| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,792,860 | G→T | 6.5% | A157A (GCC→GCA) | gltD ← | glutamate synthase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,792,860 | 0 | G | T | 6.5% | 276.2 / 5.5 | 90 | A157A (GCC→GCA) | gltD | glutamate synthase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/45); new base T (4/2); total (43/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGC > NC_002947/5792713‑5792999 | aCGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCgccgggccgg < 6:301045/149‑1 (MQ=255) cggcggTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGCTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGgc > 4:41539/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCga < 7:96696/149‑1 (MQ=255) ttGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCCGGCCCGGCGGGCCTGGGCTGCGCCgac < 3:74118/149‑2 (MQ=38) cTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCAGCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCgatgat > 5:261633/1‑149 (MQ=255) cTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCgatgat < 3:334896/149‑1 (MQ=255) tGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGatgatg > 3:212042/1‑149 (MQ=255) tGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGatgatg > 3:361573/1‑149 (MQ=255) aGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATgg < 7:179688/148‑1 (MQ=255) cGGTC‑TTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAAcgc > 1:363458/1‑149 (MQ=255) ggTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAAcgc > 6:63221/1‑149 (MQ=255) ggTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAAcgc > 5:180408/1‑149 (MQ=255) ggTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACATCGGCGCCGGCCCGGCGGGCCTGGGCTGCGCCgacg > 5:109388/1‑137 (MQ=37) ggTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACATCGGCGCCGGCCCGGCGGGCCTGGGCTGCGCCgacg < 6:109388/139‑3 (MQ=37) tCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACgcgc > 4:20521/1‑149 (MQ=255) cTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCt < 3:272960/149‑1 (MQ=255) ttttCCAGCTTGAACTCGGGGATATCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCtt > 5:305496/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCtt < 2:61776/147‑1 (MQ=255) cAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCgg > 8:166033/1‑149 (MQ=255) 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gggATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCGAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCtt < 2:144993/149‑1 (MQ=255) ggATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAAc > 3:123213/1‑124 (MQ=255) ggATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAAc < 4:123213/124‑1 (MQ=255) ggATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTg < 5:270595/149‑1 (MQ=255) gATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTgg < 4:261795/149‑1 (MQ=255) cGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATg > 1:277135/1‑149 (MQ=255) cGAAGGTCAGCAGGCCACCGATATCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCTGCTCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCCGTTGGCTTGACCTTGGACATg > 5:154086/1‑149 (MQ=255) aGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTcc < 3:58674/149‑1 (MQ=255) gTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCgg < 6:261633/149‑1 (MQ=255) gCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGc > 6:87193/1‑149 (MQ=255) tcAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCg > 3:367139/1‑147 (MQ=255) 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gAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGa < 6:180408/149‑1 (MQ=255) gAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGa > 3:216498/1‑149 (MQ=255) gAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGa > 7:286083/1‑149 (MQ=255) gAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGa < 7:166033/149‑1 (MQ=255) acacCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATg > 5:11882/1‑149 (MQ=255) accaccGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTg < 4:47729/144‑1 (MQ=255) accaccGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGaagat > 3:47729/1‑145 (MQ=255) ccaccGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTAc < 6:335191/149‑1 (MQ=255) ccaccGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTAc < 4:216498/149‑1 (MQ=255) ccaccGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTAc < 2:363458/149‑1 (MQ=255) caccGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGCTGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTGGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACt > 5:357262/1‑149 (MQ=255) caccGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAAGGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACTTGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGAGTCGGTGATGTACt < 1:268701/149‑1 (MQ=255) caccGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACt > 4:302468/1‑149 (MQ=255) caccGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACt > 3:341343/1‑149 (MQ=255) accGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACtt > 4:322090/1‑149 (MQ=255) accGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACtt < 4:322892/149‑1 (MQ=255) accGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACtt < 3:322090/149‑1 (MQ=255) ggTAACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGAt > 6:268631/1‑138 (MQ=255) ggTAACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGAt < 5:268631/138‑1 (MQ=255) cccGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGc > 1:1869/1‑149 (MQ=255) cccGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGc < 5:63221/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGcc > 7:149398/1‑149 (MQ=255) cGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCAGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGcc > 6:215695/1‑148 (MQ=255) gcgcgcACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGAt < 2:277135/149‑1 (MQ=255) cgcACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGt < 4:84992/149‑1 (MQ=255) 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gggcAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAAcc < 6:226503/147‑1 (MQ=255) gcgcAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAAcc < 3:41539/149‑1 (MQ=255) cccAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGtt > 6:73335/1‑149 (MQ=255) cccAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGtt < 3:302468/149‑1 (MQ=255) cAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGtt > 7:295958/1‑147 (MQ=255) cAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGtt > 4:316829/1‑147 (MQ=255) cAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGtt > 4:311476/1‑147 (MQ=255) aGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAg < 5:73335/149‑1 (MQ=255) ggCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAgg < 1:321746/149‑1 (MQ=255) ggCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAgg < 5:215695/149‑1 (MQ=255) ggCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAgg < 6:211947/149‑1 (MQ=255) ggCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAgg < 5:87193/149‑1 (MQ=255) gCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAggg < 3:311476/149‑1 (MQ=255) gCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAggg < 3:316829/149‑1 (MQ=255) cccGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGt < 6:305496/149‑1 (MQ=255) cgccgGGCCGGAGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGc < 4:361573/149‑1 (MQ=255) gccgggccggCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTg > 1:122313/1‑147 (MQ=255) | ACGGCGGTTGCTGAGCACGGTCTTTTCCAGCTTGAACTCGGGGATACCGAAGGTCAGCAGGCCACCGATCTCAGGGTTTTTGTCGAACACCACCGGGGTTACCCCGGCGCGCACCAGCACGTCGGCGCAGCCCAGGCCCGCCGGGCCGGCGCCGATGATGGCAACGCGCTTGCCGGTTGGCTTGACCTTGGACATGTCCGGACGCCAGCCCATGGCGAAGGCGGTGTCGGTGATGTACTTCTCCACCGAGCCGATGGTCACCGCGCCGAAACCGTCGTTCAGGGTGC > NC_002947/5792713‑5792999 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |