| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,195,985 | G→A | 10.5% | S177L (TCG→TTG) ‡ | ybgJ ← | allophanate hydrolase subunit 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,195,985 | 0 | G | A | 10.5% | 208.3 / 10.6 | 76 | S177L (TCG→TTG) ‡ | ybgJ | allophanate hydrolase subunit 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/37); new base A (5/3); total (36/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.16e-01 | |||||||||||
ACATCACCACCCATGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTGCGAAGCCCAGGGCAAA > NC_002947/5195841‑5196133 | acaTCACCACCCATGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATAc > 5:230723/1‑149 (MQ=255)acaTCACCACCCATGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATAc > 8:336219/1‑149 (MQ=255) accaccCATGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTCTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGcc < 4:51720/148‑1 (MQ=255) caccCATGGCCAGGAATTCGCTCCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCggg < 4:288959/149‑1 (MQ=255) accCATGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGt < 2:72684/149‑1 (MQ=255) ccATGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAg < 3:304037/149‑1 (MQ=255) ccATGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAg < 7:76643/149‑1 (MQ=255) cATGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCAGCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAgg < 6:194555/149‑1 (MQ=255) cATGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAgg < 6:21671/149‑1 (MQ=255) cATGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCGCACGCTCACGGTCGCACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAgg > 3:267312/1‑149 (MQ=255) aTGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCCTACCCGGCAGTATCGCCGGGtggc < 5:369577/149‑4 (MQ=255) aTGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGgc > 6:50643/1‑149 (MQ=255) aTGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCAGTATCGCCGGGtggct < 3:202741/149‑5 (MQ=255) ccAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCggg < 5:37101/140‑1 (MQ=255) ccAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCggg > 6:37101/1‑140 (MQ=255) ccAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGgccgcc < 6:245179/149‑1 (MQ=255) cAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGAAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGccgccg > 1:362042/1‑149 (MQ=255) gAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGGCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGGGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCt < 6:196277/149‑1 (MQ=255) ttCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGgc < 2:288999/149‑1 (MQ=255) cTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTc < 7:336219/149‑1 (MQ=255) cgcgAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCg < 6:230723/147‑1 (MQ=255) gcgAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGc > 8:101184/1‑148 (MQ=255) gcgAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGATCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGc > 6:249807/1‑148 (MQ=255) cgAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCCGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCaa > 5:310082/1‑149 (MQ=255) gAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCt > 7:179011/1‑136 (MQ=255) gAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCt < 8:179011/136‑1 (MQ=255) aaCCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATAc < 2:83697/149‑1 (MQ=255) ggCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCAc < 7:101184/149‑1 (MQ=255) gCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACg < 5:124349/149‑1 (MQ=255) cGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCAGTATCGCCGGGtg > 1:288997/1‑114 (MQ=255) cGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCAGTATCGCCGGGtg < 2:288997/115‑2 (MQ=255) gcACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCccgcc < 1:81472/149‑1 (MQ=255) ccGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCa > 7:211122/1‑149 (MQ=255) gTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCAcgc < 2:344734/149‑1 (MQ=255) aCCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCgg > 4:228335/1‑119 (MQ=255) aCCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCgg < 3:228335/119‑1 (MQ=255) ggTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCg < 1:157081/149‑1 (MQ=255) gTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGt < 6:315127/149‑1 (MQ=255) gTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGt > 5:315127/1‑149 (MQ=255) aaGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTgggg > 1:27934/1‑148 (MQ=255) tAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGa < 5:50643/147‑1 (MQ=255) aCCCTCACGCTTACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGa < 3:1583/148‑1 (MQ=255) cccTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAgg < 7:257212/149‑1 (MQ=255) ccTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAggg > 5:125628/1‑149 (MQ=255) ccTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGCCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAggg < 5:249807/149‑1 (MQ=255) ctcacgctcacgGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGc > 6:193783/1‑149 (MQ=255) acgctcacgGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTgg < 6:47569/149‑1 (MQ=255) gctcacgGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGc > 5:13493/1‑148 (MQ=255) gctcacgGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGc > 5:8106/1‑148 (MQ=255) gAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTggg > 7:74487/1‑118 (MQ=255) gAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTggg < 8:74487/118‑1 (MQ=255) gAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAggg > 4:272142/1‑133 (MQ=255) gAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCtcgt < 2:27934/149‑1 (MQ=255) gAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCtcgt > 7:129987/1‑149 (MQ=255) acaacCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCACCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCtcgtcg > 3:74352/1‑149 (MQ=255) aacCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGAc < 2:362042/149‑1 (MQ=255) gCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAgg > 2:175783/1‑149 (MQ=255) aCCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGcc > 4:37097/1‑149 (MQ=255) aCCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGcc > 7:179307/1‑149 (MQ=255) aCCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTAGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGca > 4:209049/1‑148 (MQ=255) tGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCACCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAg < 4:74352/149‑1 (MQ=255) cGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGa < 3:274559/129‑1 (MQ=255) cGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGa > 4:274559/1‑129 (MQ=255) cGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGaaa < 6:8106/149‑1 (MQ=255) aGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCgg < 6:13493/149‑1 (MQ=255) ggTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGt < 8:179307/149‑1 (MQ=255) gTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTg > 3:291013/1‑149 (MQ=255) gTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTg > 6:11036/1‑149 (MQ=255) cAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTGCg > 4:41602/1‑147 (MQ=255) ggcctaCCCGGCAGTATCGCCGGGTGGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTGCg > 7:248527/6‑147 (MQ=255) gCC‑CCCCTGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATCCCCACGCTTCCCGCCTCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTGCGAAGc < 4:267312/149‑1 (MQ=255) gCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCCCGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGGGGGGTACTCAGACGAGCGCTGGCCAGCCGCTCGTCGACCAGGCCCCTGAATCCGAAACCCGCTGCGAAGc > 3:19427/1‑149 (MQ=255) cctaCCCGGCAGTATCGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTGCGAAGc > 3:214923/4‑149 (MQ=255) ctaCCCGGCAGTATCGCCGGGTGGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTGCGAAGcc > 2:354798/3‑149 (MQ=255) taCCCGGCAGTATCGCCGGGTGGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTGCGAAGcc > 2:339148/2‑148 (MQ=255) ccGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTGCGAAGCCCAgg < 6:125628/149‑1 (MQ=255) gATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTGCTAAGCCCAGGGCaaa > 1:229151/1‑149 (MQ=255) | ACATCACCACCCATGGCCAGGAATTCGCTGCGCGAAACCGGCACGAAGCGCACCCGGTCACCGGGTTGCAAGAGGCTGTAACCCTCACGCTCACGGTCGAACAACCGCACCGGGGTGCGCCCGATCAGGTTCCAGCC‑ACCCGGCGATACTGCCGGGTAGGCCGCCGTCTGGCGCTCGGCAATACCCACGCTGCCCGCCGCCACGCGCTTGCGTGGGGTACTCAGACGAGGGCTGGCCAGGCGCTCGTCGACCAGGCCCATGAAGCCGAAACCCGGTGCGAAGCCCAGGGCAAA > NC_002947/5195841‑5196133 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |