Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,507,016 | T→G | 5.9% | W93G (TGG→GGG) | cycA → | D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,507,016 | 0 | T | G | 5.9% | 214.9 / 4.1 | 68 | W93G (TGG→GGG) | cycA | D‑alanine/beta‑alanine/D‑serine/glycine permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/26); new base G (2/2); total (40/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 |
CTGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAGGGCTGCTG > NC_002947/5506875‑5507162 | cTGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCgg < 3:190159/149‑1 (MQ=255) gggCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCAGGGGCCgag < 7:51977/148‑3 (MQ=255) gCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCCTGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTa < 1:331437/149‑1 (MQ=255) cATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTTTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTAct < 1:126517/149‑1 (MQ=255) cATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTAct < 5:220628/149‑1 (MQ=255) cATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCAGGGGCCgagc < 8:147906/141‑4 (MQ=255) cATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCAGGGGCCgagc > 7:147906/1‑138 (MQ=255) aTCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACt < 4:117620/143‑1 (MQ=255) aTCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACt > 3:117620/1‑143 (MQ=255) atcatcTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTActggctg < 5:104489/149‑1 (MQ=255) tcatcTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTActggctg > 1:296237/1‑148 (MQ=255) tcTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCAGACGACCTGATCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGAcg > 4:299616/1‑148 (MQ=255) cGTCTACATGATTCTCGGCTTCCTGCTGTTCATCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTa < 4:101736/147‑1 (MQ=255) cGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTAGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGTCTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGAcc < 4:119458/145‑1 (MQ=255) gTCTACATGATTATCGGCTGCATGCTGGTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGGCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTg < 8:208288/149‑1 (MQ=255) aCATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTc > 4:341794/1‑149 (MQ=255) tATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCt < 4:218405/107‑1 (MQ=255) tATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCt > 3:213722/1‑107 (MQ=255) tATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCt > 3:218405/1‑107 (MQ=255) tATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCt < 4:213722/107‑1 (MQ=255) tCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTAGTGGTTCTGCTGggtg > 5:296949/1‑149 (MQ=255) tCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGggtg > 2:171671/1‑149 (MQ=255) ggCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCCAATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAAATACAAGTCGTACATCGACTTTTCCGCCGACATGATCGGCCCATGGGCCGGCTACTTTACTGCATGGACGTACTGGTTATGATGggtgg > 1:39489/1‑149 (MQ=255) cTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTctgctg < 7:19137/141‑1 (MQ=255) cTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTctgctg > 8:19137/1‑141 (MQ=255) tCATCCTCTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGATGTCGAACCTGAACTACAAGTAGTACATCGACATTTACGCAGACATGCTAGGCCCCACGGCCCACTAAATTAATTGCTGGACCTACAGCTTCTGCTTGGTGGTAAcc > 4:104686/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTActggctg < 7:321177/117‑1 (MQ=255) gCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTActggctg > 8:321177/1‑117 (MQ=255) gCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTctg < 4:90008/132‑1 (MQ=255) gCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTctg > 3:90008/1‑132 (MQ=255) gCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCa > 6:99000/1‑149 (MQ=255) cTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCa < 2:236518/148‑1 (MQ=255) tGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTCAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTACGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCAtt > 8:37511/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTg > 5:336315/1‑149 (MQ=255) ttcttcGGCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCAtt < 6:332408/147‑1 (MQ=255) cttcGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGcc > 8:8200/1‑148 (MQ=255) aTGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCAGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGt < 6:200165/149‑1 (MQ=255) tgctgTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAg > 6:167178/1‑149 (MQ=255) tgctgTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAg > 6:338619/1‑149 (MQ=255) ctgTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTa < 5:375893/73‑1 (MQ=255) ctgTCGAACCTGAACTACAAGTCGATCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTCGGCCCGCTACTTTa > 6:375893/1‑73 (MQ=255) tCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTg < 1:7778/149‑1 (MQ=255) tCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTg < 5:338619/149‑1 (MQ=255) gAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTgg < 2:10427/148‑1 (MQ=255) gAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGt > 2:160799/1‑149 (MQ=255) gAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGt > 2:283228/1‑149 (MQ=255) ccTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTcc < 2:296237/149‑1 (MQ=255) tGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGTTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTcccc > 7:115628/1‑149 (MQ=255) tGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTcccc > 3:362576/1‑149 (MQ=255) tGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTcccc > 1:339157/1‑149 (MQ=255) gAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTcccc > 6:251976/1‑148 (MQ=255) cggaaaaGTCGATGAACGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGAc > 7:5424/6‑149 (MQ=255) cggaaaaGTCGATGAACGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGAc > 7:196555/6‑149 (MQ=255) ggaaaaGTCGATGAACGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGAcc > 6:346268/5‑149 (MQ=255) tACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCt > 3:113764/1‑149 (MQ=255) gTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGTTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGt > 7:101476/1‑149 (MQ=255) gTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGTTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGt < 8:101476/149‑1 (MQ=255) gTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAg < 3:104686/148‑1 (MQ=255) gTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGt > 5:188834/1‑149 (MQ=255) cATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTgg < 3:341794/148‑1 (MQ=255) ttttCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGgc > 8:215726/1‑149 (MQ=255) ttCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGgcgc > 3:68029/1‑149 (MQ=255) cgccgACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGa > 2:36420/1‑149 (MQ=255) cgccgACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTCGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACCTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGa > 8:249480/1‑149 (MQ=255) ccgACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATcgccgc < 2:159677/97‑1 (MQ=255) gccGGCCCAGGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAgg > 2:248892/3‑149 (MQ=255) cgatctccTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATCGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAggg < 7:136343/143‑1 (MQ=255) ggCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAggg < 5:41812/147‑1 (MQ=255) gCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAGGgctg > 1:335451/1‑149 (MQ=255) cccTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAGGgctgct > 6:368155/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCTTTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAGGgctgctg > 1:103457/1‑149 (MQ=255) cTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATCGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGCTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCCTAggg > 8:136343/1‑142 (MQ=255) | CTGGCCGGGCCATCGATCATCTTCGTCTACATGATTATCGGCTTCATGCTGTTCTTCGTCATGCGCGCC‑ATGGGCGAACTGCTGCTGTCGAACCTGAACTACAAGTCGTTCATCGACTTTTCCGCCGACCTGCTCGGCCCCTGGGCCGGCTACTTTACTGGCTGGACCTACTGGTTCTGCTGGGTGGTCACCGGCATTGCCGACGTGGTCGCGATCGCCGCCTACACCCAGTTCTGGTTCCCCGACCTGCCGCAGTGGATACCGGCGCTGACCTGCGTAGGGCTGCTG > NC_002947/5506875‑5507162 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |