| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 704,281 | A→C | 7.6% | Q125P (CAG→CCG) | PP_5745 → | paraquat‑inducible protein A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 704,281 | 0 | A | C | 7.6% | 224.5 / 7.3 | 75 | Q125P (CAG→CCG) | PP_5745 | paraquat‑inducible protein A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/36); new base C (3/3); total (36/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
CCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGCCAACCTGG > NC_002947/704135‑704424 | accGGACATGATGGTGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGc > 7:297234/2‑149 (MQ=255) ccGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGcc > 1:49297/1‑149 (MQ=255) catcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCTGCCGCCGCtgaac > 1:120506/1‑144 (MQ=255) catcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCTGCCGCCGCtgaac < 2:120506/148‑5 (MQ=255) catcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTc < 2:342247/147‑1 (MQ=255) catcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTc > 1:342247/1‑147 (MQ=255) catcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCgg > 2:328810/1‑149 (MQ=255) atggtGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGc < 8:297234/145‑1 (MQ=255) atcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCTGCCGCCGCtgaacgg < 7:334681/149‑7 (MQ=255) tcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGcc > 8:2655/1‑149 (MQ=255) tcatGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGcc > 5:309501/1‑149 (MQ=255) catGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCTGCCGCCGCtgaacgga < 6:125953/148‑8 (MQ=255) atGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGGAGCCGCTTTCGGccc < 3:152797/148‑1 (MQ=255) atGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCg < 2:49297/149‑1 (MQ=255) tGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCgg < 4:127072/149‑1 (MQ=255) cGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGc > 1:120498/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCAAGTTCAAGCTGGTCGGCATCGGCTTGCTGTTGTAATCCGTTCAGCGGCGGCAGCAGCTTTCGGACAGGCAGCGGATATTGA‑‑t > 8:316959/1‑149 (MQ=255) cccTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑Tg < 7:295015/149‑1 (MQ=255) cttcTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTTGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGCCGGCAGCCGCTTTCGGACCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGt > 6:159544/4‑148 (MQ=255) cTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTAcc < 1:126323/148‑1 (MQ=255) cTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGGTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTCCTCCGTTCAGCGGCGGCCGCCGGTTTCGGCCGGGCAGCGGCTATTGA‑‑TGTACCg > 8:175604/1‑149 (MQ=255) tCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTCCCGc > 7:334881/1‑149 (MQ=255) tCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGc > 4:337332/1‑149 (MQ=255) cAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCt > 2:153641/1‑149 (MQ=255) cAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGATGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCAGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCt > 8:147273/1‑149 (MQ=255) cACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCAt > 5:165525/1‑149 (MQ=255) gCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGaa < 1:4995/149‑1 (MQ=255) tGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTc < 4:297416/149‑1 (MQ=255) cGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTg < 4:261539/148‑1 (MQ=255) cGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTg < 2:120498/148‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGc > 8:210827/1‑121 (MQ=255) tgtgGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGc < 7:210827/121‑1 (MQ=255) gtggtgTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCAt < 2:263192/149‑1 (MQ=255) gtTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTg > 8:195257/1‑148 (MQ=255) ttCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTTGTCCATGCTgg < 7:2655/148‑1 (MQ=255) cATTGCCAGTATACTGGTCCCCAAGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTTCTGTTTTAATCCGTTCATCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATTTTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTTGAc < 7:161500/148‑1 (MQ=255) aTTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACAt > 8:187880/1‑149 (MQ=255) aTTGCCAGAATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCAACGAATTCATTGGGCGCTGGTCCAAGCTGGACAt > 4:307571/1‑149 (MQ=255) gCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGATCTGGGTGGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGATGGACATc > 1:316268/1‑149 (MQ=255) ccAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGT‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTc < 1:284441/149‑1 (MQ=255) cAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCAtt < 4:319052/121‑1 (MQ=255) cAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCAtt > 3:319052/1‑121 (MQ=255) cAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCg > 6:138679/1‑149 (MQ=255) cAGTATCCTGGTCCCCACGATCAAGCTCGTGGGCATCGTCTTGCTGTTGTACTACGTTCAGCGGCTGCAGCCGCATTCGGCCCGGCAGCGGATAATGA‑‑TGTAACGCTTCATCGAATTGATTGGGCGCTGGACCTTGCTGGACAtaatcg > 4:278569/1‑144 (MQ=255) tCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCAtt < 7:195257/149‑1 (MQ=255) cTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGTTATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTg < 1:328810/148‑1 (MQ=255) tGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTTGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGc > 2:74536/1‑148 (MQ=255) ccACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCtg > 5:48575/1‑149 (MQ=255) aCGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCtggt < 6:48575/149‑1 (MQ=255) gTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCtggtgg > 3:169771/1‑149 (MQ=255) cAAGCTGGTGCGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTAACGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCAATGCTGGACATCTTCGTCAATGCCATCCAGGAGCCAg > 4:28027/1‑149 (MQ=255) aaGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAgt < 5:138679/149‑1 (MQ=255) aGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTTGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAgtg < 1:74536/149‑1 (MQ=255) aGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAgtg < 7:147273/149‑1 (MQ=255) gtggGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGaa > 6:228234/1‑149 (MQ=255) cATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTg < 7:175604/149‑1 (MQ=255) cATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTg < 7:187880/149‑1 (MQ=255) tgggCTTGCTGTTTTACTCGGTTCAGCGGCGGCAGGCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTTGGCGCTTGTCCATGCTGGACATCTTCTTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGc < 5:159544/147‑1 (MQ=255) tCGGCTTGCTGTTGGACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGc < 8:330344/149‑1 (MQ=255) tgttgtACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGAAATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCAAGCTGGACATCTTCCTCATTACCATCCAGGAGGCACTGGTGAATTTTGGCCGAATatc > 4:15870/1‑146 (MQ=255) gttgtACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCtggtgg > 2:271530/1‑122 (MQ=255) gttgtACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCtggtgg < 1:271530/122‑1 (MQ=255) ttgtACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCa < 4:169771/148‑1 (MQ=255) gtACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAgt < 1:153641/148‑1 (MQ=255) tCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAg < 4:72707/118‑1 (MQ=255) tCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAg > 3:72707/1‑118 (MQ=255) tCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGACATTGCCAACCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCg > 2:129038/1‑148 (MQ=255) ggccgaaaGCGGCTGCCGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCT‑GTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCg > 6:318504/8‑147 (MQ=255) cctgcAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATAATGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTTGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGaa < 8:113446/144‑1 (MQ=255) cGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGac < 6:309501/148‑2 (MQ=255) aGCGGCGGCAGCCGCTTTCGTCCCTGTAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGCCAAc < 3:15870/149‑1 (MQ=255) aGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGCCAAc > 6:48960/1‑149 (MQ=255) gcggcAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGCCAACCTgg < 8:334881/149‑1 (MQ=255) gcAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGc < 7:281082/118‑1 (MQ=255) gcAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGc > 8:281082/1‑118 (MQ=255) | CCCGGACACCATCATGTCCGGTGTCATCACCCTGCTCAAGCACGGCATGGTGCCCATTGCGGCTGTGGTGTTCATTGCCAGTATCCTGGTCCCCACGTTCAAGCTGGTGGGCATCGGCTTGCTGTTGTACTCCGTTCAGCGGCGGCAGCCGCTTTCGGCCCGGCAGCGGATATTGA‑‑TGTACCGCTTCATCGAATTCATTGGGCGCTGGTCCATGCTGGACATCTTCGTCATTGCCATCCTGGTGGCAGTGGTGAATTTTGGCCGAATAGCCAGTGTCGAAGCCAACCTGG > NC_002947/704135‑704424 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |