| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,182,072 | A→C | 18.1% | intergenic (‑130/+24) | PP_4560 ← / ← csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,182,072 | 0 | A | C | 18.1% | 138.9 / 32.1 | 72 | intergenic (‑130/+24) | PP_4560/csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/25); new base C (9/4); total (43/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.41e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.12e-01 | |||||||||||
CAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAACACCCTGTT > NC_002947/5181925‑5182217 | cAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCgag < 6:332512/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGcgaa < 4:74546/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGagaa < 3:115327/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGGCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGagaa < 2:263903/149‑1 (MQ=255) gTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCgag > 3:67753/1‑146 (MQ=255) gTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCgag > 4:121007/1‑146 (MQ=255) tCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGcgaaga < 3:328955/149‑1 (MQ=255) ggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑c < 1:287830/149‑1 (MQ=255) tAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGc > 8:86918/1‑148 (MQ=255) gTCTCCTTTCGCCGCTTGATCTTAACACCGCAACGTATAATACACCGGCCCCGCGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTT‑AAC‑AATTTGCTTACCAAAAAGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTCCACCCTAGAAGTGG‑CCGGCACCGCCtcaa < 2:9745/149‑1 (MQ=255) tttCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCgg < 5:218634/132‑1 (MQ=255) tttCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCgg > 6:218634/1‑132 (MQ=255) aTCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAC‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCAcc < 5:345190/148‑1 (MQ=255) ttACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATc > 3:25062/1‑149 (MQ=255) acaGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTc > 5:214011/1‑149 (MQ=255) acaGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CAGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCCCATCCtt > 5:208858/1‑148 (MQ=255) aGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAGAAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTATTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGATTCTTCACCGCATCCTTc > 1:103558/1‑148 (MQ=255) aGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCAACCTTca > 2:171003/1‑148 (MQ=255) tCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGTTTG‑AAG‑AATTTGCTTACTAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGGCCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCAc < 1:225781/131‑1 (MQ=255) tCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCACGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTccc > 3:258511/1‑149 (MQ=255) tAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCtt > 6:23330/1‑149 (MQ=255) gACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑Cct > 3:283038/1‑149 (MQ=255) cGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAagag < 3:72113/88‑1 (MQ=37) cGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAagag > 4:72113/1‑88 (MQ=37) cGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑Cctgct > 7:124131/1‑149 (MQ=255) aGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTACTGcg‑c‑ctcg > 3:66555/1‑149 (MQ=255) gtgCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑ATG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCtt > 4:50948/1‑149 (MQ=255) tgctgcTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCttt > 7:104055/1‑149 (MQ=255) gctgctCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGcg‑c‑ctc > 1:39173/1‑142 (MQ=255) gctgctCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGcg‑c‑ctc < 2:39173/142‑1 (MQ=255) ctgctCCCGGCCGTGGTTG‑ATG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTg < 3:50948/148‑1 (MQ=255) ctgctCCCGGCCGTGGTTC‑AAT‑ATTTTGCTTACGAATACGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTGCCCCCGAGAAGTGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGa < 4:67753/149‑1 (MQ=255) tgctCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAg > 8:203652/1‑149 (MQ=255) tCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCg < 4:319652/73‑1 (MQ=255) tCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCg > 3:319652/1‑73 (MQ=255) tCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTc > 7:103334/1‑149 (MQ=255) ccGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCt > 7:209023/1‑149 (MQ=255) ggCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTgc < 7:86918/149‑1 (MQ=255) cGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCCTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCgcc > 2:283126/1‑149 (MQ=255) g‑aag‑aaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTGCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑ATCGCCTTTGAGCTCCTGAgcctttcctt > 7:129235/1‑149 (MQ=255) g‑aag‑aaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCgccttgcctt > 7:134404/1‑149 (MQ=255) aag‑aaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCgccttgcctt < 4:283038/148‑1 (MQ=255) acaaTTTCCTAACGAATACGGGCCGGCCTCTCCGCGGGTCCACCCGACAAGCGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCg < 8:55574/147‑1 (MQ=255) aCGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGc < 1:105196/147‑1 (MQ=255) aaTAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTc < 3:121007/149‑1 (MQ=255) aaTAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTc < 6:214011/149‑1 (MQ=255) atcctggCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCGTATAAGTGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTc < 6:208858/142‑1 (MQ=255) aTAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCg > 6:150598/1‑149 (MQ=255) aGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTg < 3:281633/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTc < 2:103558/149‑1 (MQ=255) gCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCg > 3:280100/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCTCTGCGCGGGTCCCCCCCACATGTGC‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCg < 1:171003/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAATTGG‑CCGGCACCGCCTCAACTCAATGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTACCCTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCGCC‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGt < 1:283126/147‑1 (MQ=255) ccGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCgg > 3:366756/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCg < 4:25062/148‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGtt > 2:280321/1‑143 (MQ=255) cGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGtt < 1:280321/143‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGt > 7:143919/1‑149 (MQ=255) ggCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGt > 7:345754/1‑148 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATGCTGCG‑C‑ATCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGACTTCGGCCCGCAGCTTTTCTTTGTCTGt > 8:256212/1‑148 (MQ=255) gCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCGTTTCGTTGTAGGTCa > 1:360316/1‑149 (MQ=39) tctTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTgcg < 2:320823/110‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTgcg > 1:320823/1‑110 (MQ=255) tctTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCt > 7:66302/1‑149 (MQ=255) tctTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGCCACCGCCACAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCCTCCTTCACATTTACCATGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCT‑C‑ATCGCATTAGAACTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCt > 2:186581/1‑149 (MQ=255) ctTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTgc < 8:104402/108‑1 (MQ=38) ctTCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTgc > 7:104402/1‑108 (MQ=38) ttCTCGGGTGAACCCGCGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTg > 6:360708/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTg > 7:203200/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTg > 1:6700/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTg > 4:128061/1‑149 (MQ=255) cgcgGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGc < 8:103334/148‑1 (MQ=255) gcgGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGAAGGTGAAGGGGATGATGAG‑CACACCACTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCgg > 1:122949/1‑149 (MQ=255) gtgaaCCCGCGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACAATTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAacac > 1:298607/5‑149 (MQ=255) gTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAacac < 5:150598/149‑1 (MQ=255) gTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAacac > 4:145459/1‑149 (MQ=255) aCCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAACACCCTg > 3:207853/1‑149 (MQ=255) cccGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAACACCCTGt < 8:66302/149‑1 (MQ=255) ccGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCAAACACCCTGtt < 8:143919/149‑1 (MQ=255) | CAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTG‑AAG‑AATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGAAGAGG‑CCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTGCTGCG‑C‑CTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAACACCCTGTT > NC_002947/5181925‑5182217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |