Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,628,386 | A→C | 5.3% | A16A (GCA→GCC) | clpP → | ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,628,386 | 0 | A | C | 5.3% | 270.0 / 3.0 | 88 | A16A (GCA→GCC) | clpP | ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/44); new base C (2/3); total (41/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 |
TAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGC > NC_002947/2628245‑2628525 | tAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGcc > 4:250268/1‑149 (MQ=255) aCGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTg > 5:251104/1‑149 (MQ=255) cGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCTgg < 7:196899/149‑1 (MQ=255) ggTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCTgga < 3:250268/149‑2 (MQ=255) gTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCCTGCGGCCTggat < 3:88676/149‑3 (MQ=255) gTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTc < 6:331033/149‑1 (MQ=255) gTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTc > 6:122766/1‑149 (MQ=255) gTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTc > 1:335014/1‑149 (MQ=255) tcttctCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTcc > 3:147903/1‑149 (MQ=255) tctcGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATg > 6:350565/1‑149 (MQ=255) acttAGTAAACGTCAACACGCCAGCCTTCGTGCTGGCTTTTGCTTATTCAAGCCATTACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACTTGTCCGGCATTTC‑TATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATg < 7:333363/143‑1 (MQ=255) gTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTa > 8:108475/1‑149 (MQ=255) ggAAACCTCCACAAGGCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATc < 5:113322/148‑1 (MQ=255) ggAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCTATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATc < 1:323650/148‑1 (MQ=255) ggAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATc < 7:178432/148‑1 (MQ=255) aaaCCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGa < 3:135857/148‑1 (MQ=255) aCCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCa < 8:259151/149‑1 (MQ=255) ccTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCACGAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCa < 1:94175/149‑1 (MQ=255) cTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGGTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCG‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCCGGCGGCGTGGTCCGGATGGTTAGCGAGCAGt > 7:57332/1‑149 (MQ=255) cTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAATGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGt > 1:105037/1‑149 (MQ=255) cagccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTgg < 7:134764/149‑1 (MQ=255) cagccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTgg < 3:69676/149‑1 (MQ=255) agccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGc < 5:122766/149‑1 (MQ=255) gccTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGc > 1:23885/1‑148 (MQ=255) ttCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑Ac > 7:36928/1‑149 (MQ=255) gaaggCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGa‑a < 1:49931/143‑1 (MQ=255) aGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACgcgc < 7:14547/149‑1 (MQ=255) cTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCtt < 2:23885/149‑1 (MQ=255) tGGCTTGTGCTTATTCAAGCCATGAATATTTGGGAGGGAGCGCAGGACATGTCGCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGACGGAGGCGGCCTGTTCCCGAtt < 8:61368/114‑2 (MQ=255) tGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATg > 7:61368/1‑114 (MQ=255) tGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTa > 4:212455/1‑149 (MQ=255) gCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTAc < 2:344170/148‑1 (MQ=255) ttGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTTACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGa > 7:15564/1‑148 (MQ=255) gtgCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCAGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTATGACATCCAGGCCGCAGGCGGACTTGTCACGAAGGTTATCGAGCACTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTAACGACAt > 1:186907/1‑149 (MQ=255) tgCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACAt < 5:350565/148‑1 (MQ=255) tgCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATc > 2:38633/1‑149 (MQ=255) aTTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTc > 2:185511/1‑149 (MQ=255) tCAAGCCATGATTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTcgc > 5:149652/1‑149 (MQ=255) aaGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCgcgc > 2:296589/1‑149 (MQ=255) gCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCt < 3:38113/149‑1 (MQ=255) gCCATGACTATTTGGGAGGGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCt < 3:42768/149‑1 (MQ=255) ccATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTg < 3:212455/149‑1 (MQ=255) ccATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGAA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTg > 1:288967/1‑149 (MQ=255) cATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGt < 1:38633/149‑1 (MQ=255) tGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTgat > 5:175961/1‑146 (MQ=255) cTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGaa < 7:108475/148‑1 (MQ=255) cTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAg < 1:185511/149‑1 (MQ=255) tATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTAc > 6:31083/1‑124 (MQ=255) tATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTAc < 5:31083/124‑1 (MQ=255) tATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAg > 6:360200/1‑148 (MQ=255) tATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTGGAAg > 7:161356/1‑148 (MQ=255) gAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCgtgt < 1:199131/149‑1 (MQ=255) tGAGCGCAGGACATGTCCCGCAAGTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGAt > 2:346108/1‑149 (MQ=255) gAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATc > 4:37540/1‑149 (MQ=255) aGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCt < 4:147903/149‑1 (MQ=255) gcAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTcc > 8:214062/1‑149 (MQ=255) 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tCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGcc < 7:214062/148‑1 (MQ=255) cccGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGtt > 8:122388/1‑118 (MQ=255) cccGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGtt < 7:122388/118‑1 (MQ=255) ccGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGGAGGCGGCCTTGTCCGGATGGTTATCGAGCAGTCCTCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGAGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCggg < 2:186907/149‑1 (MQ=255) cGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTa > 4:167637/1‑95 (MQ=255) cGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTa < 3:167637/95‑1 (MQ=255) 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a‑gagCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGGCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAAc < 5:53548/149‑1 (MQ=255) agCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCATGTAGTCCTCTACTGGGCCAAcca < 6:54472/149‑2 (MQ=255) ctctGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCtcg > 4:214822/1‑149 (MQ=255) aCATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGAGTCGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTcgtcgt > 1:108654/1‑149 (MQ=255) aCATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCtcgtcg < 2:335014/147‑1 (MQ=255) aCATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCtcgtc < 1:276659/146‑1 (MQ=255) aCATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGtt > 2:363024/1‑149 (MQ=255) aCATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGtt < 1:363024/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTa < 6:106544/63‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTa > 5:106544/1‑63 (MQ=255) cAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTgcgc > 4:342177/1‑148 (MQ=255) | TAACGGTCTTCTCTCGTAGGAAACCTCCACAAGCCAGCCTTCGAGCTGGCTTGTGCGTATTCAAGCCATGACTATTTGGGAGTGAGCGCAGGACATGTCCCGCAATTCTTATATTCAGCA‑GAGCTCTGACATCCAGGCCGCAGGCGGCCTGGTCCCGATGGTTATCGAGCAGTCCGCCCGTGGCGA‑ACGCGCTTACGACATCTACTCGCGCCTGTTGAAGGAGCGTGTGATCTTCCTGGTTGGCCCGGTAGAGGACTACATGGCCAACCTCGTCGTTGCGC > NC_002947/2628245‑2628525 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |