| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 6,073,444 | G→A | 8.5% | P271L (CCA→CTA) ‡ | PP_5327 ← | phosphate ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,073,444 | 0 | G | A | 8.5% | 266.8 / 10.2 | 94 | P271L (CCA→CTA) ‡ | PP_5327 | phosphate ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (46/39); new base A (6/2); total (52/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
CGGCCATGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTC > NC_002947/6073298‑6073586 | cGGCCATGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGc < 1:304669/149‑1 (MQ=255)cGGCCATGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGc < 5:143009/149‑1 (MQ=255) tCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCa > 4:256421/1‑149 (MQ=255) atcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCtt > 8:294306/1‑149 (MQ=255) tcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTg < 4:176710/149‑1 (MQ=255) caCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTAGTCCCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGc > 2:57613/1‑149 (MQ=255) tACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAgg < 6:360765/149‑1 (MQ=255) ccGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGATGAGGAACTCCCAGACATTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGATGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGtt > 5:318483/1‑149 (MQ=255) gAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGa > 7:90601/1‑149 (MQ=255) gATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGAttt > 3:89349/1‑149 (MQ=255) ggCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCa > 3:38334/1‑149 (MQ=255) gCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCa < 2:64594/148‑1 (MQ=255) gCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCa < 7:99427/148‑1 (MQ=255) ccGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACt > 1:205681/1‑149 (MQ=255) cGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACtt > 6:334747/1‑149 (MQ=255) gAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCAc < 3:256421/149‑1 (MQ=255) aTACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGcc > 8:278189/1‑149 (MQ=255) tACCGCCCTCGGTTGTGGCTTCACGCGGGTCCTCGCTGAGGAACTGCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCg < 8:34012/149‑1 (MQ=255) aCCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGt > 2:95223/1‑149 (MQ=255) 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gCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac > 3:238089/1‑149 (MQ=255) ttCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac > 6:32203/1‑147 (MQ=255) ttCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac > 1:180986/1‑147 (MQ=255) aCGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGc > 7:353432/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGc > 7:224448/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGc > 3:136717/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGc > 6:213723/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTcgc > 7:214310/1‑149 (MQ=255) gtcgCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg < 1:57613/148‑1 (MQ=255) gtcgCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg < 4:38334/148‑1 (MQ=255) gCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaa < 2:180986/148‑1 (MQ=255) gAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg < 6:321031/124‑1 (MQ=255) gAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg > 5:321031/1‑124 (MQ=255) aGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaaaa < 6:165536/147‑1 (MQ=255) aGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGGGAACGCCGACCTGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCTGGaaaaacc < 5:116443/149‑3 (MQ=255) gAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCt > 4:171671/1‑149 (MQ=255) gAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCt > 3:115320/1‑149 (MQ=255) aCTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTgg < 5:172239/149‑1 (MQ=255) tCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt > 3:226437/1‑148 (MQ=255) tCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg > 5:280587/1‑149 (MQ=255) tCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg > 2:328418/1‑149 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg < 5:182967/115‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg > 6:182967/1‑115 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac < 3:255054/120‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac > 4:255054/1‑120 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaaaa > 7:166237/1‑139 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaaaa < 8:166237/139‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt < 4:226437/146‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg > 2:91844/1‑147 (MQ=255) cAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAg < 5:32203/149‑1 (MQ=255) cAGACCTTGCCGAAGTAGGTG‑CCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAgg > 6:281053/1‑149 (MQ=255) aGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTCGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAgg > 3:352538/1‑149 (MQ=255) 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gCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCt > 6:41795/1‑149 (MQ=255) tgcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGTACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCt < 6:262799/101‑1 (MQ=38) tgcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGTACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCt > 5:262799/3‑103 (MQ=38) tgcATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt > 5:328767/3‑149 (MQ=255) gACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 4:115320/149‑1 (MQ=255) cATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt > 6:179796/1‑147 (MQ=255) cATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCa > 3:21349/1‑149 (MQ=255) aTGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAGAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGc > 8:97013/1‑118 (MQ=255) aTGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAACAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGc < 7:97013/118‑1 (MQ=255) aTGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAg > 4:184491/1‑149 (MQ=255) aTGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAg < 3:184491/149‑1 (MQ=255) tGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGt > 2:252861/1‑149 (MQ=255) gCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTa < 4:158922/135‑1 (MQ=255) gCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTa > 3:158922/1‑135 (MQ=255) gCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCGTGCTCAGGGTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAACGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGACTACGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt > 5:282544/1‑144 (MQ=255) gCCGGTTGGCTGATCGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGTTTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 6:282544/144‑1 (MQ=255) ccGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTc > 1:98909/1‑149 (MQ=255) | CGGCCATGATCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTC > NC_002947/6073298‑6073586 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |