Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,681,669 | C→G | 7.2% | A63G (GCC→GGC) | recJ → | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,681,669 | 0 | C | G | 7.2% | 245.5 / 4.9 | 80 | A63G (GCC→GGC) | recJ | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/32); new base G (3/3); total (45/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGGC > NC_002947/1681525‑1681817 | tGGGTAACCTGCCACCATTGCTGACCCGCCTTTACGGCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATc < 7:352098/149‑1 (MQ=255) ggTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGa > 2:220557/1‑149 (MQ=255) aCCTGCCAGCCTTGCTGACCCGCCTTTAGGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAcca < 2:104646/148‑1 (MQ=255) ccTGCCAACCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAATGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagc < 3:218731/149‑1 (MQ=255) cTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAcca > 8:182477/1‑146 (MQ=255) cTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAcca < 7:182477/146‑1 (MQ=255) tGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGCccagcgc > 6:13967/1‑149 (MQ=255) ccACGCTTGCTGACCCGCCTTTAGGCCGCGCGCGGCGTGCAGTGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCCGCTGGTCGATGGCTTCGAccagcag < 4:112454/147‑3 (MQ=255) ccACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgc > 7:341800/1‑147 (MQ=255) ccACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGAccagcgc < 8:341800/147‑1 (MQ=255) ttGCTGACGCGCCTTTACGGCGCGCGCGGCGTGCAGATCGAGGCCGAGCTTGACAATAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCATGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCATCGCAt < 6:289043/149‑1 (MQ=255) gCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATc < 2:337735/148‑1 (MQ=255) cTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCt > 1:342679/1‑149 (MQ=255) gCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgtc > 3:261478/1‑149 (MQ=255) ccTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtcgtcg > 8:2184/1‑149 (MQ=255) cTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCgg < 1:38381/149‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACt < 4:130190/149‑1 (MQ=255) cgccgcGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGACGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCAAc > 5:148118/1‑148 (MQ=255) cgcgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTc > 3:17325/1‑148 (MQ=255) cgcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGAt < 1:220557/149‑1 (MQ=255) gcgcgGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATg < 2:373769/149‑1 (MQ=255) gcggcgTGCAGATCGAGGACGACCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCCAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTTCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGcc < 2:114655/149‑1 (MQ=255) tGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGt < 7:2184/149‑1 (MQ=255) gCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCgg < 2:376685/129‑1 (MQ=255) gCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCgg > 1:376685/1‑129 (MQ=255) gCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGAGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTg > 3:248246/1‑149 (MQ=255) agagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTg > 1:147866/1‑147 (MQ=255) agagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTg < 2:147866/147‑1 (MQ=255) agagCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGc > 6:70160/1‑148 (MQ=255) gCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAg > 5:67266/1‑149 (MQ=255) aGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCAcc < 8:226411/149‑1 (MQ=255) gCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGAGTTCGATGCCGACGGTGCCCCCGCCCGCCCCg > 6:252519/1‑149 (MQ=255) tGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTc > 7:116762/1‑149 (MQ=255) gACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGCTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCgc > 3:337496/1‑148 (MQ=255) aCAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg > 1:314730/1‑149 (MQ=255) aCAAGAGCCGGGCAGGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCggg < 5:252519/149‑1 (MQ=255) aaGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGt > 5:234919/1‑149 (MQ=255) agCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCt > 7:348146/1‑149 (MQ=255) ccTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTgg < 2:342679/149‑1 (MQ=255) aCGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgc > 5:304829/1‑149 (MQ=255) aCGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgc > 7:63507/1‑149 (MQ=255) cGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcg < 4:17325/149‑1 (MQ=255) cGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcg > 6:380628/1‑149 (MQ=255) ctgctgCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGACACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGgcctgcgcct > 4:166366/1‑149 (MQ=255) cccTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTggg > 4:262103/1‑149 (MQ=255) cTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTg > 3:39805/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCgg > 2:79504/1‑149 (MQ=255) agcagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGGGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGcc < 8:63507/149‑1 (MQ=255) gcagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCa < 5:268104/107‑1 (MQ=255) gcagcTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCa > 6:268104/1‑107 (MQ=255) ataaaGGGCTTCGAGGCGGGTGTGGACCTGCTGGGCGAAGCCATCGACCTGCGCCTGCGAATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGt < 4:248246/146‑1 (MQ=255) tCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTc > 8:159689/1‑149 (MQ=255) aaGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGa > 7:275360/1‑149 (MQ=255) aaGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACACGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGa > 7:270363/1‑149 (MQ=255) gggCATCGAGGCCGGTGTGGCCCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGCCTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGAt > 6:110944/1‑148 (MQ=255) gggCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGAt > 7:333867/1‑148 (MQ=255) cATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCTGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTAcc < 1:79504/149‑1 (MQ=255) aTCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCt > 8:102010/1‑149 (MQ=255) tCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTg < 5:380628/149‑1 (MQ=255) tCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTg < 6:67266/149‑1 (MQ=255) tCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTg < 4:39805/149‑1 (MQ=255) cGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtc < 8:337168/58‑1 (MQ=255) cGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCAtc > 7:337168/1‑58 (MQ=255) cGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGCGTCCTGGGCCTGCGCCTGCGGGGTGCGGCACAAGACGATTACCAgg > 6:186175/1‑149 (MQ=255) cGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGccc > 4:208307/1‑148 (MQ=255) tggcgctgGTCGATGGCTTCGACCAGCACCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTc > 2:168583/5‑149 (MQ=255) aCCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGt < 4:349808/113‑1 (MQ=255) aCCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGt > 3:349808/1‑113 (MQ=255) aCCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTc > 6:319210/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTc > 4:211802/1‑148 (MQ=255) gcgctgGTCGATGGCTTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTgg > 1:353335/3‑109 (MQ=255) atgctgGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATGCTCATCGTCGGTGTCTTCGATGGCGACGGTGCCACCGCCAGCACGGTCGGTGTGCTGGGCCTGAGCCTGCTGGGTGCTGCCGATGTCGATTACCTGGTTCCCAACCGCTTCGa < 4:337496/148‑1 (MQ=255) gctgGTCGATGGCTTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGt < 2:237318/132‑1 (MQ=255) gctgGTCGATGGCTTCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGt > 1:237318/1‑132 (MQ=255) tggagttaGCCATCCACCAGGGCAAGCGCATCCTCATCTTCGGCGACGTCGAGGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGTCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTAt < 8:247034/142‑1 (MQ=255) tgGTCGAAGGCAGCGACCAGCGCCAGGGCATCCTCATCGTGGGCGACTTCGATGCCGAGGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCGGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTAt < 5:186175/149‑1 (MQ=255) gTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTCCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTAt < 3:262103/147‑1 (MQ=255) gAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGCCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCt < 6:304829/148‑1 (MQ=255) gCCATCGATCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACgg > 2:296316/1‑149 (MQ=255) gCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACgg > 6:109640/1‑149 (MQ=255) ccATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGGc < 5:13967/149‑1 (MQ=255) | TGGGTAACCTGCCACCCTTGCTGACCCGCCTTTACGCCGCGCGCGGCGTGCAGAGCGAGGCCGAGCTGGACAAGAGCCTGGCACGCCTGCTGCCCTACCAGCAGCTCAAGGGCATCGAGGCCGGTGTGGACCTGCTGGTCGAAGCCATCGACCAGCGCCAGCGCATCCTCATCGTCGGCGACTTCGATGCCGACGGTGCCACCGCCAGCACCGTCGGGGTGCTGGGCCTGCGCCTGCTGGGTGCGGCCCATGTCGATTACCTGGTGCCCAACCGCTTCGAGTATGGCTACGGC > NC_002947/1681525‑1681817 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |