| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 367,367 | T→G | 11.3% | intergenic (‑53/+21) | PP_5442 ← / ← PP_0306 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 367,367 | 0 | T | G | 11.3% | 177.4 / 13.3 | 70 | intergenic (‑53/+21) | PP_5442/PP_0306 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/29); new base G (5/3); total (38/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 | |||||||||||
TGCAAATCTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCGGGTAGAGGTTTTGT > NC_002947/367220‑367515 | tGCAAATCTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGctc > 6:100536/1‑149 (MQ=255) ttCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGAGCGCGCTGGTAccc > 3:350783/1‑149 (MQ=255) cccATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGAGCGCGCTGGTAcc < 4:317843/146‑1 (MQ=255) cccATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGAGCGCGCTGGTACCCg < 4:350783/148‑1 (MQ=255) cATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAGCAACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGc < 1:40262/149‑1 (MQ=255) aTCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGc > 4:148562/1‑148 (MQ=255) aTCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGAATCGTCCATGTGGCATTGCTCCATGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCAGGTACCCCGCCTCGc > 1:117217/1‑148 (MQ=255) aGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGAGCGCGCTGGTACCCg > 8:169038/1‑137 (MQ=255) aGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGAGCGCGCTGGTACCCg < 7:169038/137‑1 (MQ=255) gtgtCATCCAGGTCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCa < 7:245038/149‑1 (MQ=255) tCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGa > 4:127452/1‑148 (MQ=255) tCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGa < 7:27643/148‑1 (MQ=255) ccAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCg < 2:334797/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCga < 4:309668/149‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGaaa < 3:148562/149‑1 (MQ=255) gcAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAAcg > 8:59041/1‑149 (MQ=255) gCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACAAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAAcgcgac > 8:171328/1‑147 (MQ=255) ttGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGcc > 6:86305/1‑147 (MQ=255) ttGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGcc > 3:190505/1‑147 (MQ=255) gATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCACTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAg < 6:331306/148‑1 (MQ=255) cTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGc < 5:221932/149‑1 (MQ=255) ttAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGcc > 6:13487/1‑149 (MQ=255) aGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGcc < 5:86305/147‑1 (MQ=255) ccGCTCCTCGAATTTTCGGGTGTCCAGTCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTTGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCttt < 6:32693/148‑1 (MQ=255) ctcctcGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGAtc < 3:204322/149‑1 (MQ=255) ctcGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGAtcttc < 7:59041/149‑1 (MQ=255) ctcGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGAtcttc < 1:224285/149‑1 (MQ=255) gAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGGTGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCCGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCa > 1:309058/1‑149 (MQ=255) gAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGCGAGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGAtcttct > 1:292750/1‑148 (MQ=255) gAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTtctc < 2:273549/148‑1 (MQ=255) atatTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCAtt < 5:100536/149‑1 (MQ=255) tatTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCt > 1:365812/1‑134 (MQ=255) tatTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCt < 2:365812/134‑1 (MQ=255) tatTCGGGTATCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTc < 4:6600/149‑1 (MQ=255) ttCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTca > 5:31908/1‑148 (MQ=255) cGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTcac > 8:160019/1‑147 (MQ=255) gtgtCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCga < 5:365098/107‑1 (MQ=255) gtgtCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCga > 6:365098/1‑107 (MQ=255) tgtCCATGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTc < 4:190505/149‑1 (MQ=255) tgtCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTc < 7:160019/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACg > 2:76689/1‑149 (MQ=255) gCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCa < 6:31908/149‑1 (MQ=255) tCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGc > 3:144397/1‑149 (MQ=255) aTCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATATCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCAtt > 7:192580/1‑127 (MQ=255) aTCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCAtt < 8:192580/127‑1 (MQ=255) aTCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTc > 8:286439/1‑148 (MQ=255) gTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATATCGAGAAACGCGCCGAGGTCGACTTTGATCTTCTCATTCACAACGTCAAGTGCATCGTCGAAg > 1:152821/1‑149 (MQ=255) ccATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGTCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGt > 1:91384/1‑148 (MQ=255) cATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAgaga > 5:96843/1‑149 (MQ=255) aTTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCt > 2:251215/1‑149 (MQ=255) aTTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCt > 7:136873/1‑149 (MQ=255) gCTCCTTGGTGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGa < 2:309058/148‑1 (MQ=255) cTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTg > 5:372344/1‑149 (MQ=255) atggatgC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCtt > 7:245968/1‑149 (MQ=255) gatgC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCttgt < 1:76689/148‑1 (MQ=255) tgC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGc < 8:136873/149‑1 (MQ=255) aGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCg > 6:24103/1‑147 (MQ=255) aGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGaa < 4:144397/149‑1 (MQ=255) gATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCGCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAg > 2:218230/1‑149 (MQ=255) gACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTAACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCGGAACGTGCCTTGGTGCGAAgcgc > 8:281536/1‑149 (MQ=255) aCCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGTTAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAgcgc < 2:117217/148‑1 (MQ=255) ccAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCATCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGa > 1:340149/1‑149 (MQ=255) ccAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGa < 2:292750/149‑1 (MQ=255) ccAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGa > 8:160277/1‑149 (MQ=255) gcgaggccGGGTACCAGAGCGCGCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGa > 7:46514/7‑149 (MQ=255) cAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGa > 4:303815/1‑148 (MQ=255) aggccGGGTACCAGAGCGCGCTGGTACCCGGCCTCGCTAGTCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCCTGTTGCGAAGCGCGa > 8:259570/4‑146 (MQ=255) gggTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGAcgcg > 6:63763/1‑149 (MQ=255) ggTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCgg > 3:102614/1‑149 (MQ=255) ggTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCgg > 3:97348/1‑149 (MQ=255) gTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCggg < 5:24103/149‑1 (MQ=255) tctGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCGGGTAGAGGTTTTGt > 2:247853/1‑149 (MQ=255) tctGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCGGGTAGAGGTTTTGt > 5:330749/1‑149 (MQ=255) tctGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACACGGGTAGAGGTTTTGt > 3:335470/1‑149 (MQ=255) | TGCAAATCTTCCCATGTATCGAGTGTCAGCCAGGGCGCAGGCTTGATGCTTAGCCGCTCCTCGAATATTCGGGTGTCCAGGCTCGTATCGTCCATGTGGCATTGCTCCTTGATGGATGC‑AGATGACCAG‑AACCGGGTACCAGCGCGCTCTGGTACCCGGCCTCGCTAATCAGATAGCGAGAAACGCGCCGAGGTCGCCTTTGATCTTCTCATTCACAAGGTCACGTGCAGCGTCGAAGTGACGAACGCTGAACGTGCCTTGTTGCGAAGCGCGATAGACGCGGGTAGAGGTTTTGT > NC_002947/367220‑367515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |