| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,039,004 | A→G | 6.7% | L159S (TTG→TCG) | rffE ← | UDP‑N‑acetylglucosamine‑2‑epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,039,004 | 0 | A | G | 6.7% | 215.4 / 3.5 | 73 | L159S (TTG→TCG) | rffE | UDP‑N‑acetylglucosamine‑2‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/32); new base G (3/2); total (39/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
CCGGCGCTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGCTGGTA > NC_002947/2038859‑2039152 | ccGGCGCTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCaa > 2:230516/1‑147 (MQ=255) cGGCGCTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAg < 5:352271/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAgg < 1:330454/149‑1 (MQ=255) gcTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTg > 6:276452/1‑149 (MQ=255) cTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGt < 4:245809/149‑1 (MQ=255) tCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTc > 8:77229/1‑149 (MQ=255) ggCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTc < 3:171401/147‑1 (MQ=255) ggCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTc < 5:276452/147‑1 (MQ=255) aGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGt > 6:139531/1‑149 (MQ=255) aGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGCGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTCGTGAAGATGTGCGCCGGCTCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGACGCGCGAGGt > 8:86740/1‑149 (MQ=255) ggTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCGACAACCTGTTGCGCGaaggc < 3:90176/149‑5 (MQ=255) gTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTgg < 2:88491/149‑1 (MQ=255) gTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTgg < 8:292775/149‑1 (MQ=255) gAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTCGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTgg < 5:172110/149‑1 (MQ=255) tggctggcGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGgcgc < 4:158126/149‑1 (MQ=255) tggcGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAg > 7:292578/1‑149 (MQ=255) gcGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAATATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAg < 7:345762/147‑1 (MQ=255) gcGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAg < 5:141320/147‑1 (MQ=255) gcGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTg > 1:116072/1‑149 (MQ=255) aaCGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAgc > 1:331936/1‑149 (MQ=255) aCGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGATGTGCAgcg > 8:150590/1‑149 (MQ=255) cTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGc > 4:168026/1‑147 (MQ=255) cAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAgg < 8:283653/148‑1 (MQ=255) cAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAgg < 7:246748/148‑1 (MQ=255) cAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAg < 5:139531/147‑1 (MQ=255) cgGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCg > 6:184335/1‑149 (MQ=255) gggCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGt < 2:43558/149‑1 (MQ=255) ggCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTc < 5:184335/149‑1 (MQ=255) cTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAg < 7:77229/149‑1 (MQ=255) tttGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAgg > 2:131098/1‑149 (MQ=255) cAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGACGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑Gcc > 1:215821/1‑149 (MQ=255) aGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACCGTGTTACCGGTGGTCAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGATGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCCGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCg > 1:154079/1‑149 (MQ=255) gCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGCGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCgg > 2:113134/1‑149 (MQ=255) cTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGt > 5:158337/1‑149 (MQ=255) gCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCct > 6:165591/1‑149 (MQ=255) tCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCTGTCAGGC‑GCCGGTTGCcttc > 4:95918/1‑149 (MQ=255) ccACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCcttct > 6:240727/1‑149 (MQ=255) cACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCcttctt < 5:240727/149‑1 (MQ=255) aCCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCttcttc < 3:240533/149‑1 (MQ=255) ccAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGt < 4:282520/102‑1 (MQ=255) ccAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGt > 3:282520/1‑102 (MQ=255) cAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTTAAGATGTGCTCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGTTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAgg > 4:236699/1‑149 (MQ=255) cAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAgg < 2:116072/149‑1 (MQ=255) gCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGcc > 6:716/1‑131 (MQ=255) gCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGcc < 5:716/131‑1 (MQ=255) gCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTg > 8:145333/1‑148 (MQ=255) cGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGaa < 8:292578/149‑1 (MQ=255) tCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGACCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATa > 5:183936/1‑149 (MQ=255) aTCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAg < 1:230516/149‑1 (MQ=255) aCGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGgtt > 1:142001/1‑149 (MQ=255) tgtTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGttgttg < 5:350667/149‑1 (MQ=255) gtACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGt < 8:317171/148‑1 (MQ=255) aCCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTgc > 1:205241/1‑149 (MQ=255) aCCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCATTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTgc > 6:356839/1‑149 (MQ=255) ggtggtGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTgcg > 6:157845/1‑147 (MQ=255) tggtgAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAgg > 6:221570/1‑149 (MQ=255) tgAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCg > 3:147352/1‑149 (MQ=255) tgtgCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTc < 2:142001/148‑1 (MQ=255) cgcCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACAt < 3:168026/149‑1 (MQ=255) gcCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATg > 8:350683/1‑149 (MQ=255) cGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATggg > 1:105298/1‑149 (MQ=255) cGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATggg < 1:67792/149‑1 (MQ=255) ccTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCAGGTCATGA‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGAt > 7:17464/1‑149 (MQ=255) acctCGCGCGACAACCTGTTGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGgc > 2:348109/4‑73 (MQ=25) acctCGCGCGACAACCTGTTGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGgc < 1:348109/70‑1 (MQ=25) cTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATgg > 6:78863/1‑137 (MQ=255) cTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATgg < 5:78863/137‑1 (MQ=255) ttCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGAttt > 8:220702/1‑149 (MQ=255) ctCGCGCGACAACCTGTTGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGAttt > 5:208584/2‑149 (MQ=255) ctCGCGCGACAACCTGTTGCGCGAGCTCGCAGTCGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGCTCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTCAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGAttt > 8:65678/2‑149 (MQ=255) cgcgCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGTCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGc > 1:50511/1‑149 (MQ=255) gcAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTtggtgg < 2:105298/149‑1 (MQ=255) gcAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGCTgg < 5:221570/149‑1 (MQ=255) gcAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGCTgg > 5:243146/1‑149 (MQ=255) aaCAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGCGGACGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGCTgg > 1:302483/1‑148 (MQ=255) aaCAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGTGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGCTGgta < 6:183936/149‑1 (MQ=255) aaCAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATCGGCAATGGGGATTTGCtcg > 5:228930/1‑145 (MQ=255) | CCGGCGCTCGGCTGCCAGGTAGCTGAAGTGGCTGGCGAAACGGGCCTTCAGCGCGGGGCTTTGCAGCTTTTGCTCCACCTCCAGCAAGGCGTCGATCACGGTGTTACCGGTGGTGAAGATGTGCGCCGGATCGGTGCCTTCGCGCAACAGGTTGTCGCGCGAGGTGGCAGTGGGCGCGAAGTGCAGCGCGGCAAGGGCCCCGGTCAGGC‑GCCGGTTGCCTTCTTCGGGCCAGGGTGAATACAGGTTGTTGGTGCGCAGGCCGGCTTCTACATGGGCAATGGGGATTTGCTGGTA > NC_002947/2038859‑2039152 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |