| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,628,995 | C→A | 8.7% | L169I (CTC→ATC) | mucB → | sigma factor AlgU regulator MucB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,628,995 | 0 | C | A | 8.7% | 211.8 / 7.4 | 69 | L169I (CTC→ATC) | mucB | sigma factor AlgU regulator MucB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/32); new base A (4/2); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
GGGTTGGTACGATTTGAGTGTGGCAGGCAAGTCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCGGCAGCAATGATGCC > NC_002947/1628847‑1629132 | gggTTGGTACGATTTGAGTGTGGCAGGCAAGTCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGAACAGCATAGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGc > 5:337022/1‑149 (MQ=255) tACGATTTGAGTGTGGCAGGCAAGTCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGa > 6:366635/1‑149 (MQ=255) aTTTGAGTGTGGCAGGCAAGTCACGGGTCGCCGGGTGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAg > 4:63329/1‑149 (MQ=255) ttGAGTGTGGCAGGCAAGTCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCATTGATGCTCAACGACAAggg > 1:230265/1‑149 (MQ=255) tGAGTGTGGCAGGCAAGTCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGAGCATCAACGaacgcag < 6:336533/148‑7 (MQ=255) gAGTGTGGCAGGCAAGTCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAgggg < 2:12370/148‑1 (MQ=255) aGTGTGGCAGGCAAGTCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGGTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCa < 7:131971/149‑1 (MQ=255) gcaggcaAGTCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGc < 6:282017/148‑1 (MQ=255) caggcaAGTCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTg < 4:125175/149‑1 (MQ=255) caggcaAGTCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTg < 5:207775/149‑1 (MQ=255) agggaAGTCACTGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTgg < 8:155596/149‑1 (MQ=255) ggcaAGTCACGGGTCTCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGa < 5:50529/149‑1 (MQ=255) gcaAGGCACGGGTCGCCGGTCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGaa < 3:214585/149‑1 (MQ=255) tCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCtt < 5:137038/149‑1 (MQ=255) aCGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATTATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTc > 5:262081/1‑148 (MQ=255) ggTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGa < 2:298629/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGAt > 6:331172/1‑149 (MQ=255) gCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGa < 5:366635/148‑1 (MQ=255) gCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGAc < 5:322877/149‑1 (MQ=255) cgcgATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGtct < 1:98074/149‑1 (MQ=255) ccGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATAc < 3:63329/148‑1 (MQ=255) cGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATAcc > 4:306102/1‑148 (MQ=255) gTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGa > 6:334853/1‑149 (MQ=255) tCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGa < 7:158886/148‑1 (MQ=255) ttACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATa > 2:352752/1‑149 (MQ=255) gCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATAcc > 5:2537/1‑147 (MQ=255) gCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCa < 5:331172/149‑1 (MQ=255) acgccacgcGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGa > 6:110206/1‑149 (MQ=255) cgccacgcGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCATTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGAc < 2:230265/149‑1 (MQ=255) gccacgcGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACg > 5:97034/1‑149 (MQ=255) cacgcGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACg > 7:180/1‑147 (MQ=255) gACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACtt < 8:180/149‑1 (MQ=255) gACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACtc > 4:338111/1‑148 (MQ=255) tCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAg < 1:352752/149‑1 (MQ=255) tctGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAg < 1:320652/143‑1 (MQ=255) tGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGtgct < 3:306102/148‑1 (MQ=255) cGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGtgctgc < 2:338086/148‑1 (MQ=255) cGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGtgctgc < 3:67251/148‑1 (MQ=255) cGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTGCAGATGACCCGTCTCGATACCGATCAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGctgcctgc > 3:214644/1‑148 (MQ=255) gAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCaa < 6:337022/149‑1 (MQ=255) cACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGt > 5:364129/1‑149 (MQ=255) cTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTg > 5:353005/1‑147 (MQ=255) gACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTgcagca > 2:313054/1‑149 (MQ=255) gACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTgcagca > 4:231640/1‑149 (MQ=255) gACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTCGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTgcagc < 3:338111/148‑1 (MQ=255) aCCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCAt > 3:185458/1‑149 (MQ=255) ccGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGCCCCGTCTCGATACCGATGAAATACCAAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCaacc > 6:10364/1‑135 (MQ=255) ccGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCAtg < 1:313054/149‑1 (MQ=255) ccGTCACTCGGGTGAGCCGCTGCGTGCGTTCATCCTCACCGACAAGGGGCAGTTGCGGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCCACGCAGACTTGCGCCCAGGAGCTGCCTGCAAGc < 5:10364/137‑1 (MQ=255) gTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCAtgtg > 1:48054/1‑149 (MQ=255) cTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAg > 8:51247/1‑149 (MQ=255) tCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGc > 5:326144/1‑149 (MQ=255) tCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGc > 6:347859/1‑149 (MQ=255) gggTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCg > 5:19984/1‑149 (MQ=255) gggTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCg > 2:188842/1‑149 (MQ=255) gggTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCg > 5:14714/1‑149 (MQ=255) gggTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCg > 2:370544/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCGGCAGCaa < 6:2537/149‑1 (MQ=255) gCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCACGATACCGATGAAATAACCAGCGACGCAGCCTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCGAGTGCAGCATGTGGCAGCCGGCAGCAat > 7:249076/1‑148 (MQ=255) ccttgtcgttGAGCATCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCGGCAGCAatgat > 3:332718/6‑149 (MQ=255) cttgtcgttGAGCATCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCGGCAGCAatgatg > 1:157212/5‑149 (MQ=255) ttgtcgttGAGCATCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTgg < 4:225610/127‑1 (MQ=255) ttgtcgttGAGCATCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTgg > 3:225610/4‑130 (MQ=255) ttgtcgttGAGCATCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCGGCAGCAATGATGc > 5:155424/4‑149 (MQ=255) cgttcgttGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGTAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCGGCAGCAatgat < 6:262081/147‑1 (MQ=255) gttcgttGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCGGCAGCAATGATGcc < 6:353005/149‑1 (MQ=255) gttGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTgca < 7:321650/117‑1 (MQ=255) gttGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTgca > 8:321650/1‑117 (MQ=255) gATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCGgcag < 3:272606/132‑1 (MQ=255) gATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCGgcag > 4:272606/1‑132 (MQ=255) | GGGTTGGTACGATTTGAGTGTGGCAGGCAAGTCACGGGTCGCCGGGCGCGATGCCGTGATCATTACGCTCACGCCACGCGACCAGCATCGCTATGCGTTCGAATTGCACCTGGACCGTCACTCGGGTTTGCCGCTGCGTTCGTTGATGCTCAACGACAAGGGGCAGTTGCTGGAACGCTTCCAGATGACCCGTCTCGATACCGATGAAATACCCAGCGACGCAGACTTGCGCCCAGGTGCTGCCTGCAAGCCAGTGCAGCATGTGGCAGCCGGCAGCAATGATGCC > NC_002947/1628847‑1629132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |