| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,963,789 | A→T | 7.7% | M1M (ATG→TTG) † | yegE → | phosphodiesterase domain‑containing diguanylate cyclase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,963,789 | 0 | A | T | 7.7% | 230.9 / 7.1 | 78 | M1M (ATG→TTG) † | yegE | phosphodiesterase domain‑containing diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/35); new base T (4/2); total (41/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.78e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.79e-01 | |||||||||||
TGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTCATCGCCGTCGTGGTCC > NC_002947/1963643‑1963930 | tgGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGAt < 6:110573/148‑1 (MQ=255) ggAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATgg < 5:73589/148‑1 (MQ=255) gCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCaaa > 3:252672/1‑149 (MQ=255) ttGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTACACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGGATACGCTGTACAGATTCCCCGATTCGTTGTCATAAGGATGCCCTCCGCTGCGATGGGATATGGcgt > 2:320246/1‑147 (MQ=18) ggatggcacGGGCTTCGCCCGTGTCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCt > 4:303331/7‑149 (MQ=38) gcgAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCtg > 6:329542/1‑149 (MQ=255) tggcacGGGCTTCGCCCGTGTCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCtgtg < 3:303331/146‑1 (MQ=38) gAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCtgtg < 8:201199/149‑1 (MQ=255) aaCACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGc < 5:106282/149‑1 (MQ=255) aaCACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGc < 1:214332/149‑1 (MQ=255) cacGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCtt < 6:254733/149‑1 (MQ=255) cacGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGAGGTGTCTTATTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCtt > 2:5239/1‑149 (MQ=255) cacGGGCGAAGCCCGTGCAATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCtt < 1:58805/149‑1 (MQ=255) acGGGCGAAGACCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTAGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCACCGCATACCCTGTACAAATTACCCGAATCATTGTAATAAAAATCCCCACCACATCGATGGCAAAATGCCAACGAAGTGCTTg > 6:47778/1‑149 (MQ=21) gggCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTc > 6:354720/1‑149 (MQ=255) gggCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTc > 3:325194/1‑149 (MQ=255) gggCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAAAAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTc > 1:298466/1‑149 (MQ=255) gAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTggg < 7:114742/149‑1 (MQ=255) aaGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGt > 8:101624/1‑149 (MQ=255) aaGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGt < 3:369110/149‑1 (MQ=255) aaGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGt < 2:373639/149‑1 (MQ=255) ccATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTAc < 4:252672/148‑1 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTTCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGt > 1:246993/1‑139 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGt < 2:246993/138‑1 (MQ=255) cACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCtt < 7:101624/148‑1 (MQ=255) gtgtCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGctc < 6:91194/149‑1 (MQ=255) tgtCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGctct > 5:214344/1‑149 (MQ=255) tcttctTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCtgt < 4:50969/149‑1 (MQ=255) ttcttcGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGTTTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGACTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGa > 1:74815/1‑149 (MQ=255) ttcttcGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGctc > 2:142848/1‑144 (MQ=255) ttcttcGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGctc > 5:78296/1‑144 (MQ=255) ttcttcGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGctc < 6:78296/144‑1 (MQ=255) ttcttcGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGctc < 1:142848/144‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACt < 5:285138/149‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACt > 3:84683/1‑149 (MQ=255) gTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTcc < 6:214344/149‑1 (MQ=255) gTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTc > 1:322725/1‑148 (MQ=255) tAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCa < 4:84683/149‑1 (MQ=255) aaCCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATg < 2:322725/149‑1 (MQ=255) cccGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGc > 8:94710/1‑118 (MQ=255) cccGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCACGaa < 5:354720/149‑1 (MQ=255) cccGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGAACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCAGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCGGTGACAGGGACTCCATg > 8:72521/1‑147 (MQ=255) gC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGTTGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATg < 6:19494/144‑1 (MQ=255) gC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGTTGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATg > 5:19494/1‑144 (MQ=255) tACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATc > 3:170961/1‑149 (MQ=255) aCAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATc > 8:219254/1‑148 (MQ=255) cAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATc < 4:179421/147‑1 (MQ=255) aaTAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGca > 3:371295/1‑149 (MQ=255) cAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTc > 3:83897/1‑148 (MQ=255) cAGCGCATACGCTGTACAAATTCACCGATTCCTTGTCATAAAAATCACCTCCACAGCGATAGCAAATGGCCTAAGCTGTGATTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTATGTGACAGGGACTCAATGAAGGGACAACGCACACTc > 8:235198/1‑148 (MQ=255) 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aaTTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCg < 3:303565/149‑1 (MQ=255) aaTTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCg < 7:219254/149‑1 (MQ=255) ccGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCa > 7:261103/1‑149 (MQ=255) tCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTgg > 3:222933/1‑149 (MQ=255) ttGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGAATCCCCTGGCCt > 6:88694/1‑149 (MQ=255) gTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCt < 2:109533/147‑1 (MQ=255) tCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTc < 4:222933/149‑1 (MQ=255) cATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTCa > 2:244687/1‑149 (MQ=255) aTAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTCAt > 3:166935/1‑149 (MQ=255) cTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGCAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTCATCGCCGTCGTgg > 5:112623/1‑149 (MQ=255) cTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTCATCGCCGTCGTgg < 2:231021/149‑1 (MQ=255) cTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCGCTGTGCCAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCAAACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTCATCGCCGTCGTgg > 5:117774/1‑149 (MQ=255) cTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGGCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTCATCGCCGTCGTgg < 8:336856/149‑1 (MQ=255) aagcacaGCGTAGGCCATTTGCCATCGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTCATCGCCGTCGTgg > 4:122000/4‑149 (MQ=255) aagcacaGCGTAGGCCATTTGCCATCGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTCATCGCCGTCGTgg > 1:332231/4‑149 (MQ=255) cacaGCGTAGGCCATTTGCCATCGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGc > 2:109910/1‑128 (MQ=255) cacaGCGTAGGCCATTTGCCATCGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGc < 1:109910/128‑1 (MQ=255) cacaGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATATGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGAACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTCATCGCCGTCGTGGTcc > 1:153216/1‑149 (MQ=255) | TGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTCTTCTTCGCGGGTAAACCCGC‑TCCTACAATAGCCAGCGCATACGCTGTACAAATTCCCCGATTCCTTGTCATAAAAATCCCCTCCACAGCGATGGCAAATGGCCTACGCTGTGCTTGTCTGGGTCGATTTACGCCTTATCTGCTCTGTGACAGGGACTCCATGAAGGGACATCGCACACTCGAAGCGCCAAAGTTGCTCGGCATCACCTGGCCTTTCATCGCCGTCGTGGTCC > NC_002947/1963643‑1963930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |