| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 713,098 | C→T | 7.2% | I29I (ATC→ATT) ‡ | lspA → | lipoprotein signal peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 713,098 | 0 | C | T | 7.2% | 245.3 / 6.2 | 83 | I29I (ATC→ATT) ‡ | lspA | lipoprotein signal peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/41); new base T (2/4); total (38/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.91e-01 | |||||||||||
CCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGG > NC_002947/712956‑713245 | ccATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAg < 5:249091/149‑1 (MQ=255) tCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑c < 3:285775/148‑1 (MQ=255) tCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑c > 4:285775/1‑148 (MQ=255) cGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑ccac > 1:271979/1‑149 (MQ=255) gAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGGTGG‑CCTGGTCGATGACCAggaccagca < 7:324978/149‑8 (MQ=255) gAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCGATGACCAggaccagc < 8:82412/149‑7 (MQ=255) aCCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCt < 6:317161/149‑1 (MQ=255) aCCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCt < 8:239659/149‑1 (MQ=255) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGCCAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGCCCAGG‑CCCCCAAGCTg > 7:43956/1‑148 (MQ=255) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCtca < 2:193836/149‑3 (MQ=38) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGCGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTg > 2:146847/1‑148 (MQ=255) tcttgatGCGGCAGTTGCGTAGACATCCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGCGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGGTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGt < 7:38554/140‑1 (MQ=255) aaaTCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACtt < 6:203976/149‑1 (MQ=255) aaTCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACtt > 1:98094/1‑148 (MQ=255) tGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTc < 1:26245/145‑1 (MQ=255) tGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTc > 2:26245/1‑145 (MQ=255) cGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTcaa < 2:86907/145‑1 (MQ=255) ggCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACg < 6:142779/149‑1 (MQ=255) gCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGc > 3:119541/1‑149 (MQ=255) cGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAAGGCTGCAGGGGGGCTCTTCGGGCGGCTTGCTTGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGAGGAGG‑CCACCAAGGTGTACTTCTAGAACGcgg < 6:132400/149‑3 (MQ=255) gCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGa < 1:235645/148‑1 (MQ=255) cGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTcaac > 6:275563/1‑137 (MQ=255) cGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTcaac < 5:275563/137‑1 (MQ=255) cGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGAc < 2:197025/148‑1 (MQ=255) gACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTg > 5:340129/1‑124 (MQ=255) gACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTg < 6:340129/124‑1 (MQ=255) gACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATg < 5:183658/148‑1 (MQ=255) gACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATg > 2:190885/1‑148 (MQ=255) cAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTAc < 4:285690/149‑1 (MQ=255) cAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTAc > 3:285690/1‑149 (MQ=255) aaCCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTAcc < 7:298124/149‑1 (MQ=255) aaCCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTAcc < 2:98094/149‑1 (MQ=255) aaCCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTAcc < 3:117957/149‑1 (MQ=255) aaCCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTAc > 7:88878/1‑148 (MQ=255) ccTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACcag < 8:326316/149‑1 (MQ=255) tGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACcag > 8:2877/1‑147 (MQ=255) aCCGGCGCGGGGGCCGTGCGCCACTCTGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCGGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCCTCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGa < 2:49299/149‑1 (MQ=255) gTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCAt > 1:115043/1‑149 (MQ=255) gcCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGacta < 5:86020/149‑1 (MQ=255) cACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCaacaac > 4:138706/1‑106 (MQ=255) cACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCaacaac < 3:138706/106‑1 (MQ=255) tGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAg < 7:2877/148‑1 (MQ=255) cTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAATCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTgg < 5:152584/149‑1 (MQ=255) cTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa > 3:328786/1‑136 (MQ=255) cTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa < 4:328786/136‑1 (MQ=255) cTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTg > 3:313142/1‑148 (MQ=255) aCCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAc < 8:88878/148‑1 (MQ=255) cccTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCAGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAccc > 6:139499/1‑149 (MQ=255) tGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAGGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGCCTACTTCAGCTGGACCCTgg > 2:93477/1‑149 (MQ=255) tGCAGAGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTgg > 3:97449/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCt > 8:108707/1‑149 (MQ=255) cGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCCTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTac < 7:290983/149‑1 (MQ=255) ggggCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTac > 4:271338/1‑148 (MQ=255) ggCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTacaa > 4:142112/1‑148 (MQ=255) ttCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCgg > 5:185248/1‑149 (MQ=255) ggCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGcc < 2:271979/149‑1 (MQ=255) gcgcCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa > 5:78550/1‑111 (MQ=255) gcgcCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa < 6:78550/111‑1 (MQ=255) cgcCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCGCTGACCATGTACCTGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCcgc < 4:313142/149‑1 (MQ=255) cgcCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCcgc < 4:97449/149‑1 (MQ=255) ccTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGt > 1:201514/1‑149 (MQ=255) ttGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGtt > 7:173832/1‑148 (MQ=255) gctgtggctgAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTcc < 1:190885/149‑1 (MQ=255) gctgAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACGATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGCCCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTg > 7:242443/1‑149 (MQ=255) ctgAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGa > 4:58909/1‑149 (MQ=255) acaGCTTGGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACtt > 1:342752/3‑97 (MQ=21) acaGCTTGGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACtt < 2:342752/95‑1 (MQ=21) ttGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa > 1:91327/1‑86 (MQ=255) ttGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGa < 2:91327/86‑1 (MQ=255) ctggtcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCgg < 3:81479/148‑1 (MQ=255) gtcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGac > 6:223164/1‑81 (MQ=255) gtcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGac < 5:223164/81‑1 (MQ=255) gtcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTg < 8:173832/149‑1 (MQ=255) ggcctggtcGATGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGGCCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTg > 3:73582/3‑149 (MQ=255) tcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTgg < 1:146847/149‑1 (MQ=255) tcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTgg < 2:201514/149‑1 (MQ=255) tggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAg > 1:375497/1‑149 (MQ=255) ggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGt < 8:22651/142‑1 (MQ=255) ggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGt > 7:22651/1‑142 (MQ=255) ggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGAACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAgc > 6:70673/1‑149 (MQ=255) aTCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTg > 5:28887/1‑149 (MQ=255) tCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCACCAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGGCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTgg < 8:43956/149‑1 (MQ=255) tCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTgg > 8:279714/1‑149 (MQ=255) | CCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCCTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGACCCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGG > NC_002947/712956‑713245 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |