Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,734,032 | G→T | 7.2% | R535S (CGC→AGC) | sucA ← | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,734,032 | 0 | G | T | 7.2% | 208.6 / 5.9 | 70 | R535S (CGC→AGC) | sucA | 2‑oxoglutarate dehydrogenase subunit E1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/35); new base T (2/3); total (32/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.30e-01 |
CTGACGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACGGGTAGTGCGCT > NC_002947/4733892‑4734178 | cTGACGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCt > 4:150230/1‑149 (MQ=255) gACGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTcc > 3:334422/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACCGCGAGCTGTTCgtcga < 4:186408/147‑5 (MQ=255) aCGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTcc < 5:345248/148‑1 (MQ=255) aCGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTcc < 3:232652/148‑1 (MQ=255) aCGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCt < 8:78086/149‑1 (MQ=255) cGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCtt < 5:329541/149‑1 (MQ=255) tGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGAc > 5:233359/1‑149 (MQ=255) cACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACCAACAGCTCGCGCTTCGCCTCCTTGACCAGGc > 4:113611/1‑149 (MQ=255) agctcTTCCGGCAGCTGGAGCTGCTTGGCCGACAGATCGTGCTGTGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGTCGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCtttt < 6:234101/145‑1 (MQ=255) aaaCCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCtttt < 3:194365/149‑1 (MQ=255) atccTTCCGGCCGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCttttt < 2:294463/147‑1 (MQ=255) aagcTTCCGGCAGCTCGAGCTGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGTGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCttttt < 7:127924/146‑1 (MQ=255) aaCCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACCGCGAGCTGTTCgtc > 7:201170/1‑129 (MQ=255) aaCCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACCGCGAGCTGTTCgtc < 8:201170/131‑3 (MQ=255) ccTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGTTCGTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGATGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTAc < 8:192188/149‑1 (MQ=255) cTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTAcc < 3:38813/149‑1 (MQ=255) cTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTAcc < 3:34132/149‑1 (MQ=255) cTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTAc > 2:83290/1‑148 (MQ=255) ttCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACACATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGACGTGACGCGAGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCAAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCtttt > 5:234101/1‑144 (MQ=255) ccGGCAGCTCGCCCAGCTTGGCCGAACGATCCTTCAGGGTCTTGAGGTCGCAACGGGTGGCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCATGGACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTTACCAGGCTTTTTACCa < 4:62101/147‑1 (MQ=255) ccGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCa < 4:334422/147‑1 (MQ=255) ccGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCa < 6:319961/147‑1 (MQ=255) gCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCCGGTACGGACGCCAGTCGCCGAACAGGTCGCGGTGCGGCTCCTGGCCGAGGCGTTTTGCCACGTGc > 4:8164/1‑149 (MQ=255) gCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCTTTGACCAGGCTTTTTACCACGTg > 4:57773/1‑148 (MQ=255) ccGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGATACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTa > 1:35759/1‑123 (MQ=255) ccGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTa < 2:35759/123‑1 (MQ=255) gACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCttttt < 5:58866/120‑1 (MQ=255) gACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCttttt > 6:58866/1‑120 (MQ=255) gACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGtt > 1:198238/1‑149 (MQ=255) aGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCg < 2:198743/149‑1 (MQ=255) aTCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCgg > 8:130272/1‑148 (MQ=255) cTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACt < 1:222335/149‑1 (MQ=255) cAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACtcgt > 5:328339/1‑149 (MQ=255) cAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACtcgt < 6:233359/149‑1 (MQ=255) ggTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGa > 6:79060/1‑149 (MQ=255) tCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATc < 3:303771/149‑1 (MQ=255) ttGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCtt < 3:150230/149‑1 (MQ=255) aGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTgg < 2:198238/148‑1 (MQ=255) gAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTcc > 4:41115/1‑79 (MQ=255) gAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTcc < 3:41115/79‑1 (MQ=255) gAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAg > 1:27279/1‑149 (MQ=255) gAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAg > 1:140849/1‑149 (MQ=255) cGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAgcgcg < 2:140849/149‑1 (MQ=255) tCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGc > 7:325423/1‑149 (MQ=255) gcGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGc < 5:33437/148‑1 (MQ=255) gTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGt < 2:27279/149‑1 (MQ=255) gTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGt > 2:295426/1‑149 (MQ=255) tGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTc > 5:366494/1‑149 (MQ=255) cgcgcgGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGAt < 7:130272/149‑1 (MQ=255) gcgcgGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATg > 2:140856/1‑149 (MQ=255) cgcgGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGc < 6:328339/149‑1 (MQ=255) gcgGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGTCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTg < 1:340475/105‑1 (MQ=255) gcgGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGACTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTg > 2:340475/1‑105 (MQ=255) cgGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCTTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGa < 3:57773/149‑1 (MQ=255) cAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGc > 5:38552/1‑149 (MQ=255) aGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGcc > 4:214676/1‑149 (MQ=255) ggCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGAt > 7:30522/1‑148 (MQ=255) gCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTg < 5:44438/79‑1 (MQ=255) gCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTg > 6:44438/1‑79 (MQ=255) gCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCa < 3:113611/149‑1 (MQ=255) ccAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGAGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAgc > 3:285961/1‑149 (MQ=255) cGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCg < 5:79060/148‑1 (MQ=255) gACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCa < 1:295426/149‑1 (MQ=255) gTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCt > 1:41045/1‑149 (MQ=255) tCGACCAACAGCTCGAGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACAACCTGCAGGCCATTCTCCAGAGCGTTGCCGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGAGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGACTGGATCAGATGCTCGGCATACAGCt > 8:82218/1‑148 (MQ=255) gagccgaACCGCGAGCTGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCt > 4:28077/5‑148 (MQ=255) agccgaACCGCGAGCTGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCa < 3:28077/146‑1 (MQ=255) gaACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACggg > 4:317811/1‑149 (MQ=255) aCAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACGGGTa < 3:8164/149‑1 (MQ=255) gcgGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACGGGTAGTgcgc < 1:140856/148‑1 (MQ=255) gcgGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACGGGTAGTTCgct > 6:186098/1‑149 (MQ=255) | CTGACGCTGGACCACGAAACCTTCCGGCAGCTCGAGCAGCTTGGCCGACAGATCCTGCAGGGTCTTGAGGTCGAAACGGGTGTCGTGACGCGCGGTCCAGGCATGGCCCAGGTACGGACGCCAGTCGACGAACAGCTCGCGGTTCGGCTCCTTGACCAGGCTTTTTACCACGTGCAGGCCATTGTCCAGCGCGTTGCGGTACTCGTCGATCTTGGCCTGAGCGCGCTCGGCGTCGATGCGACCGGCCTGGATCAGCTGCTCGGCATACAGCTCACGGGTAGTGCGCT > NC_002947/4733892‑4734178 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |