Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,073,448 | G→A | 8.3% | Q270* (CAG→TAG) ‡ | PP_5327 ← | phosphate ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,073,448 | 0 | G | A | 8.3% | 277.8 / 10.2 | 96 | Q270* (CAG→TAG) ‡ | PP_5327 | phosphate ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/40); new base A (6/2); total (54/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTC > NC_002947/6073307‑6073595 | tCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCa > 4:256421/1‑149 (MQ=255) atcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCtt > 8:294306/1‑149 (MQ=255) tcaCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTg < 4:176710/149‑1 (MQ=255) caCGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTAGTCCCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGc > 2:57613/1‑149 (MQ=255) tACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAgg < 6:360765/149‑1 (MQ=255) ccGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGATGAGGAACTCCCAGACATTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGATGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGtt > 5:318483/1‑149 (MQ=255) gAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGa > 7:90601/1‑149 (MQ=255) gATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGAttt > 3:89349/1‑149 (MQ=255) ggCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCa > 3:38334/1‑149 (MQ=255) gCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCa < 7:99427/148‑1 (MQ=255) gCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCa < 2:64594/148‑1 (MQ=255) ccGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACt > 1:205681/1‑149 (MQ=255) cGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACtt > 6:334747/1‑149 (MQ=255) gAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCAc < 3:256421/149‑1 (MQ=255) aTACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGcc > 8:278189/1‑149 (MQ=255) tACCGCCCTCGGTTGTGGCTTCACGCGGGTCCTCGCTGAGGAACTGCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCg < 8:34012/149‑1 (MQ=255) aCCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGt > 2:95223/1‑149 (MQ=255) cGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTg > 5:165536/1‑149 (MQ=255) cGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTg > 6:172239/1‑149 (MQ=255) 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ttCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac > 6:32203/1‑147 (MQ=255) aCGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGc > 7:224448/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGc > 3:136717/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGc > 7:353432/1‑149 (MQ=255) aCGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGc > 6:213723/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTcgc > 7:214310/1‑149 (MQ=255) gtcgCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg < 4:38334/148‑1 (MQ=255) gtcgCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCgg < 1:57613/148‑1 (MQ=255) gCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaa < 2:180986/148‑1 (MQ=255) gAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg > 5:321031/1‑124 (MQ=255) gAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg < 6:321031/124‑1 (MQ=255) aGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaaaa < 6:165536/147‑1 (MQ=255) aGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGGGAACGCCGACCTGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCTGGaaaaacc < 5:116443/149‑3 (MQ=255) gAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCt > 4:171671/1‑149 (MQ=255) gAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCt > 3:115320/1‑149 (MQ=255) aCTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTgg < 5:172239/149‑1 (MQ=255) tCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt > 3:226437/1‑148 (MQ=255) tCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg > 5:280587/1‑149 (MQ=255) tCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg > 2:328418/1‑149 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg < 5:182967/115‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg > 6:182967/1‑115 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac > 4:255054/1‑120 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGccac < 3:255054/120‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaaaa > 7:166237/1‑139 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGaaaaa < 8:166237/139‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt < 4:226437/146‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTg > 2:91844/1‑147 (MQ=255) cAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAg < 5:32203/149‑1 (MQ=255) cAGACCTTGCCGAAGTAGGTG‑CCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAgg > 6:281053/1‑149 (MQ=255) aGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTCGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAgg > 3:352538/1‑149 (MQ=255) ttGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGt > 2:101044/1‑149 (MQ=255) ccGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg > 7:291749/1‑105 (MQ=255) ccGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTGTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCgg < 8:291749/105‑1 (MQ=255) acGAAGTAGGTGACCAAATTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTTGCTGAACGGCATGCACTACCTTTCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCa < 6:318483/147‑1 (MQ=255) 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ccAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATa < 1:91844/149‑1 (MQ=255) ccAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATa < 8:353432/149‑1 (MQ=255) aaCTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGc < 8:214310/149‑1 (MQ=255) aCTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGcc < 8:224448/149‑1 (MQ=255) aCTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGcc < 4:136717/149‑1 (MQ=255) ttGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCtt < 4:89349/149‑1 (MQ=255) ggTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCtt < 1:189381/147‑1 (MQ=255) ggTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTg < 4:238089/148‑1 (MQ=255) tcaaCTCCGACATGACTTTTGGCTGAACGGCATGCACAAACTTCCTAAGGTTGATTTCCACTTCACGGACGTTGACATCCCCGGACACAAGGATGTATCGCGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGCTAAGGCGGTCTTCGATAGCCttc > 6:222348/3‑145 (MQ=255) aaCGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGTTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCg > 1:60068/1‑149 (MQ=255) 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gACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 4:115320/149‑1 (MQ=255) cATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt > 6:179796/1‑147 (MQ=255) cATGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCa > 3:21349/1‑149 (MQ=255) aTGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAGAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGc > 8:97013/1‑118 (MQ=255) aTGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAACAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGc < 7:97013/118‑1 (MQ=255) aTGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAg > 4:184491/1‑149 (MQ=255) aTGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAg < 3:184491/149‑1 (MQ=255) tGCCGTTCAGCCAAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGt > 2:252861/1‑149 (MQ=255) gCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTa < 4:158922/135‑1 (MQ=255) gCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTa > 3:158922/1‑135 (MQ=255) gCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCGTGCTCAGGGTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAACGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGACTACGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt > 5:282544/1‑144 (MQ=255) gCCGGTTGGCTGATCGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGTTTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 6:282544/144‑1 (MQ=255) ccGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTc > 1:98909/1‑149 (MQ=255) gCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACg < 6:280587/148‑1 (MQ=255) cTGAAGGGCATGAACTTCCTTGATCAGGTTTATTTCCAGTTTACGGCCGTAGCCATGCGGGTCCACCAGGCTGTAGCTGGAAAAAGACTGGTGCAGGCGGTTCATGAGGTCTTCTATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACgg < 5:222348/148‑1 (MQ=255) tGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTc > 5:341150/1‑149 (MQ=255) tGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTc > 1:16960/1‑149 (MQ=255) | TCAGGGTCATCATCACGGTACCGAAGATGGCCGGGAAGATACCGCCCTCGGTGTTGGCTTCACGCGGGTCGTCGCTGAGGAACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTC > NC_002947/6073307‑6073595 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |