Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,736,355 | G→C | 7.4% | G1085R (GGC→CGC) | PP_2394 → | leucine‑rich repeat‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,736,355 | 0 | G | C | 7.4% | 231.8 / 3.0 | 75 | G1085R (GGC→CGC) | PP_2394 | leucine‑rich repeat‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/33); new base C (3/3); total (39/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGTTCCGGATGAGTTTCTGCGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACACCCAGATGCCCGGGTTTCCCTACGG > NC_002947/2736207‑2736503 | cGTTCCGGATGAGTTTCTGCGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAg < 1:352760/149‑1 (MQ=255) gTTCCGGATGAGTTTCTGCGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAgg > 7:149044/1‑149 (MQ=255) gTTCCGGATGAGTTTCTGCGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACAAGATCACGCTCGACCAAgg > 7:204215/1‑149 (MQ=255) gATGAGTTTCTGCGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAgga > 4:97461/1‑148 (MQ=255) aTGAGTTTCTGCGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCg > 1:289948/1‑149 (MQ=255) gTTTCTGCGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGTAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTg < 1:244984/148‑1 (MQ=255) gTTTCTGCGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTg < 5:32729/148‑1 (MQ=255) cTGCGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTcc < 2:89162/148‑1 (MQ=255) tGCGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTg > 3:237747/1‑149 (MQ=255) cGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTgg < 1:156320/148‑1 (MQ=255) gggCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTgg > 7:14303/1‑147 (MQ=255) gTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGAtt < 2:2907/149‑1 (MQ=255) gTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGAtt > 2:319695/1‑149 (MQ=255) tCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCATTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGc < 6:369268/148‑1 (MQ=255) cccAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGa < 6:334802/143‑1 (MQ=255) cccAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGa > 5:334802/1‑143 (MQ=255) cccAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGcgg > 4:107614/1‑147 (MQ=255) cccAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGCTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCGAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCg > 2:801/1‑149 (MQ=255) aCTTGCGCAACCTGGAAATAACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTcc < 8:197989/149‑1 (MQ=255) ttGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGt > 8:271902/1‑145 (MQ=255) ttGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGt < 7:271902/145‑1 (MQ=255) gcgcAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCt < 6:33942/147‑1 (MQ=255) cgcAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTgg < 2:332265/148‑1 (MQ=255) gcAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGc < 2:317254/137‑1 (MQ=255) gcAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGc > 1:317254/1‑137 (MQ=255) gcAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAACGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGgtg > 6:20397/1‑149 (MQ=255) cAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGgtgt < 8:173913/149‑1 (MQ=255) aaCCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTa > 4:27603/1‑149 (MQ=255) aaaTCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑c < 8:149044/149‑1 (MQ=255) aCCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTAGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTAGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGATCGTCCTGCCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTATc > 6:367326/1‑149 (MQ=255) cccATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCg > 3:75329/1‑149 (MQ=255) cccATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCg < 4:75329/149‑1 (MQ=255) caaaTTGCCCACTCACGCGTTTGACATTGCCTTTGATCCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCAGGTAACCAGAAAACGCTCGACCAAGGCCAGGCCTTGGTCATGGCAGATAGCCGGTCCCTGGTTTAACTTAA‑A‑‑CTTACg > 6:215868/4‑149 (MQ=255) gCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACaa < 1:148227/148‑1 (MQ=255) gCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACaa < 5:111946/148‑1 (MQ=255) gCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCATTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACaa < 7:325238/148‑1 (MQ=255) ccGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAAc < 4:237747/148‑1 (MQ=255) gTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGCA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAgg < 1:198163/149‑1 (MQ=255) tttGCGATTGCCTTTGCTGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTCGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAggg < 6:111895/149‑1 (MQ=255) tttGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAggg > 5:140387/1‑149 (MQ=255) ccATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCAtt > 6:58831/1‑149 (MQ=255) cATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAGCCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCAttt > 5:298468/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCg > 4:5704/1‑149 (MQ=255) cTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGt > 5:91499/1‑148 (MQ=255) tttGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTc > 8:166455/1‑148 (MQ=255) tttGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCAGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTc > 7:197703/1‑148 (MQ=255) tgttGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTATCGTGATCACGCTCGACAAAGGCCTGGGGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTGCCTGGTGTACCTGTA‑C‑‑CTTTCGGAGAACCCGTTGCGCAGGGCTTTTTCCGTcct < 5:367326/145‑2 (MQ=255) aTGCTTGCCCAGAAGCTGGAGTTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGc < 5:358744/149‑1 (MQ=255) cTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCaa < 3:5704/148‑1 (MQ=255) ttGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑CCACGATCGGACAACCAGTTGCGCAGGGCATTTTCGGTCCAGGaaa > 1:316354/1‑149 (MQ=255) ttGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAAt > 2:349394/1‑148 (MQ=255) ttGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATg > 5:212634/1‑149 (MQ=255) cccAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGAc < 5:20397/148‑1 (MQ=255) cTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGaa < 6:212634/149‑1 (MQ=255) cTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCACTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCTTACTGGCAATGACCGAACTGaa > 8:323374/1‑149 (MQ=255) gAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCATGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAAt < 1:51190/147‑1 (MQ=255) gAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATg < 3:27603/148‑1 (MQ=255) gAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAACGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAATC‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAAt < 1:298422/148‑1 (MQ=255) aCTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTgg > 1:256069/1‑56 (MQ=255) aCTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTgg < 2:256069/56‑1 (MQ=255) cTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAACGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCctct < 7:269719/148‑1 (MQ=255) aCTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTg > 7:204623/1‑149 (MQ=255) ttGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGt > 1:285119/1‑148 (MQ=255) gTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACAcc < 3:107614/149‑1 (MQ=255) aaCCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCGTCTACCTGTCCAACAcc > 6:103394/1‑147 (MQ=255) ccAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACAcc > 7:221668/1‑145 (MQ=255) cAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCGGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACACCCAGAt > 1:265780/1‑149 (MQ=255) cAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGtt < 8:131823/83‑1 (MQ=255) cAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGtt > 7:131823/1‑83 (MQ=255) aTCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACAccc > 3:217484/1‑142 (MQ=255) aTCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACAccc < 4:217484/142‑1 (MQ=255) aCGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACACCCAGATGCCCg < 5:58831/148‑1 (MQ=255) gCTCGACCAAGTCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACACCCAGATGCCCGGGt > 3:362786/1‑149 (MQ=255) gCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACACCCAGATGCCCGGGt > 1:285345/1‑149 (MQ=255) ccaggACCAACGCCTGGCCTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACACCCAGATGCCCGGGt > 6:92868/5‑149 (MQ=255) caggACCAACGCCTGGCCTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTc > 6:47437/4‑93 (MQ=39) caggACCAACGCCTGGCCTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTc < 5:47437/90‑1 (MQ=39) aGGCCAGGCGTTGGTCCTCGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGATGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACACCCAGATGCCCGGGTTTCCCTACg > 6:17014/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACACCCAGATGCCCGGGTTTCCCTACgg < 6:91499/149‑1 (MQ=255) | CGTTCCGGATGAGTTTCTGCGGGCGTTTCCCAACTTGCGCAACCTGGAAATCACCCATTGCCGACTCACGCGTTTGCCATTGCCTTTGATGCTTGCCCAGAAGCTGGAGGTACTCGACTTGTCCGGTAACCAGATCACGCTCGACCAAGGCCAGGCGTTGGTCCTGGCAGATTGCCGGTCCCTGGTGTACCTGAA‑C‑‑CTTTCGGACAACCCGTTGCGCAGGGCATTTTCCGTCCAGGCAATGACCGAACTGAATGCCCTCTACCTGTCAAACACCCAGATGCCCGGGTTTCCCTACGG > NC_002947/2736207‑2736503 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |