| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,169,306 | G→A | 9.2% | D368D (GAC→GAT) | leuA ← | 2‑isopropylmalate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,169,306 | 0 | G | A | 9.2% | 210.3 / 9.0 | 76 | D368D (GAC→GAT) | leuA | 2‑isopropylmalate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/38); new base A (2/5); total (33/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.92e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTCAGTCTCACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTGACGAGGATGTACCGGC > NC_002947/1169159‑1169453 | gTCAGTCTCACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGt > 7:356669/1‑149 (MQ=255) tcACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCAGATGTCGGCCgg > 4:172736/1‑149 (MQ=255) tcACCCTGCACCACCAGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTACCTGCGGCCGATGTCGGCCgg > 4:178599/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCACGACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGGTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGACATCGGCCgca < 5:149481/148‑3 (MQ=255) aCCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGt < 8:218750/149‑1 (MQ=255) aCCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGt > 1:265307/1‑149 (MQ=255) aCCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGACATCGGCCgca < 5:143813/148‑3 (MQ=255) aCCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGACATCGGCCgc < 2:257755/147‑2 (MQ=255) cccTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTTCCGTAGCTGCGGCCGACATCGGCCgcag < 1:196310/149‑4 (MQ=255) ccTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTc > 8:61257/1‑148 (MQ=255) ccTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTc > 8:252319/1‑148 (MQ=255) ccTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCAGATGCCATATTACTGCTCGAGAAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGATT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCCGGTc > 5:97774/1‑148 (MQ=255) caccacCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGAt < 8:356669/147‑1 (MQ=255) caccacCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATc < 1:313880/148‑1 (MQ=255) ccaccTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGc < 7:212898/149‑1 (MQ=255) ccaccTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGc < 6:374755/149‑1 (MQ=255) accTGGATGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAg < 7:85729/149‑1 (MQ=255) ccTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAgg < 5:322811/149‑1 (MQ=255) gatGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGACCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAg < 6:97774/147‑1 (MQ=255) aTTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCAcc > 3:335491/1‑149 (MQ=255) gATCTGCATGCGAAGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTcc < 2:172073/148‑1 (MQ=255) aTCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCca > 6:311458/1‑149 (MQ=255) aTCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCca > 2:67059/1‑149 (MQ=255) cTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCca > 4:5166/1‑147 (MQ=255) gCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGt > 4:190085/1‑149 (MQ=255) gACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTcccc < 5:189785/148‑1 (MQ=255) gACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTcccc > 6:189785/1‑148 (MQ=255) gCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCctgc < 7:133224/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCctgc‑t > 8:348234/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCctgc‑t < 5:360448/149‑1 (MQ=255) gCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGTTGATACCGCCTTTGCCGGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTgc‑tgct > 6:275204/1‑149 (MQ=255) gCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTgc‑tgct < 7:252319/149‑1 (MQ=255) gATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATc < 2:201805/106‑1 (MQ=255) tGCGATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGc < 1:79815/148‑1 (MQ=255) tGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGc > 4:152889/1‑148 (MQ=255) ccATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGaa > 7:299729/1‑149 (MQ=255) ccATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGaa < 8:299729/149‑1 (MQ=255) atatTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGc > 6:89880/1‑149 (MQ=255) cTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTg < 7:61257/148‑1 (MQ=255) cTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGc > 4:312003/1‑149 (MQ=255) tCGAGCAGGTAGGTGATACAGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGAt > 7:24324/1‑149 (MQ=255) gAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATg < 1:19230/148‑1 (MQ=255) gAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATg < 1:48797/148‑1 (MQ=255) gAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATg < 3:62477/148‑1 (MQ=255) gAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTG‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATg < 6:209208/148‑1 (MQ=255) aGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGc < 7:348234/149‑1 (MQ=255) ggtaggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGAGGCCGAAGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGGAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAACCCCTTGCGGATGGCGTcc > 7:272179/1‑149 (MQ=255) gtaggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCt > 3:167779/1‑149 (MQ=255) taggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTg < 3:172736/149‑1 (MQ=255) taggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTg < 3:178599/149‑1 (MQ=255) ggtGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGt < 4:180229/149‑1 (MQ=255) gATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGc > 7:207709/1‑148 (MQ=255) aTACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTCACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCAGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGA‑TGCTTGGCGAAGCACTTGCGGATGGCGTCCTCTTGCGa > 4:340833/1‑149 (MQ=255) cGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCg > 1:269902/1‑149 (MQ=255) ccTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGga < 5:177748/149‑1 (MQ=255) tGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGgaga < 3:152889/147‑1 (MQ=255) tGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGaa < 3:312003/148‑1 (MQ=255) ctgACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAAcgcg > 1:218751/3‑149 (MQ=255) ccGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAAcgcg < 6:261138/149‑1 (MQ=255) ctaCTGGCTGTTGACGCGGATTACCGGTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCGATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCTTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCgg < 8:272179/147‑1 (MQ=255) tGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATg > 8:47716/1‑149 (MQ=255) gCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGa < 8:207709/149‑1 (MQ=255) gTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGAc > 3:223455/1‑147 (MQ=255) cgcgGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTAGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATcc > 6:299149/1‑149 (MQ=255) ccGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAg < 7:36466/149‑1 (MQ=255) gCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAggg < 3:190085/149‑1 (MQ=255) cGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTg < 3:5166/148‑1 (MQ=255) acccGGCCGACATCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTAt > 2:277929/4‑118 (MQ=255) acccGGCCGACATCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTAt < 1:277929/115‑1 (MQ=255) ccGGCCGACATCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTGACGAGGAt > 7:97848/2‑149 (MQ=255) cGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGa > 4:206720/1‑98 (MQ=255) cGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGa < 3:206720/98‑1 (MQ=255) cGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTGACGAGGa < 8:24324/147‑1 (MQ=255) cGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTGACGAGGa < 2:269902/147‑1 (MQ=255) ggCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAggg > 1:54245/1‑136 (MQ=255) ggCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAggg < 2:54245/136‑1 (MQ=255) gTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGCGTGATTGGCGAAGCCATTGGGGATGGCGGCCTGTTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACAAAAACCCCAACAAAGGGGTGACACGGATGTACCgg > 1:99172/1‑148 (MQ=255) gTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTGACGAGGATGTACCGGc > 4:18449/1‑148 (MQ=255) | GTCAGTCTCACCCTGCACCACCTGGCTGAATTCGATCTGCATGCGACGCGGCAGGCTGATGCCATATTCCTGCTCGAGCAGGTAGGTGATACCGCCTTTGCCCGACTGGCTGTTGACGCGGATTACCGCTT‑CGTAGCTGCGGCCGATGTCGGCCGGGTCGATCGGCAGGTAAGGCACCTCCCACAGTTCCCCATCCTGC‑TGCTTGGCGAAGCCCTTGCGGATGGCGTCCTGGTGCGAGCCGGAGAACGCGGTATGGACCAGATCCCCCACATAGGGGTGACGAGGATGTACCGGC > NC_002947/1169159‑1169453 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |