| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 239,891 | G→A | 100% | W62* (TGG→TGA) | PP_0188 → | uroporphyrin‑III C‑methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 239,891 | 0 | G | A | 96.0% | 224.6 / ‑1.3 | 74 | W62* (TGG→TGA) | PP_0188 | uroporphyrin‑III C‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base A (36/35); total (38/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TCTTGTCCAATAACGATAAACCGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGGCAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGCCAGCCGCCAGCGAGCTAGAAGACC > NC_002947/239746‑240036 | tCTTGTCCAATAACGATAAACCGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACa < 4:318292/148‑1 (MQ=255)tCTTGTCCAATAACGATAAACCGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAg < 5:45659/149‑1 (MQ=255) gTCCAATAACGATAAACCGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGt < 7:251444/147‑1 (MQ=255) tCCAATAACGATAAACCGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTTGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCg > 5:105019/1‑149 (MQ=255) aTAACGATAAACCGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGGCAGGTGCGTCa > 3:118020/1‑148 (MQ=255) aTAACGATAAACCGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCaa > 2:168548/1‑149 (MQ=255) aaCGATAAACCGTCGGCGCAAGCGCCTGCGGAACCCCTTACCAACCCCACTGCCAAGCGCAACGGCAGTGGCCTGGCAGCCCTGGCCAT‑GGTGCGTGGTGCGGCCCGGGGTGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACACGTGCGTCAAc > 2:207638/1‑148 (MQ=255) ccaTAAACCGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGAGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGCGCGTCAACTGc > 7:317487/3‑149 (MQ=255) gATAAACCGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTACGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTTGCCTT‑GCTGCTTTGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTTACAGGTGGGTCAAATg > 6:261928/1‑147 (MQ=255) ttccgcaggCGCCTGCGCCGACGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAggg > 7:302819/8‑148 (MQ=255) aaCCGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTTATCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAgg < 1:114068/148‑1 (MQ=255) cGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGt > 3:56459/1‑149 (MQ=255) gTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGt > 4:116559/1‑148 (MQ=255) gTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGACCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGt > 1:109650/1‑148 (MQ=255) gcgcAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGtt < 1:207638/149‑1 (MQ=255) ccTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAggg < 5:261928/149‑1 (MQ=255) tGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGc > 1:155884/1‑148 (MQ=255) cGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCa < 2:109650/148‑1 (MQ=255) gAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGca < 1:168548/149‑1 (MQ=255) cccGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACAt > 3:1660/1‑149 (MQ=255) ccGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGGCAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATc < 4:118020/149‑1 (MQ=255) gTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCa > 2:153676/1‑134 (MQ=255) gTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCa < 1:153676/134‑1 (MQ=255) ccccaccTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCt > 5:318161/1‑148 (MQ=255) cccaccTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGa > 7:155864/1‑149 (MQ=255) ccaccTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGAc > 1:133254/1‑149 (MQ=255) ccaccTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGAc < 6:105019/149‑1 (MQ=255) caccTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGAcc < 5:89893/149‑1 (MQ=255) ccTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGAcc > 4:82310/1‑147 (MQ=255) cTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAg > 1:110118/1‑149 (MQ=255) tGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAg‑c > 6:265056/1‑149 (MQ=255) ccAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAg‑cgc < 2:133254/149‑1 (MQ=255) ccAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGGGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGGGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAg‑cgc > 2:237885/1‑149 (MQ=255) aaGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAg‑cgcgc < 3:82310/149‑1 (MQ=255) aaGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAg‑cgcgc > 1:62979/1‑149 (MQ=255) aaGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAg‑cgcgc > 2:265074/1‑149 (MQ=255) aaGCGCTCCGGCAGGGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGGGTCAg‑cgcct < 3:276879/149‑3 (MQ=255) cTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAgg < 3:185045/149‑1 (MQ=255) tCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGgc < 2:244085/149‑1 (MQ=255) tCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGgc > 5:331623/1‑149 (MQ=255) cGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGGCAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGgcgc > 7:28859/1‑149 (MQ=255) aGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTgca < 2:110118/149‑1 (MQ=255) aGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTgca < 8:30907/149‑1 (MQ=255) aGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTGGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTg > 1:28222/1‑147 (MQ=255) gCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGt < 2:62979/147‑1 (MQ=255) gCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTg < 6:331623/148‑1 (MQ=255) cgcTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGCGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAAcag > 4:222615/1‑149 (MQ=255) cTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCTAGCACATCGAGGCGCTGACACAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAAcagca > 8:335813/1‑149 (MQ=255) cTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAGCCGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAAcagc < 1:40174/149‑1 (MQ=255) gCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGAt < 5:265056/149‑1 (MQ=255) cTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGAt > 1:161613/1‑147 (MQ=255) cTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCa > 3:211272/1‑149 (MQ=255) gctTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTgcg > 7:43524/1‑148 (MQ=255) ctTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTAACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTgcg < 2:155884/147‑1 (MQ=255) gTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACt < 6:318161/148‑1 (MQ=255) gTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTg < 1:237885/149‑1 (MQ=255) cGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGc < 3:116559/148‑1 (MQ=255) cGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGc < 8:155864/148‑1 (MQ=255) cGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGc > 3:162248/1‑148 (MQ=255) cGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGc < 2:28222/148‑1 (MQ=255) gTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGCCAgccgc < 4:162248/149‑1 (MQ=255) gTAGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGCCAgccgc > 8:221268/1‑149 (MQ=255) aGGTGGCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGCCAgccgc > 1:106900/1‑147 (MQ=255) ggCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACAACGAGGCGCAGACCAAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGCCAGCCGCCAGCGa > 8:355246/1‑149 (MQ=255) gCTGGGGTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGCCAGCCGCCAGCGAg < 4:211272/149‑1 (MQ=255) ggggTGTCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGCCAGCCGCCAGCGAGCTa < 4:56459/149‑1 (MQ=255) gtgtCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGCCAGCCGCCAGCGAGCTagaa < 8:69507/149‑1 (MQ=255) gtCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGcc < 1:68598/128‑1 (MQ=255) gtCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGcc > 2:68598/1‑128 (MQ=255) tCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTgcagca < 3:163334/88‑1 (MQ=255) tCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTgcagca > 4:163334/1‑88 (MQ=255) tCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAAcag < 7:287515/98‑1 (MQ=255) tCTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAAcag > 8:287515/1‑98 (MQ=255) cTGACAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGCCAGCCGCCAGCGAGCTAGAAGAcc > 6:90683/1‑149 (MQ=255) | TCTTGTCCAATAACGATAAACCGTCGGCGCAGGCGCCTGCGGAACCCGTTACCACCCCACCTGCCAAGCGCTCCGGCAGTGGCCTGGCAGCGCTGGCCTT‑GCTGCTTGGTGCGGCCGGGGTGGCGGTAGGTGGCTGGGGTGTCTGGCAGGTGCGTCAACTGCAGGGCAGTGAGTTCAACCAGGGCCAGCACATCGAGGCGCTGACCCAG‑CGCGCCGAGGCGCTGCAGCAACGTGAACAGCAGATCAGTGCGCAACTGGCCAGTCTGCCAGCCGCCAGCGAGCTAGAAGACC > NC_002947/239746‑240036 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |