Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 74,173 | A→T | 5.1% | M217L (ATG→TTG) | PP_0063 → | lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 74,173 | 0 | A | T | 5.1% | 243.5 / 2.6 | 79 | M217L (ATG→TTG) | PP_0063 | lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/38); new base T (2/2); total (39/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.17e-01 |
GACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGCGATGAGCAAG > NC_002947/74025‑74316 | gACCAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACa > 6:345259/1‑149 (MQ=255) cAAGGAAGGCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGc > 2:206366/1‑149 (MQ=255) aggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACctgc‑tg > 6:43225/1‑149 (MQ=255) aggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑Tg < 1:264264/149‑1 (MQ=255) ggaaggCATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑Tgg > 6:343827/1‑149 (MQ=255) gCATCCTCAGCGTGATCAAGTAAGTGCGGCGTGGTGGCGAGGTGGGTATGCCTGCCGACCCGTAGCCGGCTTAATCGGCGGTCGTGTTCGTACAGTTCCTCTGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCTTGCCGAACATGC‑TGGc < 7:310527/145‑1 (MQ=255) cATCCTCAGCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTg > 2:113173/1‑149 (MQ=255) gCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCg < 2:40711/149‑1 (MQ=255) gCGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCg > 1:5718/1‑149 (MQ=255) cGTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCgg > 2:360232/1‑149 (MQ=255) gTGATCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGt < 8:277067/149‑1 (MQ=255) aTCAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAg < 1:43796/148‑1 (MQ=255) cAAGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgt < 8:345174/148‑1 (MQ=255) aGGAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgtgtg > 2:278921/1‑149 (MQ=255) aGGAAGTGCGCCGGGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgtgtg > 3:53667/1‑149 (MQ=255) ggAAGTGCGCCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGgggtgt > 4:255669/1‑149 (MQ=255) cgcCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAGCACGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGc < 1:113173/149‑1 (MQ=255) cgcCGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGAGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGc < 3:243961/148‑1 (MQ=255) ccGTGGTGGCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATg > 1:139241/1‑149 (MQ=255) tggtggCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATgcgc < 6:267961/149‑1 (MQ=255) gtggCCAGGTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTg > 1:100704/1‑149 (MQ=255) gTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGcc < 5:271173/149‑1 (MQ=255) gTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGcc > 8:250219/1‑149 (MQ=255) gTGGGTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGcc < 4:318722/149‑1 (MQ=255) gtggTATTACTGCCGACCCGGAGCCGGCCGAAACGGCGGGCGTGTTAGGAACGTTGCTCCGACCCCCG‑GCCCAGACCAGCAACATCCTGCCGCACAAGCATGGCC‑GTTGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCAGCATGCCCTGCAGTTGGCg > 8:125464/3‑149 (MQ=255) gggTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCgg < 4:53667/149‑1 (MQ=255) ggTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGa > 6:314813/1‑149 (MQ=255) gTATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGAt > 7:182454/1‑149 (MQ=255) tATTCCTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATg < 4:172407/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTc > 1:90989/1‑149 (MQ=255) tGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGGCCAGCATGTTCGGCACGAACTTGC‑Tggtcag > 3:251372/1‑92 (MQ=25) tGCCGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGGCCAGCATGTTCGGCACGAACTTGC‑Tggtcag < 4:251372/96‑5 (MQ=25) ccGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCggg < 6:332076/148‑1 (MQ=255) ccGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCggg < 1:360232/148‑1 (MQ=255) ccGACCCGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCggg < 1:243862/148‑1 (MQ=255) ccGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTc > 4:266512/1‑147 (MQ=255) ccGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTc > 4:122263/1‑147 (MQ=255) ccGGAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCaa < 3:122263/149‑1 (MQ=255) ggAGCCGGCGGAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAgg < 2:209539/149‑1 (MQ=255) ggcggAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCg < 4:1415/133‑1 (MQ=255) ggcggAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCg > 3:1415/1‑133 (MQ=255) ggAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTc > 3:357681/1‑148 (MQ=255) gAATCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGCCCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCg > 4:40168/1‑148 (MQ=255) aaTCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGaa < 1:156545/149‑1 (MQ=255) tCGGCGGGCGTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGc > 1:162226/1‑149 (MQ=255) gggcgTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTgcgc > 3:119275/1‑149 (MQ=255) ggcgTGTTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGcc < 5:314813/149‑1 (MQ=255) tgtTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGaa < 3:41993/149‑1 (MQ=255) gtTCGTACCGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCgg > 8:354365/1‑146 (MQ=255) 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cGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTa > 3:44153/1‑148 (MQ=255) cGTTCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTAc < 2:5718/149‑1 (MQ=255) ttCCTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAg > 4:370641/1‑149 (MQ=255) cTCGGCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCa < 2:258027/148‑1 (MQ=255) ggCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCg < 3:266512/148‑1 (MQ=255) ggCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGa < 7:250219/149‑1 (MQ=255) gCACCCAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGAt < 3:255669/149‑1 (MQ=255) cAG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGaa > 5:210404/1‑149 (MQ=255) aG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTc > 8:311157/1‑107 (MQ=255) aG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTc < 7:311157/107‑1 (MQ=255) aG‑GCGCTGACCAGCAAGTTCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAagag > 8:41829/1‑128 (MQ=255) 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ttCGTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGCGAt > 4:323313/1‑149 (MQ=255) gTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGCGATGa < 1:121554/148‑1 (MQ=255) gTGCCGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGCGATGAg < 2:100704/149‑1 (MQ=255) ccGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCTGCGGTTGCCGGATGGCTCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGCGATGAGc > 3:122670/1‑147 (MQ=255) cGAACATGC‑TGGCCGGTGGCAAGGCGGTAGGTGTGTTCCTGCATGCGCGGCGGTTGCCGGATGGCGCGGGCTTCAAGGTGTTCCTCGAAGCTGCGCCGGAAGAGATGTACAGCACCGATGTGAATGTGTCGGCGGCGGCGATGAGCAAg < 7:58465/149‑1 (MQ=255) | 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |