Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 593,891 | C→T | 8.3% | L83L (CTG→CTA) ‡ | oprG ← | outer membrane protein OprG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 593,891 | 0 | C | T | 8.3% | 172.9 / 4.4 | 60 | L83L (CTG→CTA) ‡ | oprG | outer membrane protein OprG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/30); new base T (2/3); total (27/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.52e-01 |
GCGTACGGCTGGAAGCGCGAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGTTCGGGGCGGTGGTGATG > NC_002947/593745‑594038 | gCGTACGGCTGGAAGCGCGAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCcag < 5:106378/149‑1 (MQ=255) cGTACGGCTGGAAGCGCGAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCcag‑c < 6:29889/149‑1 (MQ=255) ggCTGGAAGCGCGAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTc > 1:330073/1‑149 (MQ=255) cTGGAAGCGCGAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCTGG‑CAGCtacc < 4:330316/149‑4 (MQ=255) cTGGAAGCGCGAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCTGG‑CAGCtacc < 4:335679/149‑4 (MQ=255) cTGGAAGCGCGAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCa < 7:225247/149‑1 (MQ=255) cTGGAAGCGCGAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGGCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCTGG‑CAGCtacc < 2:64258/149‑4 (MQ=255) gAAGCGCGAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAgg < 3:292186/148‑1 (MQ=255) gAAGCGCGAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAg < 5:123497/147‑1 (MQ=255) gAAGCGCGAATTTGCCTCCATTTCGTACTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACTGTGTTCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGc < 5:202304/149‑1 (MQ=255) cgcgAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGAt < 6:366597/149‑1 (MQ=255) cgcgAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGAt < 3:234943/149‑1 (MQ=255) gAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACTGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGAtg < 8:146608/147‑1 (MQ=255) ggCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCa > 4:322182/1‑133 (MQ=255) ggCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCa < 3:322182/133‑1 (MQ=255) gCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTg < 6:52013/149‑1 (MQ=255) cTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGa < 3:288464/149‑1 (MQ=255) cATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGTGGAAGTTGCTTGATGTGGGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCAGCACAGAGCTTTTACGACGATGGTGTGATTGATCGGGTTAGATTCCAG‑CAGCTCCAGGAAGATTTGGTGGGTGAGc < 6:152017/148‑1 (MQ=255) ttGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAGCCAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCAt < 1:34729/149‑1 (MQ=255) gggTAGTACTGCAGCGTCTGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGGTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGt < 8:54605/148‑1 (MQ=255) ggTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACC‑TTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAg < 6:300494/148‑1 (MQ=255) gtagtaCTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAgg < 4:111858/149‑1 (MQ=255) tagtaCTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAg > 4:223231/1‑147 (MQ=255) tagtaCTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAg < 3:223231/147‑1 (MQ=255) cTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAg < 2:172922/148‑1 (MQ=255) tGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGAtg < 1:13135/123‑1 (MQ=255) tGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGAtg > 2:13135/1‑123 (MQ=255) tGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAg > 2:259222/1‑147 (MQ=255) tGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAg < 1:259222/147‑1 (MQ=255) cAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGAt < 6:249486/120‑1 (MQ=255) cAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGAt > 5:249486/1‑120 (MQ=255) gCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAgg > 5:283861/1‑149 (MQ=255) aCAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGcc > 5:326955/1‑148 (MQ=255) gcggcAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTa > 3:165544/1‑149 (MQ=255) ccGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGGGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGcc > 5:241112/1‑149 (MQ=255) gCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCg < 6:280103/132‑1 (MQ=255) gCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCg > 5:280103/1‑132 (MQ=255) aGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGt < 4:890/149‑1 (MQ=255) aGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGt < 8:28053/149‑1 (MQ=255) ttGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGcc > 5:24850/1‑149 (MQ=255) cAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCt < 3:196411/120‑1 (MQ=255) cAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCt > 4:196411/1‑120 (MQ=255) ccgccgCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCttgtt < 7:225950/149‑1 (MQ=255) ccgccgCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCttgtt < 6:283861/149‑1 (MQ=255) cgccCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCg < 6:214919/149‑1 (MQ=255) gACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAAc < 6:326955/149‑1 (MQ=255) cTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACtt > 3:198075/1‑148 (MQ=255) ttttACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACtt > 6:160256/1‑147 (MQ=255) tttACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAg > 7:51407/1‑149 (MQ=255) ttACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAg < 2:330073/148‑1 (MQ=255) gCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTcgc > 1:258278/1‑149 (MQ=255) gACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTcgccgc < 4:165544/149‑1 (MQ=255) gtgCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGt > 4:316627/1‑125 (MQ=255) gtgCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGACGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGctct > 3:260196/1‑149 (MQ=255) cTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATAGCTGTCCAGGTTCGCCTTGGTGCCCGCCACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGt > 2:17902/1‑149 (MQ=255) ttGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGAATCGATGTCCAGGTTCGCCTTCGTGCCCGACACCTTGTTGACGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGtt > 7:45914/1‑149 (MQ=255) cctggaGCTGCTGG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGTTCGGGGc > 6:186297/6‑149 (MQ=255) cctggaGCTGCTGG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGTTCGGGGc > 4:53268/6‑149 (MQ=255) tAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGTTCGGGGCggtg > 6:11307/1‑149 (MQ=255) gCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGTTCGGGGCggtggt > 2:326540/1‑149 (MQ=255) gCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGTTCGGGGCggtggt > 5:140442/1‑149 (MQ=255) gCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGTTCGGGGCggtggt > 8:255785/1‑149 (MQ=255) ccAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGTTCGGGGCGGTGGTGATg < 6:140442/149‑1 (MQ=255) ccAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGTTCGGGGCGGTGGTGATg > 4:121245/1‑149 (MQ=255) | GCGTACGGCTGGAAGCGCGAATTTGGCTCCATTGGGTAGTACTGCAGCGACAGCGTTGGCGGCAGTTGCTTGATGTCCGCCAGCTTGCCGTCCAGCCCGCCGCCCAGACCTTTTACGCCGACGGTGTGCTTGAACGGGGTAGCTGCCAG‑CAGCTCCAGGCCGATGTGGTCGGTGAGCATGTAGGCAAAGGTCAGGCCCAACTGGGTATCGCTGTCCAGGGTCGCCTTGGTGCCCGACACCTTGTTGCCGTCGAACTTGAGGTCGCCGCTGCTCTCGTTCGGGGCGGTGGTGATG > NC_002947/593745‑594038 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |