| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,075,747 | G→C | 5.2% | A272G (GCC→GGC) | PP_5328 ← | phosphate ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,075,747 | 0 | G | C | 5.2% | 253.2 / 3.3 | 77 | A272G (GCC→GGC) | PP_5328 | phosphate ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/37); new base C (2/2); total (38/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.18e-01 | |||||||||||
GGCCAGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCAC > NC_002947/6075602‑6075895 | ggCCAGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACATCTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGCCAc > 6:47436/1‑149 (MQ=255)ccccAGCCCCCCCTTGGAGGCCCCGATGAGCAGCGCCCGGCCGCCCACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTCCTGTCGGTGTCGGCGCTATCAGACCCCTTGTAACGGCCGGTGAGGCGCGTGGCGCGCAGGCTGACCACGTCGGCCGTGGc < 6:379630/145‑1 (MQ=255) gCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCg < 1:228555/149‑1 (MQ=255) ccccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGtt < 4:158787/149‑1 (MQ=255) ccccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGCCACGGCCgac < 5:47436/149‑3 (MQ=255) ccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGa > 6:105820/1‑149 (MQ=255) ccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGCCACGGCCgacgt < 2:217182/149‑5 (MQ=255) gAGGCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTa < 4:96298/149‑1 (MQ=255) aCCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGc > 3:296555/1‑148 (MQ=255) gatgatCAGCGAAATGCCGCCAACCAGGTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGt < 3:195975/149‑1 (MQ=255) gatCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGc < 1:342612/142‑1 (MQ=255) gatCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGc > 2:342612/1‑142 (MQ=255) gatCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCt > 7:283769/1‑149 (MQ=255) gatCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCt > 6:190292/1‑149 (MQ=255) tCAGAGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTgg < 8:299592/149‑1 (MQ=255) gCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCACGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCg > 1:45600/1‑149 (MQ=255) gCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCg < 4:112576/148‑1 (MQ=255) gCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCg > 3:112576/1‑148 (MQ=255) gCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCg < 2:45600/148‑1 (MQ=255) gAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTgg > 6:187709/1‑149 (MQ=255) cgccAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGAt > 7:34865/1‑148 (MQ=255) cgccAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGAt > 2:107787/1‑148 (MQ=255) gccAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGGCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGa < 5:190292/149‑1 (MQ=255) cAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTAGAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAg < 7:80141/149‑1 (MQ=255) cAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATg > 5:347857/1‑146 (MQ=255) aaCCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTgg > 3:245073/1‑101 (MQ=255) aaCCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTgg < 4:245073/101‑1 (MQ=255) aCCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGat < 6:129679/149‑1 (MQ=255) aGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGata > 5:22323/1‑147 (MQ=255) aGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGata < 6:22323/147‑1 (MQ=255) gCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGTCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATAttc < 7:114732/149‑1 (MQ=255) ggCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCa < 2:41828/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCAcc > 6:222017/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGAGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCAcc > 6:216785/1‑149 (MQ=255) gCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCa < 5:306844/142‑1 (MQ=255) gCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCa > 6:306844/1‑142 (MQ=255) gCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGtctc > 5:326196/1‑149 (MQ=255) cA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCg < 6:347857/149‑1 (MQ=255) a‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCgg > 2:254470/1‑149 (MQ=255) a‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCgg > 1:336658/1‑149 (MQ=255) gTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGt < 1:254470/149‑1 (MQ=255) tttCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAg < 3:79105/125‑1 (MQ=255) tttCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAg > 4:79105/1‑125 (MQ=255) tttCGGTGTCAGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCAtt > 4:266441/1‑149 (MQ=255) ggTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCg < 8:34865/149‑1 (MQ=255) gtgtCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCgg < 6:326196/149‑1 (MQ=255) tCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAg > 6:304582/1‑149 (MQ=255) tCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAg > 2:274457/1‑149 (MQ=255) tATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATg > 2:361250/1‑149 (MQ=255) tATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATg > 4:210982/1‑149 (MQ=255) aGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTACGGCAGTTCGATGCgg < 4:182267/148‑1 (MQ=255) gACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGtt > 2:181158/1‑149 (MQ=255) gACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGtt > 4:321089/1‑149 (MQ=255) cTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGACGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCt > 6:55588/1‑149 (MQ=255) gTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTc < 4:296555/147‑1 (MQ=255) gTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCg < 5:105820/148‑1 (MQ=255) tAAAGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGTCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATTAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCgg < 5:318914/148‑1 (MQ=255) aCGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACCCGTCGGCCGTGGCACGGCCGGTGATCACTTACAGCCTTTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGTTTCTGCTCggtg < 8:266797/148‑1 (MQ=255) aCGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCggtg < 5:216785/148‑1 (MQ=255) aCGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGGTCTGCTCggtg < 5:222017/148‑1 (MQ=255) ggCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTg > 5:270481/1‑118 (MQ=255) ggCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTg < 6:270481/118‑1 (MQ=255) ggCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCggtggt > 3:313219/1‑148 (MQ=255) ggCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGgtggtg < 8:277781/149‑1 (MQ=255) ggCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGgtggtg < 3:210982/149‑1 (MQ=255) ccGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGAc < 1:107787/149‑1 (MQ=255) ggCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCg < 4:313219/149‑1 (MQ=255) ctctTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGt > 2:795/1‑149 (MQ=255) tctTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGt > 6:12886/1‑148 (MQ=255) tctTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGt > 6:25218/1‑148 (MQ=255) cgcgCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGtctc > 3:49235/1‑91 (MQ=255) cgcgCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGtctc < 4:49235/91‑1 (MQ=255) acacGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCgg < 3:266441/149‑1 (MQ=255) caacGGCCGTGCCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGt > 4:211300/4‑148 (MQ=255) gTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCg < 5:180339/109‑1 (MQ=255) gTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCg > 6:180339/1‑109 (MQ=255) gTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGt > 3:57420/1‑147 (MQ=255) ccGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTc > 8:347102/1‑148 (MQ=255) cGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCAAGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGa < 5:187709/149‑1 (MQ=255) gCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGaccac < 1:120908/149‑1 (MQ=255) | GGCCAGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCA‑GTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCAC > NC_002947/6075602‑6075895 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |