| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 865,197 | T→C | 5.9% | K210R (AAG→AGG) | upp ← | uracil phosphoribosyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 865,197 | 0 | T | C | 5.9% | 203.1 / 2.1 | 67 | K210R (AAG→AGG) | upp | uracil phosphoribosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/33); new base C (2/2); total (32/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.41e-01 | |||||||||||
CGGCGGTGAACAGCGCGACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCTTTTTCCACCACCTCGATGCCTTCTGGTG > NC_002947/865049‑865341 | cggcggTGAACAGCGCGACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCTGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCt > 4:116305/1‑149 (MQ=255) ggcggTGAACAGCGCGACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCtt < 7:216370/149‑1 (MQ=255) cggTGAACAGCGCGACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCtttt < 5:55447/149‑1 (MQ=255) ggTGAACAGCGCGACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTg < 6:182341/149‑1 (MQ=255) tGAACAGCGCGACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCt > 8:261551/1‑149 (MQ=255) tGAACAGCGCGACGTTTGGGTCGAGGCCGGAGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCt < 2:163545/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGCGACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCtt < 6:252372/148‑1 (MQ=255) cAGCGCGACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGt < 5:222442/149‑1 (MQ=255) aGCGCGACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTg < 8:131727/149‑1 (MQ=255) gcgACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCg < 8:10899/149‑1 (MQ=255) gcgACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCAGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGcc > 6:36454/1‑148 (MQ=255) gACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCTCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTATGCTTGGTGCCg > 1:105233/1‑147 (MQ=255) gTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCg > 4:118089/1‑144 (MQ=255) gTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCCTTTGCTTGGTGCCg > 6:377559/1‑144 (MQ=255) tttGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATc > 1:185508/1‑149 (MQ=255) ggTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTg < 3:55744/148‑1 (MQ=255) tCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAAAGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCa > 4:60060/1‑149 (MQ=255) aGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCg < 2:303266/149‑1 (MQ=255) ggCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCgg > 6:280902/1‑149 (MQ=255) gTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCa > 3:171595/1‑149 (MQ=255) tGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCCTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCAc > 2:40086/1‑149 (MQ=255) tCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCtt < 7:246295/132‑1 (MQ=255) tCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCtt > 8:246295/1‑132 (MQ=255) aGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAgg > 8:104681/1‑149 (MQ=255) ggggCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGc > 8:110159/1‑149 (MQ=255) gggCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCAccc < 8:234511/144‑1 (MQ=255) ggCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGt < 6:306948/115‑1 (MQ=255) ggCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGt > 5:306948/1‑115 (MQ=255) cATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCCTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTgg < 5:377559/149‑1 (MQ=255) gCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGa > 4:335240/1‑149 (MQ=255) gCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGa > 2:233054/1‑149 (MQ=255) cACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGAt < 4:256496/149‑1 (MQ=255) cACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGAt > 3:172089/1‑149 (MQ=255) aCCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATg > 5:85444/1‑149 (MQ=255) gcgcCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCg > 6:329260/1‑149 (MQ=255) gcCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCCGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTCTCACCGGCATCACCCAGTCCTGGCACGATGTAGCCGTg > 5:289484/1‑149 (MQ=255) gAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTc < 6:85444/149‑1 (MQ=255) ccACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGtt > 6:102978/1‑147 (MQ=255) cACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCAc > 6:261905/1‑128 (MQ=255) cACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCAc < 5:261905/128‑1 (MQ=255) aaGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGgcgc < 1:16774/149‑1 (MQ=255) cATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGtc < 7:85039/149‑1 (MQ=255) cATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCCTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGtc < 1:40086/149‑1 (MQ=255) ccGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCgg > 7:272861/1‑149 (MQ=255) gAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGgtg > 4:126501/1‑149 (MQ=255) aaaCGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGgtgt < 7:104681/149‑1 (MQ=255) aCGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAg < 6:153257/149‑1 (MQ=255) ccTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCt > 7:154843/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCtt > 1:246587/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCt > 4:112669/1‑148 (MQ=255) gcgcCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCtt > 6:142724/1‑68 (MQ=255) gcgcCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCtt < 5:142724/68‑1 (MQ=255) gcgcCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCTGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCAc < 7:92353/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTc < 1:233054/147‑1 (MQ=255) gcgcCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTc < 3:335240/147‑1 (MQ=255) gagCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCgg < 3:116305/149‑1 (MQ=255) cGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGt < 5:36454/148‑1 (MQ=255) ttGAAGCGGTCCTGGATTGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCTCCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGTTCGATCGAGGCGTTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCtttt < 8:58725/149‑1 (MQ=255) tGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATc > 3:311458/1‑127 (MQ=255) tGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATc < 4:311458/127‑1 (MQ=255) gAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCttttt < 4:172089/148‑1 (MQ=255) aGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCTTTTTcca < 5:102978/149‑1 (MQ=255) gCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCTTTTTccac < 3:118089/149‑1 (MQ=255) cTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCTAGGCGGTGTAGATCTTCACTTCCGGGTGGGCTTTTTCCACCACCt < 3:60060/148‑1 (MQ=255) aTGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCTTTTTCCACCACCTCGATg < 3:112669/149‑1 (MQ=255) aGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCTTTTTCCACCACCTCGATGCCTTCt < 3:126501/149‑1 (MQ=255) gCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCTTTTTCCACCACCTCGATGCCTTCTgg > 5:348405/1‑149 (MQ=255) gTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCTTTTTccacc < 6:378802/130‑1 (MQ=255) gTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCTTTTTccacc > 5:378802/1‑130 (MQ=255) gTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCTTTTTCCACCACCTCGATGCCTTCTGGTg > 3:156889/1‑149 (MQ=255) ttttGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCgg < 6:163736/110‑1 (MQ=255) | CGGCGGTGAACAGCGCGACGTTTGGGTCGAGGCCGGTGATCAGGGGCATCAGCACCAGCGCGCCGAATGCCACGAAGAGCATCTGCGCGCCCGAAACGACCTGGCGCCAGAGCGGGTCGTTGAAGCCGTCCTGCATGGTCAGGCGTCCTTTTGCTTGGTGCCGAAGATCTTGTCACCGGCATCACCCAGGCCTGGCACGATGTAGCCGTGCTCGTTCAGGCGCTGGTCGATCGAGGCGGTGTAGATCTTCACGTCCGGGTGGGCTTTTTCCACCACCTCGATGCCTTCTGGTG > NC_002947/865049‑865341 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |