Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,284,012 | A→G | 5.4% | Q71R (CAG→CGG) | ppnK → | inorganic polyphosphate/ATP‑NAD kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,284,012 | 0 | A | G | 5.4% | 222.0 / 2.0 | 74 | Q71R (CAG→CGG) | ppnK | inorganic polyphosphate/ATP‑NAD kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/32); new base G (2/2); total (40/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 |
AATTTCGCAATATCGGTATCATCGGTCGCCTTGGCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTGGCAACCTGGGTTTTCTCACC > NC_002947/2283865‑2284160 | aaTTTCGCAATATCGGTATCATCGGTCGCCTTGGCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAg < 1:194198/149‑1 (MQ=255) tttCGCAATATCGGTATCATCGGTCGCCTTGGCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGAc > 2:222478/1‑149 (MQ=255) gCAATATCGGTATCATCGGTCGCCTTGGCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCGGACGTc > 3:178128/1‑148 (MQ=255) gCAATATCGGTATCATCGGTCGCCTTGGCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCGGACGTc > 3:184111/1‑148 (MQ=255) gCAATATCGCTCTCATCCGTCGCCCTGGCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAACTTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGAGCCTCGAGGACACCATTGCCGCAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGAc < 4:77510/145‑1 (MQ=255) atatCGGTATCATCGGTCGCCTTGGCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCAcc > 5:229169/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGa < 5:319017/148‑1 (MQ=255) cTTGGCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGt > 4:341168/1‑149 (MQ=255) ttGGCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTc > 5:62756/1‑149 (MQ=255) gCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGc > 7:6526/1‑149 (MQ=255) aGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCGGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGa < 4:184111/149‑1 (MQ=255) aGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCGGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGa < 4:178128/149‑1 (MQ=255) cTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGAcc < 4:140813/149‑1 (MQ=255) tCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTg > 1:367148/1‑149 (MQ=255) gACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCt < 5:263967/137‑1 (MQ=255) gACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCt > 6:263967/1‑137 (MQ=255) gACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGt > 7:281919/1‑149 (MQ=255) gACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGt > 4:206332/1‑149 (MQ=255) acacCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTc < 6:162668/149‑1 (MQ=255) acCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTcgg > 6:370084/1‑149 (MQ=255) cATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGCcagcg > 4:259311/1‑149 (MQ=255) cATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGACATCGTGGTcggcg > 5:5710/1‑149 (MQ=255) gCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGAt < 2:205257/149‑1 (MQ=255) gCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGAt > 4:284711/1‑149 (MQ=255) gCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGAt > 2:321684/1‑149 (MQ=255) tGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGc > 1:190543/1‑149 (MQ=255) tGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGc > 8:46092/1‑149 (MQ=255) aaaaaTTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCctg < 7:199786/149‑1 (MQ=255) aaaTTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCctgct < 2:190543/149‑1 (MQ=255) aaaTTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCctgct < 2:367148/149‑1 (MQ=255) ttCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCctgctgcg > 1:137138/1‑147 (MQ=255) ctcGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGtgctgc < 5:252021/149‑1 (MQ=255) ctcGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGtg > 4:139373/1‑145 (MQ=255) ctcGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGtg < 3:139373/145‑1 (MQ=255) ctcGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCCACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGtgctgc > 7:81107/1‑149 (MQ=255) aTCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCcgc > 1:278683/1‑149 (MQ=255) gCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCcgcgc < 3:341168/148‑1 (MQ=255) cACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTTCTGGGTGCTGCCCGCGCGCt > 1:336766/1‑149 (MQ=255) cACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGccc < 4:330932/148‑1 (MQ=255) cACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGcc < 2:278683/147‑1 (MQ=255) cGTGATCCTCGATGACACCATTGCCGTAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGc < 5:184132/149‑1 (MQ=255) cgatCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCacaac < 4:146176/146‑1 (MQ=255) cTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACAt > 4:326227/1‑149 (MQ=255) tCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACAtt > 7:103413/1‑149 (MQ=255) tCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCAACGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCTCGCGCGCTGGCCCGGCACAACAtt > 4:246287/1‑149 (MQ=255) gAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTcc > 7:86994/1‑149 (MQ=255) ggACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCgg > 3:347504/1‑149 (MQ=255) ggACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCgg > 8:30843/1‑149 (MQ=255) ggACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTCGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCCGCCTGATGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCgg > 2:53616/1‑149 (MQ=255) acCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCt > 3:255168/1‑149 (MQ=255) acCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCATGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCt > 2:262777/1‑149 (MQ=255) cATTGGCGAAGTGCTGCTCGGCCAGGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGACATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCTCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTgg < 6:5710/149‑1 (MQ=255) cATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCacaa < 2:336104/135‑1 (MQ=255) cATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCacaa > 1:336104/1‑135 (MQ=255) cATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGATCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTgg > 5:221909/1‑149 (MQ=255) aTTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTggg < 6:62756/149‑1 (MQ=255) gCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTa < 3:326227/148‑1 (MQ=255) aaGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCcg < 2:207720/109‑1 (MQ=255) aaGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCcg > 1:207720/1‑109 (MQ=255) tgctgcCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTTCGGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCTCAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGt > 5:227364/1‑149 (MQ=255) tgctgcCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGt < 8:6526/149‑1 (MQ=255) tgctgcCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGt < 5:370084/149‑1 (MQ=255) gctgcCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTg < 2:137138/149‑1 (MQ=255) ctgtCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCAGCCGCAAGCTGCGTGGCGAGGTCTGCGACGTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGGTGGCCCGGGACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTg < 1:222522/148‑1 (MQ=255) ctgcCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTgg > 2:332424/1‑149 (MQ=255) ctgcCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTg < 1:222478/148‑1 (MQ=255) ctgcCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTg < 7:30843/148‑1 (MQ=255) cGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCacaaca < 4:366116/119‑1 (MQ=255) ccACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTGGCAACCTgg < 3:284711/149‑1 (MQ=255) cACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCACCCGTGGCAACCTggg > 6:300259/1‑149 (MQ=255) cGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCAGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGAAGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTTTCAACCGTGGCAACCTGGGtt > 5:220838/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCTCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTGGCAACCTGGGTTTtc < 3:246287/149‑1 (MQ=255) gCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTGGCAACCTGGGTTTTCTCa > 8:332400/1‑149 (MQ=255) cAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTGGCAACCTGGGTTTTCTCAc < 8:281919/149‑1 (MQ=255) aGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTGGCAACCTGGGTTTTCTCAcc < 1:321684/149‑1 (MQ=255) aGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTGGCAACCTGGGTTTTCTCAcc > 3:326093/1‑149 (MQ=255) | AATTTCGCAATATCGGTATCATCGGTCGCCTTGGCAGCTCGCAGGTGCTCGACACCATTCGCCGACTGAAAAAATTCCTCCTCGATCGCCACCTGCACGTGATCCTCGAGGACACCATTGCCGAAGTGCTGCCCGGCCACGGCTTGCAGACGTCCACCCGCAAGCTGCTGGGCGAGGTCTGCGACCTGGTCATCGTGGTCGGCGGCGATGGCAGCCTGCTGGGTGCTGCCCGCGCGCTGGCCCGGCACAACATTCCGGTGCTGGGTATCAACCGTGGCAACCTGGGTTTTCTCACC > NC_002947/2283865‑2284160 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |