| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,293,717 | A→C | 8.1% | C224G (TGC→GGC) | mmsA‑II ← | methylmalonate‑semialdehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,293,717 | 0 | A | C | 8.1% | 224.0 / 9.9 | 74 | C224G (TGC→GGC) | mmsA‑II | methylmalonate‑semialdehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/34); new base C (3/3); total (37/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.42e-01 | |||||||||||
GTTGGCATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATG > NC_002947/5293571‑5293865 | gTTGGCATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCaaa < 5:197837/149‑1 (MQ=255) ttGGCATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAAt > 2:337498/1‑149 (MQ=255) ggCATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATg < 5:147736/148‑1 (MQ=255) cATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCa > 6:160571/1‑149 (MQ=255) gcagcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATccac > 1:196084/1‑148 (MQ=255) gcagcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCAACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATccac > 5:79419/1‑148 (MQ=255) agcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCcaccac > 3:346502/1‑149 (MQ=255) agcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGATGCCATTTGCACccaccag < 5:343883/149‑2 (MQ=255) agcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGATGCCATTTGCACccac < 3:172106/146‑1 (MQ=255) agcaCCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATAATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCGGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGATGCCATTTGCACccac > 4:172106/1‑146 (MQ=255) accGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCtt < 2:139016/149‑1 (MQ=255) accGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCtt < 7:128791/149‑1 (MQ=255) accGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCtt < 3:267913/149‑1 (MQ=255) accGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCtt < 3:1828/149‑1 (MQ=255) cgcgTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTgc > 4:195218/1‑149 (MQ=255) gcgTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTgcc > 5:306704/1‑149 (MQ=255) ggTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGccgccg > 4:83570/1‑149 (MQ=255) gTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGt < 1:119566/149‑1 (MQ=255) ggCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcacca > 2:241042/1‑149 (MQ=255) gCCCCCCTCCTTCACCGCCCCCGCTGGCCATGCTGGCTCCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCACTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGGGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGcaccac < 4:230419/149‑1 (MQ=255) cccccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACg > 5:96197/1‑149 (MQ=255) ccccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGt < 5:286071/149‑1 (MQ=255) ccccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGt > 4:336238/1‑149 (MQ=255) ccccATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGt < 4:25545/149‑1 (MQ=255) atcatTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAg > 6:272138/1‑149 (MQ=255) atcatTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAg < 4:346502/149‑1 (MQ=255) tcatTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGc < 8:268649/149‑1 (MQ=255) ttGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACg > 4:210011/1‑149 (MQ=255) aCTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACgccg < 6:156521/149‑1 (MQ=255) cacaCGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAATTCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATGGACCACCTGCTTGCCGCCTTGCACCACGTTCAGCACgccggc < 4:153954/147‑1 (MQ=255) cacaCGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTCCAGCACgccggccg > 4:123831/1‑149 (MQ=255) acGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTa > 3:259126/1‑149 (MQ=255) gCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACg > 2:319764/1‑149 (MQ=255) ttGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGcc > 2:84303/1‑149 (MQ=255) tGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCg > 7:342957/1‑149 (MQ=255) aTGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCtt < 8:342957/149‑1 (MQ=255) gctggctgCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTACACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTc > 7:214679/1‑148 (MQ=255) ccGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCa < 3:195218/148‑1 (MQ=255) gAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCt < 7:55176/149‑1 (MQ=255) ttGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGAc < 1:241042/149‑1 (MQ=255) aaCGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGa < 2:207910/148‑1 (MQ=255) aaCGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTCCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGa < 3:123831/148‑1 (MQ=255) tGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCAt < 1:337498/149‑1 (MQ=255) tACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTc < 2:196084/149‑1 (MQ=255) tACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTc < 1:33199/149‑1 (MQ=255) tACCGACTTCAGTAGAGCCAACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTc > 8:65720/1‑149 (MQ=255) ccGACTTCACTAGAGCCAACGAAGCAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAAAGGCATCCACCACATGCTTGAAGCCCAGCACAAAGTTCACAACGCCGGCCGGTACGACGGATTCAAGAGCCAGCTCGACCAGAACCATGTTCg > 4:362792/1‑148 (MQ=255) ttCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGaa > 6:150375/1‑134 (MQ=255) ttCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGaa < 5:150375/134‑1 (MQ=255) ttCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCg > 6:137325/1‑149 (MQ=255) ttCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCg > 5:324415/1‑149 (MQ=255) aGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGa < 5:160571/148‑1 (MQ=255) cACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCg > 1:89059/1‑148 (MQ=255) gAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACa < 8:164588/127‑1 (MQ=255) gAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACa > 7:164588/1‑127 (MQ=255) aaTCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCCCGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGa < 7:177757/149‑1 (MQ=255) aaTCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGttt > 1:109868/1‑147 (MQ=255) tCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGc < 3:336238/149‑1 (MQ=255) cTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGa < 3:83570/149‑1 (MQ=255) aTGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAgg < 6:306704/148‑1 (MQ=255) aTGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGgt < 6:317656/149‑1 (MQ=255) gTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGa > 7:190717/1‑129 (MQ=255) gTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGa < 8:190717/129‑1 (MQ=255) tCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGtt > 5:64533/1‑149 (MQ=255) ggtggtggATGCCATTTGCACCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGgtgt < 2:298888/145‑1 (MQ=255) ggtggtggATGCCATTTGCACCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGgtgt > 1:298888/3‑147 (MQ=255) ggtggtggATGCCATTTGCACCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTg > 5:329432/3‑149 (MQ=255) cTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGa > 6:302292/1‑134 (MQ=255) cTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGa < 5:302292/134‑1 (MQ=255) cTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGc > 4:98416/1‑149 (MQ=255) cTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGc < 6:79419/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTACACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGc < 8:214679/149‑1 (MQ=255) ggtgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGa > 7:342403/1‑149 (MQ=255) tgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCTGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGAc > 6:61839/1‑148 (MQ=255) tgCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGAc > 5:374351/1‑148 (MQ=255) aaaTGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATg < 5:272138/149‑1 (MQ=255) aaaTGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATg > 3:154060/1‑149 (MQ=255) | GTTGGCATCAGGCAGCACCACCGCGTGGTTCTTGGCCCCCATCATTGACTGCACACGCTTGCCATGCTGGCTGCCGAGGTTGTAAACGTGCGTACCGACTTCAGTAGAGCCCACGAAGGAAATCGCCTTGATGTCCTGGTGGGTGCAAATGGCATCCACCACCTGCTTGCCGCCGTGCACCACGTTCAGCACGCCGGCCGGTACGCCGGCTTCCAGCGCCAGCTCGACCAGAAGCATGGTCGACAGCGGATCCTGCTCGGATGGTTTGAGCACGAAGGTGTTGCCGCAGACGATG > NC_002947/5293571‑5293865 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |