| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 693,590 | C→G | 6.7% | G151A (GGC→GCC) | PP_0595 ← | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 693,590 | 0 | C | G | 6.7% | 249.9 / 6.0 | 85 | G151A (GGC→GCC) | PP_0595 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/37); new base G (3/3); total (45/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
GTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGCTCGCCGCGC > NC_002947/693442‑693736 | gtcTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACCGTTGATACTCAAGCCCCGATAACCGGCAGGTCTGTGGTACGACCCCAACGTG‑CAGGCTGCCCTCGAACA‑CGc > 1:349572/1‑149 (MQ=255) tcTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGcc > 1:17834/1‑149 (MQ=255) tATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGt > 5:290442/1‑149 (MQ=255) tATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGt > 6:178382/1‑149 (MQ=255) tATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCAGTCGAGCA‑CGCCGt > 5:283292/1‑149 (MQ=255) tgctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTc > 2:47073/1‑149 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCTTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAACCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGGCGTGCTCGa < 6:365405/149‑1 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGACAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTc < 1:10834/148‑1 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGc < 8:46592/145‑1 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGa < 3:338617/149‑1 (MQ=255) gtcgGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACctgg < 6:83009/148‑1 (MQ=255) cGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGTTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTgggg < 6:283292/149‑1 (MQ=255) cGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTgggg < 2:17834/149‑1 (MQ=255) cGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTgggg < 1:344407/149‑1 (MQ=255) gTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGCCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CTCCGTGCTCGACCTGGCTggggg < 6:163316/149‑1 (MQ=255) aGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGGTGATACTCAAGCCCCGATAACCGGCTGGTCTGTGGCACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCAt < 1:261065/149‑1 (MQ=255) gTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGa < 2:248665/149‑1 (MQ=255) ggCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATc > 7:252055/1‑149 (MQ=255) attgagaCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGAt > 1:40399‑M1/8‑148 (MQ=255) atcaaccgttgtacagcgaacgctcgctgctgtactgcgcggttgATACTCAAGCCACGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAAAGTG‑CAGGCTGCCGTAGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCt > 4:216713‑M2/46‑149 (MQ=255) tcaaccgttgtacagcgaacgctcgctgctgtactgcgcggttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTg > 2:327894‑M2/45‑149 (MQ=255) ccAACCGCGCAGTACAGCGGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGCCGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGTGGCGC‑‑TCATGCGGATCtt > 6:262965/1‑148 (MQ=255) aaccgttgtacagcgaacgctcgctgctgtactgcgcggttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CCCCGTGCTCGCCCTGGCTGGGGGCGC‑‑TCATGCGGATCTGGa > 6:38933‑M2/43‑149 (MQ=255) AACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGGCGTGCTCGAc < 7:92113‑M1/120‑1 (MQ=255) AACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGGCGTGCTCGAc > 8:92113‑M1/1‑120 (MQ=255) ccgttgtacagcgaacgctcgctgctgtactgcgcggttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGACGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATg > 5:370763‑M2/41‑149 (MQ=255) CCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGa < 8:6758‑M1/147‑1 (MQ=255) CCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGa > 7:6758‑M1/1‑147 (MQ=255) ttgtacagcgaacgctcgctgctgtacaacggttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGca > 5:298942‑M2/36‑148 (MQ=255) ttgtacagcGAACGCTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGGCCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACAt > 5:320896/6‑148 (MQ=255) tACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCACCGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGCATCCAGATCCGcatga < 1:94404/149‑4 (MQ=255) cagcagCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAg > 7:214120/1‑149 (MQ=255) catcgagcgTTCGCTGTACAACTGTTGATACTCAAGCCCCGCTATCGGGCTGGGCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCGGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGc < 6:233055/146‑1 (MQ=255) cagcGCGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCACGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACCACGCCAACGGG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGGGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGc < 4:72304/149‑1 (MQ=255) agcgagcgTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTAGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGcc > 3:314431/1‑149 (MQ=255) cgatctgtCGCTGTACAACGGTTGATACTCACGCCCCGATAACGGGCTGGGCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGGCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGcccc < 6:364263/142‑1 (MQ=255) cgTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATc < 1:47073/149‑1 (MQ=255) gTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATAAGGGCCCCGATcc > 7:115208/1‑149 (MQ=255) gCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGa < 8:116480/149‑1 (MQ=255) gCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGa > 5:365810/1‑149 (MQ=255) tGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGa < 8:214120/147‑1 (MQ=255) tGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGt > 6:187916/1‑149 (MQ=255) gTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCC‑CGCCGGGCTCGACCGGGCGGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGGTGGGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAggt > 4:367292/1‑147 (MQ=255) gttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGa < 6:88649‑M2/134‑1 (MQ=255) gttgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGa > 5:88649‑M2/5‑138 (MQ=255) tgATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑GATTGCGGATATGGATGCGCCCATCAGGGCCCCCATCATTGAGTTCCGCCCGGGc > 7:271623‑M2/3‑149 (MQ=255) aCTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATgg > 3:135906/1‑149 (MQ=255) cTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATgg < 1:327894/148‑1 (MQ=255) cTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATgg < 7:21204/148‑1 (MQ=255) tCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCGTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGt > 2:297211/1‑149 (MQ=255) tCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑GCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATgggg > 8:322447/1‑148 (MQ=255) cccGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGccc > 3:244936/1‑114 (MQ=255) cccGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGccc < 4:244936/114‑1 (MQ=255) cccGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATATGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTTAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACg > 8:22245/1‑149 (MQ=255) ccGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACg > 4:139892/1‑148 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aGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGAt < 3:216713/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCGCCAGGTTGTCg > 5:203853/1‑136 (MQ=255) gCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCGCCAGGTTGTCg < 6:203853/136‑1 (MQ=255) tGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGtt > 3:340633/1‑148 (MQ=255) gCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCa < 5:38933/149‑1 (MQ=255) ccGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAg > 7:71005/1‑149 (MQ=255) ccGTCGAGAA‑CGCCGTGCGCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGTCCCCGATCATTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCTGTCAGGCCGATGTTc < 5:262965/147‑1 (MQ=255) ggTCGAGCA‑CGGCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGc > 1:368119/2‑149 (MQ=255) cGTCGAGCA‑CGCCGTGCGCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGCTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGc < 6:298942/149‑1 (MQ=255) gTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGc > 7:313751/1‑103 (MQ=255) gTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGc < 8:313751/103‑1 (MQ=255) tCGAGCA‑CGGCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCGTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGCGTCACCAGGTTGTCGGGCAGGCCGATGTTCAGCTc > 7:355744/1‑149 (MQ=255) gCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGCTcgccg > 7:288646/1‑149 (MQ=255) cGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGCTCGCcgcg > 2:234663/1‑148 (MQ=255) cGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGCTCGCCgcgc < 1:234663/149‑1 (MQ=255) | GTCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTG‑CAGGCTGCCGTCGAGCA‑CGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGA‑‑TCATGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGCTCGCCGCGC > NC_002947/693442‑693736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |