Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,588,522 | G→T | 5.2% | R193R (CGG→AGG) | PP_1393 ← | transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,588,522 | 0 | G | T | 5.2% | 244.3 / 3.2 | 77 | R193R (CGG→AGG) | PP_1393 | transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/35); new base T (2/2); total (40/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.58e-01 |
GCGACCAATCGCCGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAG > NC_002947/1588378‑1588670 | gCGACCAATCGCCGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAg < 8:38029/149‑1 (MQ=255) cGACCAATCGCCGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAgg < 5:19035/149‑1 (MQ=255) gACCAATCGCCGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAggg < 5:336366/149‑1 (MQ=255) aCCAATCGCCGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGa < 4:85591/149‑1 (MQ=255) aaTCGCCGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATgc < 4:69868/149‑1 (MQ=255) accGCCGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATg > 4:37696/3‑147 (MQ=255) tCGCCGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATgcag > 5:214051/1‑149 (MQ=255) gCCGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCTCGCGGGATgaaca < 1:366735/148‑5 (MQ=255) gCCGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCTCGCGGGATgaaca < 4:147992/148‑5 (MQ=255) ccGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCCCAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATgcagcag > 8:291489/1‑149 (MQ=255) cGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATgcagca > 6:22421/1‑147 (MQ=255) cGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATgcagca < 5:22421/147‑1 (MQ=255) ccACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGc < 1:115810/149‑1 (MQ=255) ccACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGc > 5:336851/1‑149 (MQ=255) cACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGcc > 5:56487/1‑149 (MQ=255) gTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAg < 5:219715/149‑1 (MQ=255) tCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAg < 6:336851/148‑1 (MQ=255) cccTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTc > 8:267464/1‑149 (MQ=255) cTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGATATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGACTGCACCCACCACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCCGCAGCCTGTGCCTGGCCAGGTCtt > 7:242161/1‑149 (MQ=255) cTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCATGTCtt < 6:214051/149‑1 (MQ=255) cTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCtt > 1:160256/1‑149 (MQ=255) gacatggcgatGGCCATGGCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACctg > 4:228128/3‑149 (MQ=255) ccatggccatCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACctgc > 2:10558/1‑149 (MQ=255) ccatCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAAc < 1:10558/149‑1 (MQ=255) ccATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCAcc > 7:310683/1‑149 (MQ=255) ccATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCAcc > 5:69141/1‑149 (MQ=255) aTGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACACCCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCgg < 6:63857/149‑1 (MQ=255) cAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCtt > 3:161541/1‑149 (MQ=255) gtgtCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAACGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCa > 4:349186/1‑149 (MQ=255) tgtCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCtt > 4:155901/1‑146 (MQ=255) tgtCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCtt < 3:155901/146‑1 (MQ=255) tctcGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACg > 3:8789/1‑148 (MQ=255) tcGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAg > 2:333143/1‑149 (MQ=255) gAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACCACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGt > 6:101830/1‑148 (MQ=255) aaaTGCGGGTAGGGTCCCTGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCACTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGa < 8:242161/149‑1 (MQ=255) aaTGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGAc < 4:161541/149‑1 (MQ=255) aTGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACg < 1:215283/149‑1 (MQ=255) aTGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACg < 3:154623/149‑1 (MQ=255) gCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGa > 8:289788/1‑80 (MQ=255) gCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGa < 7:289788/80‑1 (MQ=255) cTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGt < 6:69141/148‑1 (MQ=255) tttGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTgcgc < 2:180078/149‑1 (MQ=255) gggTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCaa > 2:337901/1‑114 (MQ=255) gTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGcaca > 5:25360/1‑147 (MQ=255) ccATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTT‑CACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAggg < 8:101540/149‑1 (MQ=255) cATGCGTGGCCAACGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAggg < 3:349186/149‑1 (MQ=255) gTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAg < 3:228128/149‑1 (MQ=255) gTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAg > 8:243873/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAgctg > 5:237227/1‑149 (MQ=255) cAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAgctgct > 1:79847/1‑149 (MQ=255) gTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATc < 2:160256/149‑1 (MQ=255) gTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCAACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATc < 7:267464/149‑1 (MQ=255) tCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATc > 7:89999/1‑148 (MQ=255) ttCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGt > 5:76029/1‑133 (MQ=255) ttCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGt < 6:76029/133‑1 (MQ=255) ttCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAAc < 7:243873/149‑1 (MQ=255) ttCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAAc < 4:15633/149‑1 (MQ=255) cAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGc < 7:291489/149‑1 (MQ=255) ccgccTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTg > 6:264724/1‑149 (MQ=255) cAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCt < 1:333143/149‑1 (MQ=255) aaCCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTg > 4:325386/1‑149 (MQ=255) aCCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTg > 8:239266/1‑148 (MQ=255) ccACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTg > 3:130203/1‑147 (MQ=255) cacaACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAgctgct > 5:123180/1‑124 (MQ=255) cacaACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAgctgct < 6:123180/124‑1 (MQ=255) aaCCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGATCATCGAACAGCTTGAGAACCTGCAGccc > 4:220181/1‑149 (MQ=255) aaCCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCAAACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGccc > 6:257121/1‑149 (MQ=255) ccAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGt > 5:30172/1‑149 (MQ=255) gTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCg < 3:37696/149‑1 (MQ=255) ctgcATCCCTCGCGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCa > 2:166743/4‑149 (MQ=255) ctgcATCCCTCGCGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCa > 6:379397/4‑149 (MQ=255) aTCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCgg < 5:117146/141‑1 (MQ=255) aTCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCg < 6:30172/148‑1 (MQ=255) 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gcgAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAg < 5:264724/149‑1 (MQ=255) gcgAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTCGTTCGGTGCATCGCCg > 2:210789/1‑146 (MQ=255) | GCGACCAATCGCCGATCGCCACCCCAGTCCCCTGCGAGGCCATGGCCATCGCCATGTCCAGTGTCTCGAAATGCTGTTTGGGTCCATGCGTGGCCAGCGTCATTCCAGCCGCCTGCAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAG > NC_002947/1588378‑1588670 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |