| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,569,700 | C→A | 10.0% | L183L (CTG→CTT) | nnrD ← | ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,569,700 | 0 | C | A | 10.0% | 240.6 / 10.7 | 79 | L183L (CTG→CTT) | nnrD | ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/32); new base A (4/4); total (43/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGCCAGCACGCCAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCAAATTCAAGGCAT > NC_002947/5569556‑5569842 | tGCCAGCACGCCAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCCCCGTTGAGTACACAGACGCTGGTATAACGGCGCGGCAGCt > 3:323055/1‑149 (MQ=255) cAGCACGCCAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGACACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGATTgc > 6:303576/1‑149 (MQ=255) aCGCCAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCAAGCTGgcgcgc < 4:128938/149‑1 (MQ=255) cGCCATGCAGCAGATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCgca < 4:20258/149‑1 (MQ=255) gCCAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCAAGCTGgcgcgccg > 4:219688/1‑147 (MQ=255) ccAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCgcagc < 1:214061/149‑1 (MQ=255) ccAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCAAGCTGgcgcgccgt < 7:170434/149‑4 (MQ=255) aGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCAc < 6:45906/149‑1 (MQ=255) gCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAggg > 6:283501/1‑149 (MQ=255) gCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAggg > 7:213676/1‑149 (MQ=255) acaTCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCg > 5:153672/1‑149 (MQ=255) aTCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGt > 2:193633/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCa < 5:312985/148‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAg < 3:331598/149‑1 (MQ=255) cccAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGc < 6:118336/149‑1 (MQ=255) ccggcgccggcCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTAc > 2:368341/1‑149 (MQ=255) ccggcCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCgg < 7:231360/132‑1 (MQ=255) ccggcCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCgg > 8:231360/1‑132 (MQ=255) tGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGc > 2:64927/1‑149 (MQ=255) tGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCACCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGAGCCGGCACCAATGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTCCGCGCAGCACCACGGCCGTCAGCCGGTCCCGCCGCAGTGGCAATGc > 4:247324/1‑149 (MQ=255) tGGGGGCCCTCGCTCGCAGATCGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTTAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACgg < 7:347742/134‑1 (MQ=255) tCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAgccgcgc > 5:11015/1‑149 (MQ=255) cacaACGCCAGCTGCACGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGGACCAGGGCGGGCAGCCTGTACGGCCTCAGGGTCAATGCCCAGCAgccgcgccgc < 4:292984/149‑1 (MQ=255) acaACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAAt < 5:210024/130‑1 (MQ=255) acaACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAAt > 6:210024/1‑130 (MQ=255) acaACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCgccgcc > 8:85836/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTccccc > 1:203582/1‑149 (MQ=255) cTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTgcgcgc > 6:207559/1‑81 (MQ=255) cTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTgcgcgc < 5:207559/81‑1 (MQ=255) cTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAgccgcgcc > 6:369003/1‑136 (MQ=255) cTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAgccgcgcc < 5:369003/136‑1 (MQ=255) gCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGc > 7:348733/1‑149 (MQ=255) cccGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACTCAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCGCCGGGTGCg < 4:323055/149‑1 (MQ=255) cccGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCATGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCg > 6:187400/1‑149 (MQ=255) cccGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTCTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCCCAGCACCAGGGCGTTCAGCCTCTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCg > 5:334100/1‑149 (MQ=255) ccGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTCTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCgg > 5:200945/1‑149 (MQ=255) ccGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCATGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCgg < 5:187400/149‑1 (MQ=255) cGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCg > 8:115662/1‑147 (MQ=255) cGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGa < 5:283501/149‑1 (MQ=255) cGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGa < 1:368341/149‑1 (MQ=255) gCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAg > 4:358642/1‑149 (MQ=255) ggggCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAg > 8:309438/1‑149 (MQ=255) ggggCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGGTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTaa < 5:261644/148‑1 (MQ=255) ggCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGTCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGa < 5:303576/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGa < 7:85836/149‑1 (MQ=255) caccaGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGAtgctgc < 8:213676/149‑1 (MQ=255) caccaGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGAtgctgc > 3:34973/1‑149 (MQ=255) caccaGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGAtgctgc > 6:200600/1‑149 (MQ=255) aGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACt > 8:261928/1‑149 (MQ=255) aGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGT‑AGGATGCTGCCACTg < 1:64927/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTgg < 8:348733/149‑1 (MQ=255) tggCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTggg < 6:367910/147‑1 (MQ=255) gTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTggg > 5:112751/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTggg > 6:121943/1‑149 (MQ=255) cGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAgccgc < 6:63282/104‑1 (MQ=255) cGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAgccgc > 5:63282/1‑104 (MQ=255) cGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGt > 6:324887/1‑127 (MQ=255) cGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGt < 5:324887/127‑1 (MQ=255) cGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAgg > 1:368421/1‑149 (MQ=255) ggCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCGTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAggg < 4:34973/149‑1 (MQ=255) gaaCCTTTGAGTACACAGAAGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTCGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTACGGATCCTGCCACTGGGCAggg > 2:169824/3‑148 (MQ=255) cTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGc > 2:197089/1‑149 (MQ=255) tttGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCg > 5:323132/1‑149 (MQ=255) tGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCg < 5:343986/147‑1 (MQ=255) gAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCggg < 2:68851/148‑1 (MQ=255) gAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCggg < 3:165910/148‑1 (MQ=255) acaGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTcgcg > 2:226879/1‑149 (MQ=255) gACGCTGTTATCACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCa < 3:294453/149‑1 (MQ=255) gCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGc > 6:99595/1‑148 (MQ=255) tGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCaaa > 3:89559/1‑149 (MQ=255) ataACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTc > 7:80513/1‑134 (MQ=255) ataACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTc < 8:80513/134‑1 (MQ=255) gtgctgcgcgcAAGCTGGCGCGCCGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCAAATTCaa < 5:193239/144‑1 (MQ=255) tgctgcgcgcAAGCTGGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCgggg > 1:248688/5‑129 (MQ=255) tgctgcgcgcAAGCTGGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCgggg < 2:248688/125‑1 (MQ=255) aaCGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCAAATTCAAg > 7:125961/1‑149 (MQ=255) gctgcgcgcAAGCTGGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCAAATTCAAgc > 3:232150/4‑148 (MQ=255) ctgcgcgcAAGCTGGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCAAATTCAAgg > 5:59361/3‑148 (MQ=255) gcgcgcCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCAAATTCAAggcat < 1:226879/149‑1 (MQ=255) | TGCCAGCACGCCAGTCAGCACATCGCCCAGGCCGGCGCCGGCCATCGCTGGGTGCCCGCGCTCGCACAACGCCAGCTGCCCGCTCGGGGCTGCCACCAGGGTGCCGGCACCTTTGAGTACACAGACGCTGTTATAACGGCGCGCCAGCTTGCGCGCAGCACCAGGGCGGTCAGCCTGTACGGCCTCAGTGGCAATGCCCAGCAGCCGCGCCGCCTCCCCCGGGTGCGGAGTAAGGATGCTGCCACTGGGCAGGGCCAGCGGGGTTCGCGCCAGCAAATTCAAGGCAT > NC_002947/5569556‑5569842 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |