Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 465,447 | T→A | 6.1% | D122V (GAT→GTT) ‡ | PP_0384 ← | AsnC family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 465,447 | 0 | T | A | 6.1% | 196.3 / 2.6 | 65 | D122V (GAT→GTT) ‡ | PP_0384 | AsnC family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/32); new base A (2/2); total (31/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.83e-01 |
CTCCTACAACCGGCCTCATCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTGGCTGCACCTTGATCCCGACATACG > NC_002947/465303‑465594 | cTCCTACACCCGGCCTCATCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAg < 8:288714/149‑1 (MQ=255) cTACAACCGGCCTCATCGATAACCCCACCCGCGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAgctg > 5:96762/1‑149 (MQ=255) cTACAACCGGCCTCATCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAgct < 5:141079/148‑1 (MQ=255) tACAACCGGCCTCATCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAgctgc > 6:23525/1‑149 (MQ=255) aCCGGCCTCATCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGATGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAGCTGGATCAGTTGCTCga < 2:267108/149‑2 (MQ=255) aCCGGCCTCATCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGATGTCAAGGTTCCACCTTGCTGCTGATAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACACCGTAGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAGCTGGATCAGTTGCTCga < 6:343918/149‑2 (MQ=255) cGGCCTCATCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGc < 3:76159/149‑1 (MQ=255) cGGCCTCATCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGc < 8:265908/149‑1 (MQ=255) gCCTCATCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGa < 7:217634/149‑1 (MQ=255) ccTCATCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAg < 7:67583/149‑1 (MQ=255) aTCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCg < 8:314166/149‑1 (MQ=255) aTCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGACCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTc < 2:127836/147‑1 (MQ=255) cGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTa > 5:272429/1‑149 (MQ=255) gATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTAc > 8:153743/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACAt < 6:349527/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACAt < 6:353598/149‑1 (MQ=255) cAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGc < 6:233580/140‑1 (MQ=255) cAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGc > 5:233580/1‑140 (MQ=255) ccGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAAt > 8:275934/1‑149 (MQ=255) ttCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATcc > 5:359295/1‑101 (MQ=255) ttCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATcc < 6:359295/101‑1 (MQ=255) tCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCTCCTTGCTGCAGCGAATGATCGACGTGTTGGTTTTCTCCACACCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTcgc < 8:262206/149‑1 (MQ=255) gCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCt > 7:333221/1‑148 (MQ=255) cACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGCCACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGcaca > 4:331909/1‑148 (MQ=255) aCGGTCCACCTTGCTGATGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCAGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGCGCGAGTACGTACGCAGCCAGCCGACATAGTCGAATTAGCCGCTTACCGcacaca > 6:53192/1‑149 (MQ=255) gTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAgct < 2:46625/149‑1 (MQ=255) tCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAgctg < 7:153743/149‑1 (MQ=255) ccACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAgctg < 8:333221/148‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAgctgct > 7:155727/1‑149 (MQ=255) tgctgcTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCAcc > 7:343840/1‑149 (MQ=255) ctgctgAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTg < 1:32939/149‑1 (MQ=255) tgctgAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTgg < 8:239967/149‑1 (MQ=255) tgctgAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTgg > 4:37543/1‑149 (MQ=255) agaATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCAt < 8:155727/149‑1 (MQ=255) gaATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATg < 8:22246/149‑1 (MQ=255) aaTGATCGTCGTGGTGTTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATgg < 6:380107/149‑1 (MQ=255) aaTGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCCCCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATgg > 3:14478/1‑149 (MQ=255) aaTGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATgg > 7:168602/1‑149 (MQ=255) ttaTCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTGGATACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCTAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGc < 5:53192/146‑1 (MQ=255) tGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCa < 6:96762/149‑1 (MQ=255) gATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCAc > 4:86636/1‑149 (MQ=255) aTCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACt < 5:23525/149‑1 (MQ=255) ggtTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATGTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGTAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGca > 1:31791/1‑149 (MQ=255) ggtTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGcgccgcc > 8:177627/1‑148 (MQ=255) ggtTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGca > 2:342337/1‑149 (MQ=255) ggtTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGca > 2:163664/1‑149 (MQ=255) tttCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCCCACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGcacca > 2:75153/1‑149 (MQ=255) tttCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGcacca > 3:217135/1‑149 (MQ=255) gaaaaccACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCAcc > 8:239363/6‑121 (MQ=255) gaaaaccACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCAcc < 7:239363/116‑1 (MQ=255) ctcCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACg < 6:272429/148‑1 (MQ=255) tcCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTc > 2:278920/1‑149 (MQ=255) cTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTgg < 1:195375/149‑1 (MQ=255) cTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTgg < 4:14478/149‑1 (MQ=255) cTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTgg < 4:217135/149‑1 (MQ=255) tGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTGGc > 2:100240/1‑149 (MQ=255) ccAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTGGCTg > 6:57398/1‑149 (MQ=255) gTCGATCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTGGCTGCACCt < 8:343840/146‑1 (MQ=255) ccGAGCAGCTGGATCAGTTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCGATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTGGCTGCACCTTGAt > 1:308960/2‑149 (MQ=255) cGAGCAGCTGGATCAGTTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTGGCTGCACCTTGATc > 3:53655/1‑149 (MQ=255) gCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTGGCTGCACCTTGATCCCg < 1:100240/149‑1 (MQ=255) aaCTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCtt < 1:110916/119‑1 (MQ=255) aaCTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCtt > 2:110916/1‑119 (MQ=255) aaCTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTGGCTGCACCTTGATCCCGa > 8:49277/1‑148 (MQ=255) aTCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTGGCTGCACCTTGATCCCGACATACg > 2:235825/1‑149 (MQ=255) tCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGc < 7:331608/115‑1 (MQ=255) tCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGc > 8:331608/1‑115 (MQ=255) | CTCCTACAACCGGCCTCATCGATAACCCCACCCGAGCGCCAGCCCGTTCAAAGCGGCTGTCCACGGTCCACCTTGCTGCTGAGAATGATCGACGTGGTGGTTTTCTCCACCCCGTCGACACTGCCAATCTGGTCGAGCAACTGATCCAGCTGCTCGGGCGAGTCCGTACGCAGCCAGGCGACATAGTCGAATTCGCCGCTTACCGCACACAGCTGCTGCACCTGGCCCATGGCACTCAGGCGCCGCACCACGTCCTTGCCGGAGCGTGGCTGCACCTTGATCCCGACATACG > NC_002947/465303‑465594 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |