| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 925,343 | G→A | 5.6% | A428V (GCC→GTC) | PP_0805 ← | outer membrane efflux protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 925,343 | 0 | G | A | 5.6% | 214.8 / 2.2 | 71 | A428V (GCC→GTC) | PP_0805 | outer membrane efflux protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/36); new base A (2/2); total (33/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.59e-01 | |||||||||||
GGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAGGTTTGCGCCTTGGCCTCCGCCAG > NC_002947/925197‑925491 | ggATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCg > 4:289668/1‑149 (MQ=255)ggATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCg > 7:314390/1‑149 (MQ=255) gATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGt > 4:340037/1‑149 (MQ=255) cacaCCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAg > 4:205730/1‑147 (MQ=255) cacaCCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGc < 4:359565/148‑1 (MQ=255) acacCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAg < 3:340037/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCAACGCCGAGCAggaga < 7:165276/149‑4 (MQ=255) ttGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTc > 7:332329/1‑147 (MQ=255) ttGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTc > 4:340339/1‑147 (MQ=255) ttGAAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGAGTTGAGCAGGTc > 1:275287/1‑147 (MQ=255) gCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAg < 6:158902/148‑1 (MQ=255) cAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCa < 6:172335/149‑1 (MQ=255) gTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTACGAGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGt > 1:278770/1‑149 (MQ=255) gcCCCTCAAGGCCTAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCgt < 1:366099/149‑1 (MQ=255) gcCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCgt < 2:278770/149‑1 (MQ=255) gcCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCgt < 6:382853/149‑1 (MQ=255) cccTCTAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGAGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCTGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGTTAGATCTCCTGCTCTGCGTTGAGCATGTCGAGCAGTGGCCgt < 2:124559/147‑1 (MQ=255) cccTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCCGTCGACATCCAGGCGCAGCACATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCgt < 2:311581/147‑1 (MQ=255) cccTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCgtgt > 6:50157/1‑149 (MQ=255) cccTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAA‑AGGCAGTCGACATAAAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCgtg > 1:124559/1‑148 (MQ=255) ccTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTc < 2:98707/149‑1 (MQ=255) aaGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCgt < 3:290377/142‑1 (MQ=255) aaGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCgt > 4:290377/1‑142 (MQ=255) cgcAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGAc < 8:314390/148‑1 (MQ=255) gggCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCg < 5:360225/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGt < 2:60316/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCTTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTa < 5:232776/149‑1 (MQ=255) gcCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTaga < 8:332329/149‑1 (MQ=255) ccGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTagag > 4:11444/1‑149 (MQ=255) gtgtTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGtt < 8:68225/92‑1 (MQ=255) gtgtTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAg < 2:14205/128‑1 (MQ=255) gtgtTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTACTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAg > 1:14205/1‑128 (MQ=255) tgttgtAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTgg < 6:39122/109‑1 (MQ=255) tgttgtAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTgg > 5:39122/1‑109 (MQ=255) ttgtAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCg < 3:289668/149‑1 (MQ=255) gtAC‑ATGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGt < 2:125343/148‑1 (MQ=255) gCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTaga < 5:86895/134‑1 (MQ=255) gCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTaga > 6:86895/1‑134 (MQ=255) gACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATg < 2:212861/148‑1 (MQ=255) cATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGCAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTg < 1:10285/149‑1 (MQ=255) aTCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTgg < 8:103457/90‑1 (MQ=255) aTCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGc < 5:85392/127‑1 (MQ=255) aTCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGc > 6:85392/1‑127 (MQ=255) tCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGAc < 7:336928/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGc < 7:29738/149‑1 (MQ=255) cgcAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCg < 4:193663/149‑1 (MQ=255) gcagATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGctgact > 8:20049/1‑144 (MQ=255) gcagATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCt > 5:144287/1‑149 (MQ=255) gATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTc > 4:167560/1‑148 (MQ=255) gATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTc > 5:339551/1‑148 (MQ=255) gATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCATAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTc > 1:206790/1‑148 (MQ=255) ggAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGc > 8:152468/1‑148 (MQ=255) gAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCg > 3:91204/1‑148 (MQ=255) gAGCGGGTGCCGGCAAGATCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCg > 2:82248/1‑148 (MQ=255) aGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGaa < 3:340339/149‑1 (MQ=255) cggggTGCCGGCAAGTTGGAAGGGGGACTGGTACAACTCCTGGTGGGGGTTGACCAGGTCCTCCATGGGCCGGTTCCCTAGGTACCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGaa < 1:113679/147‑1 (MQ=255) gCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCg < 8:284058/129‑1 (MQ=255) gCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCg > 7:284058/1‑129 (MQ=255) cGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCcgg > 4:24196/1‑149 (MQ=255) gTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAg < 4:91204/149‑1 (MQ=255) aCTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAGGtt < 5:50157/149‑1 (MQ=255) tGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAGGTTTg > 2:319507/1‑149 (MQ=255) gTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAg > 1:193103/1‑142 (MQ=255) gTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAg < 2:193103/142‑1 (MQ=255) tAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAGGTTTgcgc < 3:205730/149‑1 (MQ=255) tcgaccTGCTCAACGCCGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCAGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAGGTTTGCGCCtt > 3:304542/5‑149 (MQ=255) aTCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGAACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAGGTTTGCGCCtt > 1:289237/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCAACGCCGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCGCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCcggcgg < 5:293193/122‑1 (MQ=255) ccTGCTCAACGCCGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCcggcgg > 6:293193/1‑122 (MQ=255) cTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAGGTTTGCGCCTTGGCCt > 5:215637/1‑149 (MQ=255) gCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCTGTGGCCGTGTCCGTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGGCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGACGGTTGCGCCTTGGCCTcc > 8:147462/1‑149 (MQ=255) gCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAGGTTTGCGCCTTGGCCTCCGCCAg < 6:339551/149‑1 (MQ=255) | GGATCTCCACACCTTGCAGGTTGCGCCCCTCAAGGCCAAAGGCCGTGCGCAGGGCGCCGGTGTTGTAC‑AGGCAGTCGACATCCAGGCGCAGCAGATCGGAGCGGGTGCCGGCAAGTTCGAAGCGTGACTGGTAGATCTCCTGCTCGGCGTTGAGCAGGTCGAGCAGTGGCCGTGTCCCTAGGT‑CCAGGTACTGACGCCCGTAGAGCATGCGTGCCTCCTGGATGCTGACCTGGCGGGCTTCCAGCGAAGTCAGCCGGCGGCCCAGCCCGGAGGTTTGCGCCTTGGCCTCCGCCAG > NC_002947/925197‑925491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |