| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,096,215 | A→T | 7.1% | G161G (GGT→GGA) | pycA ← | pyruvate carboxylase subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,096,215 | 0 | A | T | 7.1% | 195.2 / 4.8 | 70 | G161G (GGT→GGA) | pycA | pyruvate carboxylase subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/33); new base T (3/2); total (35/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.29e-01 | |||||||||||
GCCTCGATGTGCTTAGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCTTCGGTCTTGTCGCCCA > NC_002947/6096069‑6096363 | gcCTCGATGTGCTTAGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCaccacc > 6:116518/1‑149 (MQ=255)gcCTCGATGTGCTTAGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCaccacc > 3:77064/1‑149 (MQ=255) ccTCGATGTGCTTAGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCg < 5:228843/149‑1 (MQ=255) ccTCGATGTGCTTAGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCAGTGGGAAGTTATGTTCCAGATCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCg > 3:335100/1‑149 (MQ=255) cTCGATGTGCTTAGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCg > 1:111936/1‑148 (MQ=255) tCGATGTGCTTAGGGTTGACGAGTCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCg > 7:237129/1‑147 (MQ=255) aTGTGCTTAGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGt < 2:280219/149‑1 (MQ=255) tgtgCTTAGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTg < 5:116518/149‑1 (MQ=255) gCTTAGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGcc > 6:342964/1‑149 (MQ=255) gCTTAGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGcc > 4:297397/1‑149 (MQ=255) aGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGCCCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCACCGGCGATTACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCtt > 2:309573/1‑147 (MQ=255) aGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCtt < 3:252386/147‑1 (MQ=255) gggTTGAGGATGCATTTCTCGAGGAAGACTTCGGCCGAACCGAATTCCTTGGTCTCCTCGGAAATGACGCGTTGGAAGTTCTGTTCGAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACGTGGGTCGCCAGGACCGTTGGTGGCGTTGAg < 4:335100/149‑1 (MQ=255) gggTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGa < 4:353786/148‑1 (MQ=255) ggTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAg > 7:235533/1‑148 (MQ=255) aCGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCTCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCAc < 1:104/149‑1 (MQ=255) cGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCAcc < 8:235533/149‑1 (MQ=255) gATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCg < 8:73477/149‑1 (MQ=255) tGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGa < 8:98228/149‑1 (MQ=255) aTTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTTTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATaa > 4:275565/1‑149 (MQ=255) aTTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATaa > 8:76387/1‑149 (MQ=255) tttCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAAc < 2:111936/149‑1 (MQ=255) tttCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAAc > 6:7823/1‑149 (MQ=255) tctcCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAAcc < 4:150140/148‑1 (MQ=255) ggAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCgg < 4:178348/149‑1 (MQ=255) gAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGt < 8:237129/149‑1 (MQ=255) gAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTATTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGt < 3:275565/149‑1 (MQ=255) aaCACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTc < 4:77064/149‑1 (MQ=255) aaCACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTc < 4:119355/149‑1 (MQ=255) gaaccgaaTGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAg > 2:163943/1‑149 (MQ=255) aaccgaaTGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAgg > 7:106990/1‑149 (MQ=255) cTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGAt < 1:366084/120‑1 (MQ=255) cTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGAt > 2:366084/1‑120 (MQ=255) cTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGaa > 1:349145/1‑149 (MQ=255) ttGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGTCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTc > 6:31319/1‑125 (MQ=255) ttGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTc < 5:31319/125‑1 (MQ=255) gTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATc < 3:297397/149‑1 (MQ=255) gCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCgg > 2:266090/1‑148 (MQ=255) gCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCgg < 2:109870/148‑1 (MQ=255) gCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAAACGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCgg > 1:343683/1‑148 (MQ=255) ccTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCa > 8:22452/1‑149 (MQ=255) cTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCaa < 7:76387/149‑1 (MQ=255) gTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTg > 8:218417/1‑149 (MQ=255) aaGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCgg < 8:259787/149‑1 (MQ=255) aGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCggg < 6:5732/149‑1 (MQ=255) gTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCgggg < 2:37851/149‑1 (MQ=255) ttCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTAcc < 5:7823/148‑1 (MQ=255) ttCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCg > 6:46025/1‑149 (MQ=255) tCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACG‑TACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGc > 1:115665/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCgg < 6:2980/117‑1 (MQ=255) ccAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCgg > 5:2980/1‑117 (MQ=255) aGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCaa < 6:147941/118‑1 (MQ=255) ttcGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACcgg > 7:34899/1‑149 (MQ=255) gcgGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACcggcgg > 8:264359/1‑149 (MQ=255) gCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATg < 5:342964/148‑1 (MQ=255) cAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATg > 3:11383/1‑89 (MQ=255) cAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATg < 4:11383/89‑1 (MQ=255) aaCGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTg > 4:333517/1‑149 (MQ=255) aaCGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTg > 1:168610/1‑149 (MQ=255) cGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCACCGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTgcg > 3:278634/1‑149 (MQ=255) gAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGgcgc > 7:99002/1‑149 (MQ=255) aTACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGgcgcgc < 1:163943/149‑1 (MQ=255) aCCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCtt > 1:369857/1‑149 (MQ=255) cACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCTTCg > 1:349369/1‑149 (MQ=255) aCGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCTTCgg > 2:63416/1‑149 (MQ=255) tcaaggccACCTCCGGTGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTTAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCtt < 7:112761/140‑1 (MQ=255) tcaaggccACCTCCGGTGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTTAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCtt > 8:112761/6‑145 (MQ=255) tcaaggccACCTCCGGTGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCTTCGGt > 7:225807/6‑149 (MQ=255) ggCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCTTCGGTc < 8:34899/149‑1 (MQ=255) aaggccACCTCCGGTGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATGGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACcggc > 1:119812/4‑120 (MQ=255) aaggccACCTCCGGTGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACcggc < 2:119812/117‑1 (MQ=255) ccgccACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCTTCGGTCtt < 2:369857/149‑1 (MQ=255) ccaccGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCTTCg < 3:37626/138‑1 (MQ=255) ccaccGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCTTCg > 4:37626/1‑138 (MQ=255) ccaccGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCTTCGGTCTTGTCGcc < 7:264359/149‑1 (MQ=255) accGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCTTCGGTCTTGTCGCCCa > 6:264807/1‑149 (MQ=255) | GCCTCGATGTGCTTAGGGTTGACGATGCATTTCTCCAGGAACACTTCGGCCGAACCGAATGCCTTGGTCGCCTCGGAAATGACCCGTGGGAAGTTCTGTTCCAGTTCTTCGCGGCTATTGCAACGGCGAATACCACGGCCGCCACCACCGGAGGTGGCCTTGAGCATCACCGGATAACCGATGCGGTCACCTTCGCTCAGGGCTTCATGAATATCGGCAACGTTACCTTCGGTGCCCGGGGTTACCGGCACACCGGCGGCGATCATGGTGCGGCGCGCTTCGGTCTTGTCGCCCA > NC_002947/6096069‑6096363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |