| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,671,162 | A→C | 5.4% | V576G (GTA→GGA) | PP_1467 ← | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,671,162 | 0 | A | C | 5.4% | 233.6 / 4.0 | 74 | V576G (GTA→GGA) | PP_1467 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/32); new base C (2/2); total (40/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.82e-01 | |||||||||||
GTGTTCAGCTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGTTGCAGAT > NC_002947/1671017‑1671309 | gtgtTCAGCTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACAt < 5:79027/149‑1 (MQ=255) ttCAGCTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGa > 3:329880/1‑149 (MQ=255) cAGCTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGAc < 4:115145/148‑1 (MQ=255) gCTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGAcc > 8:306532/1‑147 (MQ=255) cTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAg > 8:13719/1‑149 (MQ=255) cTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAg > 5:81372/1‑149 (MQ=255) aTCGGCGCGGACACGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCCGGCGCCTGAGGAGCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGCGCACGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCACCGG‑GGTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCCGCCCTGGCCAt > 8:287538/1‑149 (MQ=255) aTCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCAGGCCAt > 7:304370/1‑149 (MQ=255) acgaGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATcgcg > 6:139616/1‑149 (MQ=255) aaGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGaa > 4:187283/1‑147 (MQ=255) aaGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACa < 5:13768/149‑1 (MQ=255) gcgcCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCCGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAg > 8:68855/1‑148 (MQ=255) ggTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAgtgt < 7:43726/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAgtgt < 6:328846/149‑1 (MQ=255) cccGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGccc > 7:139748/1‑149 (MQ=255) tgcCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGGTCCAt < 6:202150/100‑1 (MQ=255) tgcCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGGTCCAt > 5:202150/1‑100 (MQ=255) ccAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCAt > 3:326989/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCAt > 3:367177/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATg > 2:253248/1‑149 (MQ=255) gcCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTg > 6:363771/1‑149 (MQ=255) ccTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGc < 5:139616/149‑1 (MQ=255) tGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCAGGGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGcc > 1:263295/1‑149 (MQ=255) gAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTg > 1:27202/1‑149 (MQ=255) aGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTgg > 7:255711/1‑149 (MQ=255) aGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTgg < 1:147203/149‑1 (MQ=255) aGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTg < 3:187283/148‑1 (MQ=255) tCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAgg > 6:24955/1‑149 (MQ=255) cGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAg < 1:379831/111‑1 (MQ=255) cGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAg > 2:379831/1‑111 (MQ=255) cGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGc < 3:202255/120‑1 (MQ=255) cGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGc > 4:202255/1‑120 (MQ=255) tCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGGAATTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATcc > 1:293765/1‑148 (MQ=255) tCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGGTCCATGTAGCCAGCCCt > 3:97775/1‑88 (MQ=38) tCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGGTCCATGTAGCCAGCCCt < 4:97775/88‑1 (MQ=38) gTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCa < 3:136832/149‑1 (MQ=255) cAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCaaa < 5:363771/148‑1 (MQ=255) gCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAACGCCt > 4:355262/1‑149 (MQ=255) aTCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGc > 4:112446/1‑86 (MQ=255) aTCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGc < 3:112446/86‑1 (MQ=255) aTCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGt < 3:295937/149‑1 (MQ=255) tCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCAAGCCAAAGCCTTCGGTc > 3:358620/1‑149 (MQ=255) aGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGTGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAgg > 6:366485/1‑149 (MQ=255) ggCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGt < 8:40068/149‑1 (MQ=255) cca‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTg < 6:81372/149‑1 (MQ=255) ca‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCTAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGCTTGGTGc > 3:207271/1‑149 (MQ=255) cAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGTGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAg < 5:366485/149‑1 (MQ=255) cccGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTc > 1:45106/1‑149 (MQ=255) ggctgcggctgcAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGAGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTc < 7:61539/122‑1 (MQ=255) ggctgcggctgcAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGAGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTc > 8:61539/1‑122 (MQ=255) cggctgcAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCt < 2:263295/148‑1 (MQ=255) ctgcAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGgcg > 3:128723/1‑142 (MQ=255) ctgcAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGgcg > 3:123235/1‑142 (MQ=255) ctgcAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGgcg < 4:128723/142‑1 (MQ=255) ctgcAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGgcg < 4:123235/142‑1 (MQ=255) tgcAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATg > 3:295876/1‑149 (MQ=255) tgcAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATg < 8:139748/149‑1 (MQ=255) cAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATg < 4:367177/147‑1 (MQ=255) cAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATg < 4:326989/147‑1 (MQ=255) aCGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGa < 2:293765/149‑1 (MQ=255) gg‑gTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACg > 1:251110/1‑149 (MQ=255) gTTATCAGGGCTGGCTACATGGACACAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGt > 8:310272/1‑149 (MQ=255) ttATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGCGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGtt > 2:12631/1‑149 (MQ=255) aTCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTg < 7:306532/148‑1 (MQ=255) tCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGc > 4:210382/1‑149 (MQ=255) tCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGc > 2:352426/1‑149 (MQ=255) gggCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAg > 4:9455/1‑149 (MQ=255) ggctggctACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGt < 2:27202/149‑1 (MQ=255) gctggctACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGtt < 7:310272/149‑1 (MQ=255) gctggctACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGtt < 3:9455/149‑1 (MQ=255) tggctACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGTTGc < 8:304370/149‑1 (MQ=255) gctACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCGAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGTTGCa < 1:348696/148‑1 (MQ=255) gctACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGTTg > 6:224162/1‑146 (MQ=255) tACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGTTGCAGAt < 1:253248/149‑1 (MQ=255) | GTGTTCAGCTTCGTCGCCATCGACGAGGACAAGCGCCCGGTGCCCGTGCTGCCAGGCGCCTGAGTATCACGGCTCCGGTGCAGGCTCGATCAAGGCCACCA‑GGGTCCAGCCCGGCTGCGGCTGCAACGG‑GTTATCAGGGCTGGCTACATGGACCCAGCCCTGGCCATCGCGGGCGAACAGCAAGTGTGCCCGCTCGCCATGCAGTGCCTGGTAGGCATCCCAGCCAAAGCCTTCGGTCAGGTTGGTGCTATACAGCTCGGCGCCTTGATGCAGACGGTTGGCCAGTTGCAGAT > NC_002947/1671017‑1671309 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |