| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 544,652 | G→T | 6.4% | K964N (AAG→AAT) ‡ | rpoC → | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 544,652 | 0 | G | T | 6.4% | 248.4 / 4.7 | 78 | K964N (AAG→AAT) ‡ | rpoC | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/36); new base T (2/3); total (39/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.63e-01 | |||||||||||
TCGGCGTTATCGCTGCCCAGTCGATCGGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCAAGGAAGGTGAAAAGGTCGAAGCTG > NC_002947/544504‑544800 | tCGGCGTTATCGCTGCCCAGTCGATCTGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGTTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCTGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAg < 8:66300/149‑1 (MQ=255) ggCGTTATCGCTGCCCAGTCGATCGGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCa < 3:105934/149‑1 (MQ=255) ttATCGCTGCACAGTCGATCGGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGtt < 1:354241/149‑1 (MQ=255) tCGCTGCCCAGTCGATCGGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAg < 2:342335/149‑1 (MQ=255) gCTGCCCAGTCGATCGGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCATACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCg > 1:72109/1‑149 (MQ=255) gCTGCCCAGTCGATCGCTGAGCCGTGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTACACATCGGTGGTGCTTCAAGCAGTACCTCGGCTGCCGAGAGCGTCCAGGTTAAGAATTGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGCTTCAGGTTGTGca < 6:377637/149‑2 (MQ=255) gCTGCCCAGCCGATCGGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCTCAACCTGCTTCAGGTTGTGc < 3:264725/148‑1 (MQ=255) cccAGTCGATCGGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGcc > 1:272425/1‑149 (MQ=255) ccAGTCGATCGGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGcc > 4:37002/1‑148 (MQ=255) tCGGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGCTTCAGGTTgtg < 2:342883/134‑3 (MQ=255) tCGGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGCTTCAGGTTgtg > 1:342883/1‑132 (MQ=255) ggTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAAcc < 1:241537/148‑1 (MQ=255) gTGAGCCGGGTACCCAGCTGACAATGCGTACGTTCAACATCGGTGGTGCTGCAATCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGACAAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGAGT‑CTGCACAACATGAAGCAGGTTGAGAGTGCCGACGGTACCCTg > 8:170887/1‑149 (MQ=255) gAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGt < 3:223161/149‑1 (MQ=255) aGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGtt < 5:219449/149‑1 (MQ=255) aCCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATc > 8:39183/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATc > 1:276966/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATcgc > 4:87313/1‑149 (MQ=255) cTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTc > 1:272033/1‑149 (MQ=255) tGACCATGGGTACGTTCCACATCGGTTGTGCTGCAAGCCGTTACTCGGCTTCCGTAAGGGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGTCCTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTc < 1:108605/149‑1 (MQ=255) aCCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCgg < 4:93731/148‑1 (MQ=255) aCCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCgg < 3:37002/148‑1 (MQ=255) cATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACg < 6:80193/119‑1 (MQ=255) cATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACg > 5:80193/1‑119 (MQ=255) gTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTg > 5:80219/1‑149 (MQ=255) tACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTgg < 6:322131/149‑1 (MQ=255) tACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTgg > 5:39106/1‑149 (MQ=255) gTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGa > 5:368228/1‑149 (MQ=255) ccACATCGCTGGTGCTGAAAGCCGAACCTCGGCTGACGACAGCGTCAAGGTTAATAATCGCGTTATTTTCCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCATATCGCGTTAGGGTGAGTTGTCTAtt > 8:196120/1‑148 (MQ=255) cacaTCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTg < 7:39183/148‑1 (MQ=255) cacaTCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTg < 3:109187/148‑1 (MQ=255) acaTCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGAAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCt > 1:349042/1‑149 (MQ=255) caTCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGc < 1:346929/95‑1 (MQ=255) caTCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGc > 2:346929/1‑95 (MQ=255) aTCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTATCCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGa > 8:324589/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACTGCGGCCAGGTTTAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTTAGCGTGACGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGAc < 7:170887/149‑1 (MQ=255) tggtgCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGt > 4:77314/1‑149 (MQ=255) ggtgCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGtt > 6:199384/1‑149 (MQ=255) ggtgCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGtt > 8:218280/1‑149 (MQ=255) tgctgcAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCg > 1:196645/1‑149 (MQ=255) cAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTc < 4:149644/147‑1 (MQ=255) aGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTcgt > 6:289018/1‑147 (MQ=255) gCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTcgtgag > 7:102004/1‑149 (MQ=255) ccGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACTTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTcgtgagc < 8:102004/149‑1 (MQ=255) ccGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGAc < 5:207003/133‑1 (MQ=255) ccGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGAc > 6:207003/1‑133 (MQ=255) gTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGATGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGt > 7:190007/1‑113 (MQ=255) gTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGATGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGt < 8:190007/113‑1 (MQ=255) aCCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGGGTTCGGTcgtgagcgt > 1:345003/1‑147 (MQ=255) ccTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTcgtgagcgtgag < 6:39106/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTcgtgagcgtga < 2:276966/148‑1 (MQ=255) cTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCgtgagcgtgagc > 2:313216/1‑149 (MQ=255) tCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGtgagcgtgagcg > 7:143663/1‑149 (MQ=255) cTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTa > 6:171105/1‑148 (MQ=255) cAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGc < 3:77314/149‑1 (MQ=255) gTCCAGGTTAAGACTGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGCAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTa < 5:287509/149‑1 (MQ=255) cAGGTTCAGATTGGCGGTATGGTGCGT‑CTGGACAACCTGAAGCAGGGTGAGCGTGCCGACGGTAACGTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTAcg < 5:13111/148‑1 (MQ=255) cAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTAcgg > 5:176735/1‑149 (MQ=255) aGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTAcggt < 2:272425/149‑1 (MQ=255) gTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGtt > 8:124191/1‑110 (MQ=255) tAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTAcggtgcgg > 7:52700/1‑149 (MQ=255) tGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGAttt > 6:114224/1‑149 (MQ=255) gCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGGTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCg < 6:367745/149‑1 (MQ=255) tATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTc > 3:319579/1‑148 (MQ=255) ggTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCaag < 6:80219/148‑1 (MQ=255) gCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCaaggaag < 4:319579/149‑1 (MQ=255) cGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCaaggaag < 2:72109/148‑1 (MQ=255) cGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCaaggaag < 7:196120/148‑1 (MQ=255) gT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCAAGGAAGGt > 1:54801/1‑149 (MQ=255) gctcaACCTGCTTCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCAAGGAAGGTGaa > 1:223042/4‑148 (MQ=255) gCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCAAGGAAGGTGaa > 4:361281/1‑148 (MQ=255) cacaACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGAttt < 3:283869/130‑1 (MQ=255) cacaACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGAttt > 4:283869/1‑130 (MQ=255) cacaACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCAAGGAAGGTGaaaa < 5:199384/149‑1 (MQ=255) cTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCaa > 6:320357/1‑131 (MQ=255) cTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCaa < 5:320357/131‑1 (MQ=255) aaGCTGGTTGAGGGTGCCGACGGTACCCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGACTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCAAGGAAGGTGAAAAGGTCGaa < 2:349042/147‑1 (MQ=255) aaGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCAAGGAAGGTGAAAAGGTCGaa < 7:218280/147‑1 (MQ=255) aaGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCAAGGAAGGTGAAAAGGTCGaa < 1:313216/147‑1 (MQ=255) gCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGAttt > 6:83604/1‑119 (MQ=255) gCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGAttt < 5:83604/119‑1 (MQ=255) gCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCAAGGAAGGTGAAAAGGTCGAAGCTg > 7:274835/1‑149 (MQ=255) | TCGGCGTTATCGCTGCCCAGTCGATCGGTGAGCCGGGTACCCAGCTGACCATGCGTACGTTCCACATCGGTGGTGCTGCAAGCCGTACCTCGGCTGCCGACAGCGTCCAGGTTAAGAATGGCGGTATGGTGCGT‑CTGCACAACCTGAAGCAGGTTGAGCGTGCCGACGGTAACCTGGTTGCCGTATCGCGTTCGGGTGAGTTGGCGATTGCTGACGAGTTCGGTCGTGAGCGTGAGCGCTACAAGCTGCCTTACGGTGCGGTGATTTCGGTCAAGGAAGGTGAAAAGGTCGAAGCTG > NC_002947/544504‑544800 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |