Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,947,318 | G→C | 5.4% | L386V (CTG→GTG) | rho ← | transcription termination factor Rho |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,947,318 | 0 | G | C | 5.4% | 306.5 / 5.6 | 92 | L386V (CTG→GTG) | rho | transcription termination factor Rho |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/49); new base C (2/3); total (40/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.04e-01 |
GCCGCAAGGCGGCCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTAC > NC_002947/5947173‑5947464 | gCCGCAAGGCGGCCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCtt > 2:237290/1‑149 (MQ=255) gCAAGGCGGCCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTgcg < 3:242909/149‑1 (MQ=255) gaaGGCGTCCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGATGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTgcgc < 7:256712/148‑1 (MQ=255) aGGCGGCCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAg < 7:204408/149‑1 (MQ=255) gcggcCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGaa < 6:101615/149‑1 (MQ=255) ggcCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATc < 5:144811/149‑1 (MQ=255) ggcCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATc > 4:262296/1‑149 (MQ=255) cccAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCcac < 3:154166/149‑1 (MQ=255) cccAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCca > 5:105906/1‑148 (MQ=255) cccAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCca > 8:29168/1‑148 (MQ=255) ccAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCcaca > 4:134857/1‑149 (MQ=255) caatcaatCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACAt < 3:5031/149‑1 (MQ=255) atcaatcCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCTCTTCATCGACAGGAAGAACTCAACGTGGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTCTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGGAGCAGCTTGCGCAGAATCCAGATAc < 6:265783/149‑1 (MQ=255) atcaatcCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACAt > 6:13025/1‑147 (MQ=255) atcaatcCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACAt < 5:13025/147‑1 (MQ=255) tcaatcCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACg < 6:105906/149‑1 (MQ=255) aatcCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGc < 2:96658/148‑1 (MQ=255) atcCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGTTGCAGCAGCTTGCGCAGAAGCCACATACGCTg > 2:316978/1‑149 (MQ=255) cAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTAGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAg > 6:188913/1‑149 (MQ=255) aGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCACCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGc < 4:127265/149‑1 (MQ=255) ccTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTg > 2:230114/1‑143 (MQ=255) ccTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTg < 1:230114/143‑1 (MQ=255) cTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCa < 7:89880/126‑1 (MQ=255) cTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCa > 8:89880/1‑126 (MQ=255) aaaCGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCtcgtc < 5:93010/148‑1 (MQ=255) aaaCGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCtcgtc < 7:292298/148‑1 (MQ=255) aCGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTcgtcgt > 3:215329/1‑148 (MQ=255) tcgctTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCg > 2:162506/1‑149 (MQ=255) gctTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGt < 1:301113/149‑1 (MQ=255) aCTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCa < 6:138026/147‑1 (MQ=255) aCTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAg < 6:244287/148‑1 (MQ=255) aCTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAg < 4:60196/148‑1 (MQ=255) cTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGc < 3:134857/148‑1 (MQ=255) cTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGc < 4:81323/148‑1 (MQ=255) ttGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCaa > 4:319515/1‑149 (MQ=255) cgcTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCACCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAActc > 7:60247/1‑149 (MQ=255) aTCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTcgcg < 4:258814/149‑1 (MQ=255) aTCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTcgc < 4:215329/148‑1 (MQ=255) gACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCgcggc < 6:75029/148‑1 (MQ=255) gACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCgcggc > 5:9909/1‑148 (MQ=255) aGGAATAACTCCTCGTTGGTCGTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGCCCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCTCATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGt < 6:283742/149‑1 (MQ=255) gaagaaCTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGa > 4:227412/1‑145 (MQ=255) gaagaaCTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGa < 3:227412/145‑1 (MQ=255) gaagaaCTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGc < 6:94158/149‑1 (MQ=255) gaagaaCTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGc > 8:253029/1‑149 (MQ=255) agaaCTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCGTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCg < 5:35439/149‑1 (MQ=255) cTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGc > 8:727/1‑149 (MQ=255) tCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCg > 2:25497/1‑149 (MQ=255) gTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCa > 4:30503/1‑116 (MQ=255) gTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCa < 3:30503/116‑1 (MQ=255) gTTGGTCATGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGCCGAGTGCCGGAGCGgttga < 2:182640/149‑1 (MQ=255) cttggtcttgggcTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGgttg < 2:326482/147‑1 (MQ=255) ttggtcttggtcTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGgttgat < 1:275657/149‑1 (MQ=255) ggtcttggtctGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGgttgatg < 1:365446/148‑1 (MQ=255) ggtcttggtctGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGgttgatg < 3:370017/148‑1 (MQ=255) gtcttggtctGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGgttgatgt < 1:162506/148‑1 (MQ=255) tcttggtctGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGgttgatgtt > 1:168398/1‑148 (MQ=255) tcttggtctGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCACCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGgttgatgttg < 8:60247/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGgt < 6:298085/131‑1 (MQ=255) cTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCggg > 7:320260/1‑148 (MQ=255) aGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAaca < 7:727/148‑1 (MQ=255) gCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAacaca > 5:70836/1‑149 (MQ=255) tCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCt > 7:122642/1‑148 (MQ=255) tCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCt > 3:197997/1‑148 (MQ=255) gACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTtc > 3:316021/1‑148 (MQ=255) cAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGGAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAg > 7:123109/1‑149 (MQ=255) ggAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGc > 3:215515/1‑148 (MQ=255) gAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGa > 6:321366/1‑149 (MQ=255) gAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGa > 8:354203/1‑149 (MQ=255) aaCTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGAt < 8:320260/149‑1 (MQ=255) aaCTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGAt < 5:321366/149‑1 (MQ=255) cGATGGCAGCGAGTTCGTCCATCGGGTGCAGGAGCTTCCTCAGACTCCACATACGCTGCAGCTCGTCTTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCTGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGTCCGGGAACACACGCTTCTCAGCTATgcgt < 8:304048/149‑2 (MQ=255) gATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATgcggc > 8:294942/1‑149 (MQ=255) gATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATgcgg < 8:122642/148‑1 (MQ=255) gATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATgcgg < 7:29168/148‑1 (MQ=255) aTGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATgcggcg > 6:170420/1‑149 (MQ=255) tGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGcggcgg < 3:319515/149‑1 (MQ=255) tGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTAGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGcggcgg > 3:351352/1‑149 (MQ=255) cAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTc > 8:161337/1‑148 (MQ=255) aGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCa < 7:161337/149‑1 (MQ=255) aGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCACCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGgtt < 1:301398/102‑1 (MQ=255) aGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCACCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGgtt > 2:301398/1‑102 (MQ=255) ttCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCgg > 1:188321/1‑147 (MQ=255) cGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGATGCAGCTCGTCCTCAGCGGTAAGCATCTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGACGGGAACACACGCATCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGc > 8:165404/1‑149 (MQ=255) gTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCt > 5:134808/1‑149 (MQ=255) gTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCt > 5:187861/1‑149 (MQ=255) cATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTcc < 3:262296/148‑1 (MQ=255) gggTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGtt > 4:302135/1‑149 (MQ=255) gTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGc < 4:215515/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGc < 6:9909/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGc < 4:316021/149‑1 (MQ=255) tGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGGCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTGGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGcc < 6:140505/149‑1 (MQ=255) cagcagCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCg < 6:187861/148‑1 (MQ=255) gcagcTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTa > 7:253462/1‑149 (MQ=255) cagcTTGCGCAGAATCAACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCACGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTACTCAGCGATGCGGCGCTCCCGCGGCACATCCATCTTGCCGGAAc > 4:108332/1‑149 (MQ=255) | GCCGCAAGGCGGCCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGAAGAACTCATCGTTGGTCTTGGTCTGCTTGAGCTTGTCGACCAGGAACTCGATGGCAGCGATTTCGTCCATCGGGTGCAGCAGCTTGCGCAGAATCCACATACGCTGCAGCTCGTCGTCAGCGGTCAGCAACTCTTCGCGGCGAGTGCCGGAGCGGTTGATGTTGATGGCCGGGAACACACGCTTCTCAGCGATGCGGCGGTCCAGCGGCAGCTCCATGTTGCCGGTAC > NC_002947/5947173‑5947464 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |