Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,749,958 | C→G | 6.1% | E178Q (GAG→CAG) ‡ | PP_2406 ← | quinate/shikimate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,749,958 | 0 | C | G | 6.1% | 216.4 / 3.8 | 66 | E178Q (GAG→CAG) ‡ | PP_2406 | quinate/shikimate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/31); new base G (2/2); total (33/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.31e-01 |
TCTCTGCCACCCACAGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATGGGCCACGGCCGAGCCAGCGCCACCGGCACCCATCTGCACCACC > NC_002947/2749814‑2750103 | tctcTGCCACCCACAGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCcgcg > 6:190882/1‑149 (MQ=255) ctctGCCACCCACAGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCgcgc > 5:162667/1‑149 (MQ=255) tctGCCACCCACAGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCCCCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGcc > 6:313571/1‑149 (MQ=255) tGCCACCCACAGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCg > 7:180938/1‑148 (MQ=255) cccacAGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATgg < 2:109372/149‑1 (MQ=255) cccacAGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATgg < 4:148310/149‑1 (MQ=255) ccacAGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGGAGCGCGCCgtgcttgg < 8:972/149‑8 (MQ=255) cacaGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGGTGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGgt < 5:336308/149‑1 (MQ=255) acaGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGgtg > 6:148525/1‑149 (MQ=255) acaGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGgtg > 2:468/1‑149 (MQ=255) aGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGtt > 7:15029/1‑149 (MQ=255) gggATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGt > 5:74306/1‑149 (MQ=255) ggATGCAACAACTCCACCTTCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGtt < 2:155372/149‑1 (MQ=255) tGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGt < 8:15029/148‑1 (MQ=255) gCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCACCGAAATGGGTGtt < 1:160810/139‑1 (MQ=255) gCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCACCGAAATGGGTGtt > 2:160810/1‑139 (MQ=255) caacaaCTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTcc < 6:384534/148‑1 (MQ=255) aacaacTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATgg < 5:377290/132‑1 (MQ=255) aacaacTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATgg > 8:288685/1‑132 (MQ=255) aacaacTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATgg > 6:377290/1‑132 (MQ=255) aacaacTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATgg < 7:288685/132‑1 (MQ=255) aacaacTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTccac > 5:311262/1‑149 (MQ=255) tCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGc > 6:19415/1‑149 (MQ=255) cACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCACCGCCt > 5:111242/1‑149 (MQ=255) cACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGc < 1:468/147‑1 (MQ=255) cACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCt < 8:180938/149‑1 (MQ=255) gTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACgg < 5:190882/149‑1 (MQ=255) gCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTc < 5:313571/149‑1 (MQ=255) ccGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATcc < 8:4361/149‑1 (MQ=255) cGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCa > 5:152803/1‑149 (MQ=255) tAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACtt < 3:177609/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCg > 7:45035/1‑148 (MQ=255) ggCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGaa < 4:283768/147‑1 (MQ=255) tGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCAcc < 6:162667/149‑1 (MQ=255) ccACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGc < 7:141599/112‑1 (MQ=255) ccACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGc > 8:141599/1‑112 (MQ=255) cACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGcc < 6:311262/149‑1 (MQ=255) cACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGcc > 4:137676/1‑149 (MQ=255) cGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGtt < 5:148525/149‑1 (MQ=255) ggCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCCCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTc < 2:340337/149‑1 (MQ=255) gtggtgTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTAc < 6:74306/149‑1 (MQ=255) gtggtgTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTAc < 5:110677/149‑1 (MQ=255) gtTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCtt > 7:260092/1‑149 (MQ=255) ttGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTc > 8:271871/1‑149 (MQ=255) gACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCa < 8:45035/148‑1 (MQ=255) aCCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGc > 6:82548/1‑110 (MQ=255) aCCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGc < 5:82548/110‑1 (MQ=255) ccAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCAccc < 5:19415/149‑1 (MQ=255) cAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCAGCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCca > 2:190901/1‑149 (MQ=255) cccGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCcagca < 8:260092/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCCCGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATgg > 7:320113/1‑149 (MQ=255) gCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCAc > 7:242649/1‑130 (MQ=255) gCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCAc < 8:242649/130‑1 (MQ=255) cAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATGGGCCACgg > 1:294128/1‑149 (MQ=255) gCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATGGGCCACGGcc > 2:96275/1‑147 (MQ=255) tgGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATGGGCCACGGCCGAGc > 7:274129/1‑147 (MQ=255) cAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATgg > 4:191744/1‑130 (MQ=255) cAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATgg < 3:191744/130‑1 (MQ=255) ccatttcGGCGCGGAGCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATGGGCCACGGCCGAGCCAGCGCCACCGGCAcc > 8:211201/7‑148 (MQ=255) aaGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAgg < 2:286953/112‑1 (MQ=255) aaGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAgg > 1:286953/1‑112 (MQ=255) tttcGGCGCGGAGCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATGGGCCACGGCCGa < 4:95907/124‑1 (MQ=255) tttcGGCGCGGAGCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATGGGCCACGGCCGa > 3:95907/4‑127 (MQ=255) cACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACAAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATGGGCCACGGCCGAGCCAGCGCCACCGGCACCCATCt > 4:287889/1‑149 (MQ=255) ggCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATGGGCCACGGCCGAGCCAGCGCCACCGGCACCCATCTGca > 6:70692/1‑149 (MQ=255) gcTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATGGGCCACGGCCGAGCCAGCGCCACCGGCACCCATCTGCaccacc < 1:96275/149‑1 (MQ=255) | TCTCTGCCACCCACAGGCGGGGATGCAACAACTCCACCGGCAGTGGCGTGCCCGGTAGCTTGGCCATGCCCACCGGCGTGGTGTTGACCAGCCCGTCCGCTTCGGCCAAGGCTGTGGCCAGGTCGGTGCCAAGCACGGCGCGCTCCGCGCCGAAATGGGTGTTCAGGTTGTCCACCAACGCCTGCGCACGGGTCGCATCCACTTCGAACAGCACCAGCCGTTCTACCCCTTCACCCAGCAGGGCATGGGCCACGGCCGAGCCAGCGCCACCGGCACCCATCTGCACCACC > NC_002947/2749814‑2750103 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |