| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,182,065 | T→G | 19.7% | intergenic (‑123/+31) | PP_4560 ← / ← csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,182,065 | 0 | T | G | 19.7% | 155.0 / 32.1 | 81 | intergenic (‑123/+31) | PP_4560/csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/24); new base G (8/7); total (47/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.32e-01 | |||||||||||
CCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAACAC > NC_002947/5181920‑5182211 | ccGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCAc > 5:332512/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGAGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCAccc > 1:194494/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCgag < 6:332512/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGcgaa < 4:74546/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGagaa < 3:115327/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGGCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGagaa < 2:263903/149‑1 (MQ=255) gTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCgag > 4:121007/1‑146 (MQ=255) gTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCgag > 3:67753/1‑146 (MQ=255) tCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGcgaaga < 3:328955/149‑1 (MQ=255) gggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCAccc < 2:82670/139‑1 (MQ=255) gggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCAccc < 2:77148/139‑1 (MQ=255) gggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCAccc > 1:77148/1‑139 (MQ=255) gggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCAccc > 1:82670/1‑139 (MQ=255) ggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑c < 1:287830/149‑1 (MQ=255) tAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGc > 8:86918/1‑148 (MQ=255) gTCTCCTTTCGCCGCTTGATCTTAACACCGCAACGTATAATACACCGGCCCCGCGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTT‑AAC‑AATTTGCTTACCAAAAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTCCACCCTAGAAGTGG‑CCGGCACCGCCtcaa < 2:9745/149‑1 (MQ=255) tttCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCgg > 6:218634/1‑132 (MQ=255) tttCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCgg < 5:218634/132‑1 (MQ=255) aTCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAC‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCAcc < 5:345190/148‑1 (MQ=255) ttACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATc > 3:25062/1‑149 (MQ=255) acaGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTc > 5:214011/1‑149 (MQ=255) acaGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CAGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCCCATCCtt > 5:208858/1‑148 (MQ=255) aGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAGAAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTATTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGATTCTTCACCGCATCCTTc > 1:103558/1‑148 (MQ=255) aGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCAACCTTca > 2:171003/1‑148 (MQ=255) tCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGTTTG‑AAG‑AATTTGCTTACTAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCAc < 1:225781/131‑1 (MQ=255) tCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCACGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTccc > 3:258511/1‑149 (MQ=255) tAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCtt > 6:23330/1‑149 (MQ=255) gACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑Cct > 3:283038/1‑149 (MQ=255) cGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAagag > 4:72113/1‑88 (MQ=37) cGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAagag < 3:72113/88‑1 (MQ=37) cGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑Cctgct > 7:124131/1‑149 (MQ=255) aGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTACTGcg‑c‑ctcg > 3:66555/1‑149 (MQ=255) gtgCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑ATG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCtt > 4:50948/1‑149 (MQ=255) tgctgcTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCttt > 7:104055/1‑149 (MQ=255) gctgctCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGcg‑c‑ctc > 1:39173/1‑142 (MQ=255) gctgctCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGcg‑c‑ctc < 2:39173/142‑1 (MQ=255) ctgctCCCGGCCGTGGTTG‑ATG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTg < 3:50948/148‑1 (MQ=255) ctgctCCCGGCCGTGGTTC‑AAT‑ATTTTGCTTACGAATACGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGCCCCCGAGAAGTGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGa < 4:67753/149‑1 (MQ=255) tgctCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAg > 8:203652/1‑149 (MQ=255) tCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCg > 3:319652/1‑73 (MQ=255) tCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCg < 4:319652/73‑1 (MQ=255) tCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTc > 7:103334/1‑149 (MQ=255) ccGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCt > 7:209023/1‑149 (MQ=255) ggCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTgc < 7:86918/149‑1 (MQ=255) cGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCgcc > 2:283126/1‑149 (MQ=255) g‑aag‑aaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTGCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑ATCGCCTTTGAGCTCCTGAgcctttcctt > 7:129235/1‑149 (MQ=255) g‑aag‑aaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCgccttgcctt > 7:134404/1‑149 (MQ=255) aag‑aaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCgccttgcctt < 4:283038/148‑1 (MQ=255) acaaTTTCCTAACGAATACGGGCCGGCCTCTCCGCGGGTCCACCCGACAAGCGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCg < 8:55574/147‑1 (MQ=255) aCGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGc < 1:105196/147‑1 (MQ=255) aaTAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTc < 3:121007/149‑1 (MQ=255) aaTAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTc < 6:214011/149‑1 (MQ=255) atcctggCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCGTATAAGTGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTc < 6:208858/142‑1 (MQ=255) aTAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCg > 6:150598/1‑149 (MQ=255) aGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTg < 3:281633/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTc < 2:103558/149‑1 (MQ=255) 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7:104402/1‑108 (MQ=38) ctTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTgc < 8:104402/108‑1 (MQ=38) ttCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTg > 6:360708/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTg > 7:203200/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTg > 4:128061/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTg > 1:6700/1‑149 (MQ=255) cgcgGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGc < 8:103334/148‑1 (MQ=255) gcgGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGAAGGTGAAGGGGATGATGAG‑CACACCACTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCgg > 1:122949/1‑149 (MQ=255) gTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAacac < 5:150598/149‑1 (MQ=255) gTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAacac > 4:145459/1‑149 (MQ=255) | CCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAACAC > NC_002947/5181920‑5182211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |