Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,045,269 | G→A | 7.8% | intergenic (+42/+64) | PP_0905 → / ← PP_0906 | hypothetical protein/RND family multidrug transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,045,269 | 0 | G | A | 7.8% | 178.8 / 4.6 | 65 | intergenic (+42/+64) | PP_0905/PP_0906 | hypothetical protein/RND family multidrug transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/29); new base A (3/2); total (33/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.78e-01 |
CGTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGTAAACAACGTG > NC_002947/1045121‑1045417 | cgTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCgg < 3:35425/149‑1 (MQ=255) gcgGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCttt > 4:362817/1‑149 (MQ=255) ggATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCTCTggc < 7:5102/149‑2 (MQ=255) gCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGttttt > 2:255280/1‑149 (MQ=255) cAAAACCGCAGCAGCATGCCCGGAGCGAG‑CAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTg < 3:57743/149‑1 (MQ=255) cAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGtttttt < 3:244594/149‑1 (MQ=255) cAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTGTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGtttttt < 4:229776/149‑1 (MQ=255) aaaaCCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTGCCGGACCGGGACGGGAGAACCCTGCTTTAGATGAAAAAACAACAGGACTCCCGATTGAGGGGCCTTTGGtttt > 1:122360/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTg > 7:14656/1‑149 (MQ=255) aaaaCCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTg > 8:50296/1‑149 (MQ=255) aaaCCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGc < 3:73996/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTc > 2:52844/1‑149 (MQ=255) cGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTGCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCt > 3:33203/1‑149 (MQ=255) gCCCGGAGCGAGCCAGAGCAGGACGTATTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGc < 8:310791/149‑1 (MQ=255) gCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGc < 6:104325/149‑1 (MQ=255) gagcCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTcgcg < 8:212117/149‑1 (MQ=255) gcCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCggg > 5:300307/1‑149 (MQ=255) ccAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGAGATTGAGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCggg > 1:217812/1‑148 (MQ=255) aGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAg > 8:214226/1‑149 (MQ=255) aGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAg > 7:272800/1‑149 (MQ=255) cAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGc < 6:253881/127‑1 (MQ=255) cAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAgcccg > 6:288141/1‑149 (MQ=255) ggACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAgcccgcc < 7:265624/149‑1 (MQ=255) ggACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAgcccgcc < 3:9592/149‑1 (MQ=255) gCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCg > 4:259803/1‑149 (MQ=255) cTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCaa < 1:52844/148‑1 (MQ=255) tttGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGa < 1:255280/149‑1 (MQ=255) cGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGt < 7:214226/148‑1 (MQ=255) tCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGcc > 3:222598/1‑149 (MQ=255) aaGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGt > 8:289820/1‑128 (MQ=255) aaGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTAAAGCGATTGCAGGTGCCtt > 2:260925/1‑149 (MQ=255) ggTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGgc < 6:300307/149‑1 (MQ=255) ttG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGgcgc > 3:89053/1‑149 (MQ=255) ctgTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTc < 6:123242/146‑1 (MQ=255) acaGGGATGAACACTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGGCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTtg > 6:182986/1‑149 (MQ=255) caggtctGAAGCGTGCGTTAGGTGGAAAAGCCTGAGGCGTTGCGATTGGTTGTCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCAGGCCTTTTCGCTGGCAGCGCGCCACATGGTATTTTAAAGCGATTTCAGGTGCATTTGCGCTCGCCTtgt < 2:316326/143‑1 (MQ=255) caGGGATGAACCCTGCGTTAGCGGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTtgt > 7:237198/1‑149 (MQ=255) aGGGATGAACACTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGACTTTGTTTTTTTGCGTCTGCATTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGACCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCATTGGCGCTCTCCTtgtg > 8:146284/1‑149 (MQ=255) ggATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGAGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTgcg > 3:307625/1‑149 (MQ=255) ggATGAAACCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCAGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTgcg > 3:332156/1‑149 (MQ=255) gAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCGTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGTTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCcag > 7:65134/1‑149 (MQ=255) cccTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCcagcag > 6:173516/1‑149 (MQ=255) cTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCg < 1:348021/131‑1 (MQ=255) cTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCg > 2:348021/1‑131 (MQ=255) cGTTAGCAGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATGGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGgt < 4:33203/147‑1 (MQ=255) gCTGGAAAAGCCAGCGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGAt < 5:302956/148‑1 (MQ=255) gCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGAt < 4:222598/148‑1 (MQ=255) cTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATg > 1:528/1‑148 (MQ=255) gAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACg > 5:319715/1‑149 (MQ=255) aaccAAAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCaa > 8:3843/3‑149 (MQ=255) gCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAac < 3:293076/149‑1 (MQ=255) gCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAac < 4:89053/149‑1 (MQ=255) ccAAAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGgt < 7:167053/132‑1 (MQ=255) ccAAAGGCCCCGCAATCGCGAGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGgt > 8:167053/1‑132 (MQ=255) aaagGCCCCGCAATCGCGAGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAacac > 3:233414/3‑148 (MQ=255) agGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACacaaa < 5:135598/149‑1 (MQ=255) agGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACacaaa < 5:288141/149‑1 (MQ=255) gCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACacaaac > 7:208083/1‑148 (MQ=255) cTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAg < 2:122360/149‑1 (MQ=255) tCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAgg > 2:52261/1‑149 (MQ=255) gcgATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCTGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGTa < 3:137277/149‑1 (MQ=255) gcgATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGTa < 8:272800/149‑1 (MQ=255) gcgATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGACCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGt > 2:224866/1‑148 (MQ=255) cgATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGTaa < 3:259803/149‑1 (MQ=255) aTTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGTAaac < 1:52261/149‑1 (MQ=255) cGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGTAAACAACg < 8:14656/149‑1 (MQ=255) gggCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTTCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGTAAACAACGTg < 1:224866/149‑1 (MQ=255) | CGTTGCCGCGGGATGCAAAACCGCAGCAGCAGGCCCGGAGCGAGCCAGACCAGGACCTTTTGCTGTTCCTGTTTGGCCTGCGTCAAGGGTTG‑CGGTC‑‑ACAGGGATGAACCCTGCGTTAGCTGGAAAAGCCAGAGGCCTCGCGATTGCGGGGCCTTTGGTTTTTTGCGTCTGCCTTGCCGGCCTCTTCGCGGGCAGCCCGCCCCAAGGTCGGTTCAAGCGATTGCAGGTGCCTTGGCGCTCGCCTTGTGCGCCAGCAGGGTGTAGATGCACGGCAACACAAACAAGGTAAACAACGTG > NC_002947/1045121‑1045417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |