42617/1‑149 (MQ=255) aTAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTGACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATg < 6:19853/148‑1 (MQ=255) aTAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATgc > 4:359966/1‑149 (MQ=255) aTAGGGGCGCGTGCGCTACGC‑‑AATTGAGTTCCGAGGGACATGCTGCCGCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTGACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATg < 6:19852/148‑1 (MQ=255) gTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATgcgc < 2:113470/148‑1 (MQ=255) 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tACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCtgtg < 5:61926/142‑1 (MQ=255) tACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCgg > 7:256803/1‑149 (MQ=255) cGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCgg < 2:282360/147‑1 (MQ=255) gC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGcc < 7:316633/149‑1 (MQ=255) aaTTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCt > 4:344870/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGa > 4:59401/1‑149 (MQ=255) ttGAGTTACGAGGGACATGCGGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGa < 8:350527/149‑1 (MQ=255) aCGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTgcg > 6:228700/1‑149 (MQ=255) cGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTgcg > 6:217627/1‑148 (MQ=255) aGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCAc > 8:273529/1‑149 (MQ=255) ggACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGa > 4:21418/1‑149 (MQ=255) ggACATGCTGCCTCATGGGCATAAAAAAACCTCCATCAGGCGGGTGTGGTCACTGCAGCGAACGCCGTCAGAGATGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGAACGCTGATGCGCTGCTGAGTTTGCGGGCCCTCACGCTGCGCACGa > 8:93142/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGa < 3:344870/149‑1 (MQ=255) ctgcCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAgg < 3:21418/148‑1 (MQ=255) ctgcCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAgg < 3:359966/148‑1 (MQ=255) ctGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGtt > 6:120445/1‑61 (MQ=255) 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aaaaaaaCCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCga > 2:32332/1‑147 (MQ=255) aaCCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTg < 4:153384/149‑1 (MQ=255) aCCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGt < 3:363720/149‑1 (MQ=255) ccGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGTc > 3:263662/1‑149 (MQ=255) cGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGTc > 2:359497/1‑148 (MQ=255) cGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGTc > 1:172419/1‑148 (MQ=255) gCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGGCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCTCTCGCGTGCGGTTGccct < 4:267887/149‑2 (MQ=255) ccATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGACAACCTCTCGCGTGCGGTTGccctc < 7:177646/149‑3 (MQ=255) aTCAGGCGGTTGTGGTCACTACCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGAGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGTCCACCg > 6:90840/1‑149 (MQ=255) aGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGTCCACCGCaa < 7:273529/149‑1 (MQ=255) ggCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGTCCACCGCAAg > 6:183517/1‑149 (MQ=255) gCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGTCCACCGCAAGt > 3:286204/1‑149 (MQ=255) gTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGTCCACCGCAAGTTgcgg > 3:282459/1‑145 (MQ=255) gTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGTCCACCGCAAGTTgcgg < 4:282459/145‑1 (MQ=255) | CGCGCTGAGCGCAGTACCAGCGGCCTCCAGCTGGGCCAGGGACTGGATCTGACCATTGATAGTGGCGCGTTCGCTACGC‑‑AATTGAGTTACGAGGGACATGCTGCCTCCTGGGCATAAAAAAACCGCCATCAGGCGGTTGTGGTCACTGCCGCGAACGCGGTCAGAGTTGAGACTGAATGGCGAAGGCCGAGGCCCGCACGCTGATGCGCTGCTGTGTTTGCGGGCCCTGACGCTGCGCACGACTGAGGGCAACCGCACGCGAGAGGTTGTCCACCGCAAGTTGCGG > NC_002947/4398758‑4399043 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |