| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,354,800 | A→T | 6.1% | Y193N (TAC→AAC) | nrdA ← | ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,354,800 | 0 | A | T | 6.1% | 234.2 / 2.9 | 76 | Y193N (TAC→AAC) | nrdA | ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/31); new base T (2/3); total (42/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TACATTCAGGAAGCCCAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGCGGATGCTCGGGTGCGGC > NC_002947/1354654‑1354948 | tACATTCAGGAAGCCCAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACa < 4:145227/149‑1 (MQ=255) aTTCAGGAAGCCCAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGt > 6:90635/1‑149 (MQ=255) tCAGGAAGCACAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGCCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCACGCTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGATGACGTCCATGATGGCCACGCCGTAGTACAGGttc > 6:113966/1‑149 (MQ=255) cAGGAAGCCCAGGCCTTCGGCGCGCTGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGttc < 5:113966/148‑1 (MQ=255) cAGGAAGCCCAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGttc < 7:188510/148‑1 (MQ=255) aGGAAGCCCAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGttct > 5:40115/1‑148 (MQ=255) ggAAGCCCAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGttctt > 2:351783/1‑148 (MQ=255) ggAAGCCCAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGATGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGttctt > 4:281535/1‑148 (MQ=255) gAAGCCTAGTCCTTCTGAGTTCAGGGTGTCCATCAGCACGCTGCCGGTAACGATCGAGTAGTTCTGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCa < 6:258771/149‑1 (MQ=255) aaGCCCAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCTGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAg < 7:337820/149‑1 (MQ=255) aGCCCAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAgg < 6:66058/149‑1 (MQ=255) aGCCCAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTCATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAgg < 1:35575/149‑1 (MQ=255) cAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGttt > 1:146665/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGttt > 7:302196/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGttt < 3:281535/149‑1 (MQ=255) cAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGttt > 2:269355/1‑149 (MQ=255) gCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTcgc < 1:363176/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCgcgc > 3:361568/1‑149 (MQ=255) attCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTACTACGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGAGTTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTACAGGGTTTcgcga > 5:45744/2‑148 (MQ=255) cGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCt < 6:257300/147‑1 (MQ=255) cGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCt < 2:380348/147‑1 (MQ=255) ggCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGa > 7:12576/1‑149 (MQ=255) gcgcgcAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCAGGAt > 7:19088/1‑149 (MQ=255) cgcAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAg > 6:131316/1‑149 (MQ=255) gtCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCAt > 5:41627/1‑149 (MQ=255) gtCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCAt > 2:54182/1‑149 (MQ=255) ccATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCa < 4:113950/146‑1 (MQ=255) ccATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCa > 3:113950/1‑146 (MQ=255) cATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCt > 2:200852/1‑131 (MQ=255) cATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCt < 1:200852/131‑1 (MQ=255) cATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGACACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCg < 6:40115/148‑1 (MQ=255) agGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGc < 2:146665/149‑1 (MQ=255) cgggcggTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAg < 4:199214/149‑1 (MQ=255) cggTAACGAACGACTAGTTCGGCTCTCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGCGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGATCTTAAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTAGCCATAGACTTAGGCCAGGCCt > 8:132269/1‑149 (MQ=255) tAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCgg > 7:34180/1‑138 (MQ=255) tAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCgg < 8:34180/138‑1 (MQ=255) cgaacgaGTAGTTCGGCTCGCGCTCCCCCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAg > 7:342867/1‑149 (MQ=255) cgaacgaGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAg < 2:265370/149‑1 (MQ=255) gaacgaGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAgg > 4:363958/1‑149 (MQ=255) 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gcTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATAGTGTTc < 1:269355/149‑1 (MQ=255) tCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAg > 3:88554/1‑149 (MQ=255) ccaGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGatgatg > 6:57855/1‑137 (MQ=255) ccaGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGatgatg < 5:57855/137‑1 (MQ=255) ccaGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCgg < 4:88554/149‑1 (MQ=255) 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aCCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAg > 2:24968/1‑149 (MQ=255) tgtTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCg < 6:41627/149‑1 (MQ=255) gtTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTGCGCTGATGATGGTGTTCATGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTct < 8:342867/148‑2 (MQ=255) gACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGc > 1:101290/1‑147 (MQ=255) gACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGc > 5:154304/1‑147 (MQ=255) gTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCg > 1:19099/1‑142 (MQ=255) gTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCg < 2:19099/142‑1 (MQ=255) gTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAggg > 1:21492/1‑149 (MQ=255) ttGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTCATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATTTCGAGCGGAGCCAGGCTGCCGTAGGCCACGGTGAt > 8:142713/1‑149 (MQ=255) gATGGCTACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATTAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGc > 1:268076/1‑149 (MQ=255) gATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGAt < 4:252748/147‑1 (MQ=255) aTGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGc < 2:181228/148‑1 (MQ=255) aTGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGCg > 3:253850/1‑149 (MQ=255) tGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGCgg < 8:302196/149‑1 (MQ=255) tGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGCg > 2:27383/1‑148 (MQ=255) cGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCTACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGCGGATGCTc < 2:101290/149‑1 (MQ=255) cgtcgtACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGCGGATGCTCggg > 4:123524/1‑149 (MQ=255) gtcgtTCAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCCCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGCGGATGCTCGGGt < 3:284690/149‑1 (MQ=255) gtcgtTCAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCCCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGCGGATGCTCGGGt < 3:309631/149‑1 (MQ=255) tcgtACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGCGGATGCTCGGGTg > 5:170925/1‑149 (MQ=255) gtACTGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCGGTATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGGCAGGGTGATTCGGATGCTCGGGTGCg < 4:361568/149‑1 (MQ=255) tACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGC‑GGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGCGGATGCTCGGGTGCGGc > 5:102690/1‑149 (MQ=255) | TACATTCAGGAAGCCCAGGCCTTCGGCGCGCAGGGTGTCCATCAGCAGGCGGGCGGTAACGAACGAGTAGTTCGGCTCGCGCTCCACCAGGGTACGGGCGGTCATCACCAGGGCGGTGTTGACGTCCTTGATGGCCACGCCGTCGTACAGGTTCTTCAGGGTTTCGCGCTGGATCAGGTCGCCATCGACTTCGGCCAGGCCTTCGCAGGCTTCGCTGATGATGGTGTTCAGGCGGGCCATGTCGAGCGGCGCCAGGCTGCCGTCGGCCAGGGTGATGCGGATGCTCGGGTGCGGC > NC_002947/1354654‑1354948 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |